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Analysis of rotavirus replication mechanism with a focus on viroplasm

Research Project

Project/Area Number 22K07100
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 49060:Virology-related
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

小瀧 将裕  大阪大学, 微生物病研究所, 助教 (10758816)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2022: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Keywordsロタウイルス / 複製機構 / 封入体 / viroplasm
Outline of Research at the Start

ロタウイルス感染症の制圧にはウイルス複製機構の解明が必要である。ロタウイルスは感染細胞内においてウイルス複製を行う場としてviroplasm(封入体)を形成する。ロタウイルスのNSP2、NSP5タンパク質は宿主因子と共にviroplasmを形成し、ウイルス複製に関与するが、詳細な機構は不明である。本研究では、リバースジェネティクス系を用いて網羅的にNSP2、NSP5変異ウイルスを作製し、その解析を通してviroplasmでのウイルス複製機構を明らかにする。本研究によりロタウイルスの弱毒ワクチン開発、治療薬の新規作用点の発見が期待される。

Outline of Annual Research Achievements

ロタウイルスは小児に感染性胃腸炎を起こすウイルスで、世界では依然として年間約20万人がロタウイルス感染によって死亡していると推定されている。より効果的なワクチン、あるいは治療薬の開発は急務であり、そのためにはウイルス複製機構の解明が必要である。ロタウイルスは感染細胞内においてウイルス複製を行う場としてviroplasm(封入体)を形成する。ロタウイルスのNSP2, NSP5タンパク質は宿主因子と共にviroplasmを形成し、ウイルス複製(主にパッケージング、粒子形成)に関与するが、詳細な機構は不明である。そこで本研究では、リバースジェネティクス系を用いて網羅的にNSP2変異ウイルスを作製し、その解析を通してviroplasmでのウイルス複製機構を明らかにすることを目的とした。
2022年度にはNSP2の変異ウイルス31種類の作製を試み、18種類の変異ウイルスの作製に成功した。そのうち、3種類の変異ウイルスは親株と比較して感染性ウイルス産生量が大幅に低下していることを見出し、封入体形成に関与するNSP2の責任領域を同定した。
2023年度は変異ウイルスと野生型ウイルスを比較した性状解析を行った。変異ウイルスは、ウイルスタンパク質発現、RNA複製能、封入体の液-液相分離の性質が異なることが判明した。これらは封入体の形成初期の異常に起因すると推定される。
さらにviroplasmの詳細な形成機構を明らかにするため、近接標識法等を用いて封入体形成に関与する宿主タンパク質の探索を行った。結果、封入体形成に関与する宿主タンパク質を4種類同定した。また、その宿主タンパク質は、変異ウイルスの形成する封入体には関与していなかった。ウイルスの変異箇所が宿主タンパク質との相互作用に関与していると推定される。このように、ウイルス、宿主の両側面から封入体形成のメカニズムの一端を明らかにしたと考えられる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

2023年度に野生型ウイルスと変異ウイルスを比較し、ウイルス複製に関与する領域・機構の同定を予定していた。実際には、変異ウイルスは封入体の形成機構に異常があることを明らかにした。また、近接標識法等を用いて封入体形成に関与する宿主タンパク質を同定した。当初の予定通り解析が進んでいると考えられる。

Strategy for Future Research Activity

2024年度は昨年度に引き続き、封入体形成の機構の詳細な解析を行う。具体的には、同定したタンパク質のノックアウト細胞を作製しウイルス封入体への関与を解析する。また、今回明らかにしたウイルス封入体形成機構の普遍性を確認する。今回用いたサルロタウイルスの他に、ヒトロタウイルスにも変異を導入して上記と同様の実験を行う。さらに、変異体のマウスへの感染実験を行い、下痢誘導能や体重減少等を測定し病原性を解析する。

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 3 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results)

  • [Journal Article] Vero cell-adapted SARS-CoV-2 strain shows increased viral growth through furin-mediated efficient spike cleavage2024

    • Author(s)
      Minami Shohei、Kotaki Tomohiro、Sakai Yusuke、Okamura Shinya、Torii Shiho、Ono Chikako、Motooka Daisuke、Hamajima Rina、Nouda Ryotaro、Nurdin Jeffery A.、Yamasaki Moeko、Kanai Yuta、Ebina Hirotaka、Maeda Yusuke、Okamoto Toru、Tachibana Taro、Matsuura Yoshiharu、Kobayashi Takeshi
    • Journal Title

      Microbiology Spectrum

      Volume: 12 Issue: 4

    • DOI

      10.1128/spectrum.02859-23

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The Emergence and Widespread Circulation of Enteric Viruses Throughout the COVID-19 Pandemic: A Wastewater-Based Evidence2023

    • Author(s)
      Hoque Sheikh Ariful、Saito Hiroyuki、Akino Wakako、Kotaki Tomohiro、Okitsu Shoko、Onda Yuko、Kobayashi Takeshi、Hossian Tania、Khamrin Pattara、Motomura Kazushi、Maneekarn Niwat、Hayakawa Satoshi、Ushijima Hiroshi
    • Journal Title

      Food and Environmental Virology

      Volume: 15 Issue: 4 Pages: 342-354

    • DOI

      10.1007/s12560-023-09566-z

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Genetic engineering strategy for generating a stable dsRNA virus vector using a virus-like codon-modified transgene2023

    • Author(s)
      Kanai Yuta、Onishi Misa、Yoshida Yukino、Kotaki Tomohiro、Minami Shohei、Nouda Ryotaro、Yamasaki Moeko、Enoki Yasutaka、Kobayashi Takeshi
    • Journal Title

      Journal of Virology

      Volume: 97 Issue: 10

    • DOI

      10.1128/jvi.00492-23

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Construction of Fosmid-based SARS-CoV-2 replicons for antiviral drug screening and replication analyses in biosafety level 2 facilities2023

    • Author(s)
      Takazawa Shunta、Kotaki Tomohiro、Nakamura Satsuki、Utsubo Chie、Kameoka Masanori
    • Journal Title

      Virus Research

      Volume: 334 Pages: 199176-199176

    • DOI

      10.1016/j.virusres.2023.199176

    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Journal Article] Effective SARS-CoV-2 replication of monolayers of intestinal epithelial cells differentiated from human induced pluripotent stem cells2023

    • Author(s)
      Minami Shohei、Matsumoto Naomi、Omori Hiroko、Nakamura Yutaka、Tamiya Shigeyuki、Nouda Ryotaro、Nurdin Jeffery A.、Yamasaki Moeko、Kotaki Tomohiro、Kanai Yuta、Okamoto Toru、Tachibana Taro、Ushijima Hiroshi、Kobayashi Takeshi、Sato Shintaro
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 13 Issue: 1 Pages: 11610-11610

    • DOI

      10.1038/s41598-023-38548-1

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Genotype Diversity of Enteric Viruses in Wastewater Amid the COVID-19 Pandemic2023

    • Author(s)
      Hoque Sheikh Ariful、Kotaki Tomohiro、Pham Ngan Thi Kim、Onda Yuko、Okitsu Shoko、Sato Shintaro、Yuki Yoshikazu、Kobayashi Takeshi、Maneekarn Niwat、Kiyono Hiroshi、Hayakawa Satoshi、Ushijima Hiroshi
    • Journal Title

      Food and Environmental Virology

      Volume: 15 Issue: 2 Pages: 176-191

    • DOI

      10.1007/s12560-023-09553-4

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Characterization of Sialic Acid-Independent Simian Rotavirus Mutants in Viral Infection and Pathogenesis2023

    • Author(s)
      Yamasaki Moeko、Kanai Yuta、Wakamura Yoshiki、Kotaki Tomohiro、Minami Shohei、Nouda Ryotaro、Nurdin Jeffery A.、Kobayashi Takeshi
    • Journal Title

      Journal of Virology

      Volume: 97 Issue: 1

    • DOI

      10.1128/jvi.01397-22

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] N-Glycosylation of Rotavirus NSP4 Protein Affects Viral Replication and Pathogenesis.2023

    • Author(s)
      Nurdin JA, Kotaki T, Kawagishi T, Sato S, Yamasaki M, Nouda R, Minami S, Kanai Y, Kobayashi T.
    • Journal Title

      Journal of Virology

      Volume: 97 Issue: 1

    • DOI

      10.1128/jvi.01861-22

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Construction and evaluation of a self-replicative RNA vaccine against SARS-CoV-2 using yellow fever virus replicon2022

    • Author(s)
      Nakamura A, Kotaki T, Nagai Y, Takazawa S, Tokunaga K, Kameoka M.
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 17 Issue: 10 Pages: e0274829-e0274829

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0274829

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Japanese Encephalitis DNA Vaccines with Epitope Modification Reduce the Induction of Cross-Reactive Antibodies against Dengue Virus and Antibody-Dependent Enhancement of Dengue Virus Infection2022

    • Author(s)
      Kotaki Tomohiro、Nagai Yurie、Yamanaka Atsushi、Konishi Eiji、Kameoka Masanori
    • Journal Title

      Vaccines

      Volume: 10 Issue: 9 Pages: 1411-1411

    • DOI

      10.3390/vaccines10091411

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Dissection of the mechanism of rotavirus inclusion body formation with a focus on viral NSP2 protein2024

    • Author(s)
      Tomohiro Kotaki, Yuta Kanai, Megumi Onishi, Shohei Minami, Takeshi Kobayashi
    • Organizer
      U.S.-Japan Cooperative Medical Sciences Program (USJCMSP) 2024 International Conference on Emerging Infectious Diseases (EID) in the Pacific Rim
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Development of a Single-Round Infectious Rotavirus as a Next-Generation Vaccine2024

    • Author(s)
      Tomohiro Kotaki, Yuta Kanai, Megumi Onishi, Shohei Minami, Chen Zelin, Ryotaro Nouda, Jeffery A. Nurdin, Moeko Yamasaki, Takeshi Kobayashi
    • Organizer
      The 1st AMED-SCARDA Joint Symposium on Japan Initiative for World-leading Vaccine Research and Development Center
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] VP6欠損による一回感染性ロタウイルスの作製2023

    • Author(s)
      小瀧将裕、金井祐太、南昌平、大西恵、納田遼太郎、山﨑萌子、小林剛
    • Organizer
      第70回日本ウイルス学会学術集会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] マウス順化サルロタウイルスの作出2022

    • Author(s)
      金井 祐太, 小瀧 将裕, 南 昌平, 納田 遼太郎, 山﨑 萌子, 小林 剛
    • Organizer
      第69回日本ウイルス学会学術集会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] ロタウイルス感染に関与する宿主因子Tumor Associated Calcium Signal Transducer 2の機能解析2022

    • Author(s)
      山﨑 萌子, 金井 祐太, 浜島 りな, 小瀧 将裕, 南 昌平, 納田 遼太郎, 小林 剛
    • Organizer
      第69回日本ウイルス学会学術集会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] ロタウイルスNSP2タンパク質の機能解析2022

    • Author(s)
      小瀧将裕, 金井祐太, 南 昌平, 納田遼太郎, Jeffery A. Nurdin, 山崎萌子, 小林剛
    • Organizer
      第69回日本ウイルス学会学術集会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] N-glycosylation of rotavirus NSP4 protein affects viral replication and pathogenesis2022

    • Author(s)
      Tomohiro Kotaki, Jeffery A. Nurdin, Takahiro Kawagishi, Shintaro Sato, Moeko Yamasaki, Ryotaro Nouda, Shohei Minami, Yuta Kanai, Takeshi Kobayashi
    • Organizer
      14th International dsRNA Virus Symposium
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analysis of the role of rotavirus NSP4 protein in viral replication and pathogenicity2022

    • Author(s)
      Tomohiro Kotaki, Jeffery A. Nurdin, Takahiro Kawagishi, Shintaro Sato, Moeko Yamasaki, Ryotaro Nouda, Shohei Minami, Yuta Kanai, Takeshi Kobayashi
    • Organizer
      The 20th Awaji International Forum on Infection and Immunity
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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