Research Project
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
本研究課題では、ファージ尾部吸着分子をコードする遺伝子群の情報を基に、個々の遺伝子産物を発現・精製し、Clostridioides difficileに対する結合性を調べる。また、本分子の三次元構造解析により、C. difficileへの結合に重要な活性部位を明らかにする。次に、尾部吸着分子のC. difficileレセプター分子を同定し、ファージの宿主認識機構を解明する。得られた情報を基に、C. difficileに得意的なファージをスクリーニングし、CDI発症マウスモデルを用いたin vivo評価を行う。一連の結果を踏まえ、腸内微生物叢を撹乱しない新規CDI治療法の開発に発展させる。
Clostridioides （Clostridium）difficile感染症（CDI）は、C. difficileが原因で発症する難治性の下痢症・腸炎である。C. difficileは、抗菌薬の使用等により腸内の正常な細菌を構成する集団（フローラ）が乱れることで腸内で過剰に増殖する。CDIの治療において、抗菌薬の使用は有効であるが、再発を繰り返し治療が難渋することがある。そこで、原因となるC. difficileのみを特異的に殺菌する新規治療法の確立が急務である。研究代表者は、その治療候補の1つとしてバクテリオファージ（ファージ）に着目した。ファージは、自然界に普遍的に存在しており、宿主となる細菌に特異的に結合し溶菌活性を示す。本研究課題では、ファージの特性を利用したCDIの新規治療法の確立を目指し研究を行っている。昨年度においては、C. difficileに特異的に感染するファージのゲノム解析から、2つの推定宿主認識分子（尾部吸着分子）をスクリーニングし、これらを発現・精製（ORFA、ORFB）した。精製したORFAおよびORFBのC. difficile リボタイプ027株に対する結合を調べたところ、時間依存的および濃度依存的に結合したが、その結合性が不十分であると推察した。そこで、本年度は、Clostridium属菌の中でボツリヌス菌のファージに着目し、本ファージの尾部吸着分子について解析を進めた。既に、研究代表者は、ボツリヌス菌ファージについての研究経緯を有していることから、本ファージにおいても2つの推定尾部吸着分子（ORFX、ORFY）をコードする遺伝子を特定した。そこで、個別にORFXおよびORFYを発現・精製し、C型またはD型ボツリヌス菌に対する結合性を調べたところ、時間依存的および濃度依存的に結合することが明らかとなった。本結合性については、菌株間において特異性が異なることを明らかにした。現在、菌株間を認識する尾部吸着分子のメカニズムについて解析を進めている。
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
本研究課題では、Clostridioides difficileに結合するファージの尾部吸着分子を見出したが、その結合が不十分であると推察した。その結合性を知るためには、他の同属菌のファージの尾部吸着分子についても十分に理解することが重要であると考えた。そこで、ボツリヌス菌ファージの尾部吸着分子についても解析することとした。まず、ボツリヌス菌ファージのゲノム解析から推定した2つの尾部吸着分子を組換えタンパク質（Hisタグ融合ORFX、Hisタグ融合ORFY）として発現させるため、その条件（培地成分、温度、時間など）を検討した。本検討から至適条件を確立し、個々に精製することができた。そこで、2つのタンパク質のボツリヌス菌に対する結合性について、ウエスタンブロット解析により評価した。その結果、いずれもボツリヌス菌株間において結合性が異なることが明らかとなった。現在、菌株間を見分ける尾部吸着分子のメカニズムについて、C. difficileに結合する尾部吸着分子も含めて解析を進めている。
本年度の研究計画により、ボツリヌス菌に結合する尾部吸着分子を見出すことができた。本研究成果により、ボツリヌス菌に結合した2つの吸着分子（ORFX、ORFY）は、菌株間において異なる結合性を示したことから、他の血清型のボツリヌス菌のファージの尾部吸着分子についても調べる。1)他の血清型のボツリヌス菌ファージのゲノム解析から尾部吸着分子をコードする遺伝子を推定し、その遺伝子産物を発現させる。2)尾部吸着分子の至適条件（培地成分、温度、時間など）を確立させ、コバルトアフィニティクロマトグラフィーにより精製する。3)尾部吸着分子のボツリヌス菌に対する結合をEnzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA) およびウエスタンブロット法により解析し、ボツリヌス菌に対する吸着分子の特異性を明らかにする。ウエスタンブロット法においては、画像解析装置一式を用いて作製した種々の吸着分子のC. difficileへの結合性を評価する。4)作製した尾部吸着分子のClostridioides difficileに対する結合性についても検討する。
All 2024 2023 2022
All Journal Article (14 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results, Peer Reviewed: 14 results, Open Access: 10 results) Presentation (11 results) (of which Invited: 2 results)
Frontiers in Oncology
Volume: 14 Pages: 1371342-1371342
10.3389/fonc.2024.1371342
Volume: in press
Internal Medicine
Hepatology Research
Volume: 53 Issue: 10 Pages: 998-1007
10.1111/hepr.13930
Anaerobe
Volume: 82 Pages: 102753-102753
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Toxins
Volume: 15 Issue: 12 Pages: 695-695
10.3390/toxins15120695
Digestive Diseases
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10.3389/fonc.2023.1142907
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Volume: 73 Pages: 102502-102502
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Ann. Nutr. Metab.
Volume: 78(6) Issue: 6 Pages: 336-344
10.1159/000526563
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Volume: 319 Pages: 198881-198881
10.1016/j.virusres.2022.198881
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BMC Vet. Res.
Volume: 18(1) Issue: 1 Pages: 395-395
10.1186/s12917-022-03482-3
