| Project/Area Number |
22K06374
|
|---|
| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
|
| Allocation Type | Multi-year Fund |
|---|
| Section | 一般 |
|---|
| Review Section |
Basic Section 45030:Biodiversity and systematics-related
|
|---|
| Research Institution | Ehime University |
|---|
Principal Investigator |
上谷 浩一 愛媛大学, 農学研究科, 教授 (80638792)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2026-03-31
|
| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2024)
|
| Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
|
|---|
| Keywords | 東南アジア / 熱帯雨林 / 葉緑体ゲノム / 遺伝的多様性 / フタバガキ科 / 系統地理 / 葉緑体塩基配列 |
|---|
| Outline of Research at the Start |
本研究では，従来の短いDNA配列解析からは不明瞭であったフタバガキ科樹木の分布域形成の歴史を解明するために，これまでに採取したDNAサンプルを使って，フタバガキ科主要3種の葉緑体ゲノムの全塩基配列を決定する。そして，集団ゲノムデータを集団遺伝学的手法によって解析することで，遺伝的多様性の地理的分布を明らかにする。さらに，研究成果を自然集団の遺伝的多様性を考慮した保全に還元することで，生物多様性保全に関連する施策を支援する。
|
| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では，従来の短いDNA配列解析からは不明瞭であったフタバガキ科樹木の分布域形成の歴史を解明するために，フタバガキ科主要3種の葉緑体全ゲノムデータを解析することで，遺伝的多様性の地理的分布を明らかにする。これまでに，WGSによって、サンプルあたり約140億塩基対の塩基配列情報を得ることができ，これらを解析することによってフタバガキ科4種の葉緑体ゲノム全塩基配列を決定することができた。配列の長さは，150,802ー150,647bpであった。これらデータから地域間の遺伝的差異，分岐年代，そして種内変異が多く蓄積する葉緑体ゲノム領域を特定することができた。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
高品質のDNAを準備するのに予想以上に時間がかかったため，予定していたサンプル数次世代シーケンシング解析を翌年度にに繰り越すことになったため。
|
| Strategy for Future Research Activity |
フタバガキ科葉緑体ゲノム配列多様性を明らかにするために必要な残りのサンプルの次世代シー兼シング解析を完了させる。
|
