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局所的なRNAの量的制御による熱応答性核内構造体の形成維持機構と生理的意義の解析

Research Project

Project/Area Number 22K06578
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 47030:Pharmaceutical hygiene and biochemistry-related
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

小野口 玲菜  東京大学, アイソトープ総合センター, 特任助教 (30780697)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords熱ストレス応答 / 非コードRNA / 核内構造体 / 熱ストレス
Outline of Research at the Start

申請者は、長鎖非コードRNA, MALAT1が熱ストレスに応答して新規核内構造体 HiNoCo bodyを形成することを発見した。 HiNoCo bodyの形成は細胞の増殖に必須であるが、HiNoCo bodyがどのように形成・維持されるのかは十分明らかではない。本研究では、HiNoCo bodyの形成・維持機構およびHiNoCo body依存的な熱応答性遺伝子発現機構を解明することを目的とする。

Outline of Annual Research Achievements

申請者はこれまでに「通常は核スペックルと呼ばれる核内構造体に局在する非コードRNA, MALAT1が熱ストレスに応答して核スペックルから離脱し、新規核内構造体(Heat-inducible Noncoding RNA body; HiNoCo bodyと命名)を形成する」という新しい現象を発見している。本研究計画では長鎖非コードRNA, MALAT1が形成する熱ストレス応答性の核内構造体, HiNoCo bodyの形成・維持機構およびHiNoCo body依存的な熱応答性の遺伝子発現制御機構を解明することを目的としている。
申請者は, 転写阻害剤を添加することによりHiNoCo bodyの形成が阻害されることを見出した。また、これまでに特定のRNAと相互作用するゲノムDNA領域を網羅的に特定する手法, ChIRP-DNAseq法を用いて熱ストレス時にMALAT1と相互作用する標的ゲノムDNA領域を同定している。該当遺伝子の遺伝子発現について解析を行った結果、MALAT1/HiNoCo bodyが該当遺伝子の転写制御に関与する可能性を示唆する結果を得た。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初計画していた, 転写制御に関する実験の結果を得ることができたため。

Strategy for Future Research Activity

これまでに得られた結果を元に, MALAT1/HiNoCo bodyによる熱ストレス応答遺伝子の発現制御機構の詳細について解析していく予定である。

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2023 2022

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Techniques for Analyzing Genome-wide Expression of Non-coding RNA2023

    • Author(s)
      Rena Onoguchi-Mizutani, Kenzui Taniue, Kentaro Kawata, Toshimichi Yamada, Nobuyoshi Akimitsu
    • Journal Title

      Handbook of Epigenetics

      Volume: - Pages: 163-184

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ノンコーディングRNAが形成する新規核内構造体による熱ストレス応答の研究2023

    • Author(s)
      小野口 玲菜, 小野口 真広, 浜田 道昭, 秋光 信佳
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Heat shock stress response through HiNoCo-body, a novel noncoding RNA containing nuclear body2022

    • Author(s)
      Rena Onoguchi-Mizutani, Takeshi Kawamura, Nobuyoshi Akimitsu.
    • Organizer
      Cold Spring Harbor Asia “RNA Biology”
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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