BRCA関連重複癌患者の全エクソン解析を通じた新規癌発症リスク因子の同定

Research Project

Project/Area Number	22K07233
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 50020:Tumor diagnostics and therapeutics-related
Research Institution	Okayama University
Principal Investigator	谷岡真樹岡山大学, 医歯薬学域, 准教授 (60573045)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	枝園忠彦岡山大学, 大学病院, 教授 (30509451) 中村圭一郎岡山大学, 医歯薬学域, 准教授 (90359886) 柳井広之岡山大学, 大学病院, 教授 (90379735)
Project Period (FY)	2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help	¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000) Fiscal Year 2024: ¥130,000 (Direct Cost: ¥100,000、Indirect Cost: ¥30,000) Fiscal Year 2023: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000) Fiscal Year 2022: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywords	重複がん / 重複癌 / 全エクソン解析 / 乳癌 / 卵巣癌 / 膵臓癌
Outline of Research at the Start	現在解析中の23症例に加え、本研究では岡山大学の50例を追加し合計100重複癌の全エクソン解析を行い、胚細胞BRCA1/2変異位置の偏り、他遺伝子変異、複数遺伝子変異例を報告する。そして東北メガバンク9千人の全ゲノムデータを活用し、癌未発症だがHRD関連変異を有する一般人を、臨床情報を含め機械学習により重複癌と比較し、重複発症のリスク因子を明らかにする。これは乳癌・卵巣癌・膵癌に共通する発症・治療の新規バイオマーカーとなりうる。腫瘍側では同一患者の重複腫瘍に共通するクローン解析から重複癌に特徴的な新規遺伝子変異を同定する、また重複腫瘍のHRDから再発予測や治療戦略を構築する。
Outline of Annual Research Achievements	重複癌発症リスク因子は、発症予防措置を可能とし、また乳癌・卵巣癌・すい臓癌の発症・治療の新規バイオマーカーとなりうる。我々はリンパ腫を2度、乳癌と膵臓癌を重複した1名において、LMO2の生殖細胞変異を唯一の候補として見出した。バイオバンクジャパンにおいて、びまん性大細胞型リンパ腫と乳癌、膵臓癌、または卵巣癌を重複した１０３名の患者の中で、これまでに認められたLMO2のバリアントを有する症例が認められるかを検討し、LMO2のバリアントが認められたサンプルに関して全エクソン解析によりその他の遺伝子変異に乏しいこと、相同組み換え異常のレベルを測定する。 BBJより１０３サンプルを受け取り、理化学研究所へ送付し、LMO2内シングルサイトの遺伝子変異解析を行った。しかし変異のあるサンプルは全くなかった。また、MRE11、TET2などの変異は各１名に認められたが、これらサンプルでは同時にBRCA2の変異も認められており、ドライバー変異と判定するには不十分である。同様に１名にBRCA1 /とBRCA2の両方に変異が認められたが相乗的な発癌への影響があるか１名のサンプルでは判断しがたい。そこで本研究では神奈川県立がんセンターバイオバンクで保存された乳腺外科、消化器外科（肝胆膵）、婦人科にて乳がんと卵巣がん、あるいは乳がんと膵臓がんと診断を受けた患者の腫瘍組織、生殖細胞DNAの全エクソン解析を追加することを通じて重複がんに特徴的な遺伝子異常を同定する。既にDNAの抽出を終え、現在理化学研究所でシークエンスを行っている。
Current Status of Research Progress	Current Status of Research Progress 2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned. Reason 順調に計画を進めている
Strategy for Future Research Activity	神奈川県立がんセンターバイオバンクで保存された乳腺外科、消化器外科（肝胆膵）、婦人科にて乳がんと卵巣がん、あるいは乳がんと膵臓がんと診断を受けた患者の腫瘍組織、生殖細胞DNAの全エクソン解析を追加することを通じて重複がんに特徴的な遺伝子異常を同定する。既にDNAの抽出を終え、現在理化学研究所でシークエンスを行っている。