原因不明の炎症性疾患におけるⅠ型IFN応答遺伝の発現解析と新規炎症病態の解明
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22K07867
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 52050:Embryonic medicine and pediatrics-related
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
井澤 和司 京都大学, 医学研究科, 講師 (90634931)
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| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
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| Keywords | Ⅰ型インターフェロン / 自己免疫疾患 / 自己炎症性疾患 / インターフェロン / 発現解析 |
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| Outline of Research at the Start |
原因不明の炎症性疾患患者におけるⅠ型IFNの関与の明らかにするとともに、炎症の原因となる新規責任遺伝子の同定とその病態を解明するために以下の解析を行う。原因不明の炎症性疾患患者の末梢血を用いた①Ⅰ型IFN応答遺伝子群の発現解析、② RNA-seqを用いた網羅的遺伝子発現解析、③上記の①と②の解析を免疫抑制剤導入前後での変動、臨床症状との関連性を評価する、また、④全エクソーム解析による新規責任遺伝子の同定、⑤ 新規責任遺伝子変異による病態機序の解明を行う。本研究では、原因不明の炎症性疾患患者における炎症の病態解明、治療標的経路の同定に寄与することが期待される。
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| Outline of Annual Research Achievements |
医学の進歩した現在においても、原因不明の炎症症状を認める患者は多数存在する。症状が一過性であれば問題とはならないが、月単位で発熱が持続したり、発熱が繰り返される際には臨床上の問題となる。これまで、原因としては感染症、膠原病、悪性疾患が多数を占めると考えられてきた。近年、遺伝子変異によって発症する自己炎症性疾患が知られるようになってきた。
しかしながら、各種の精密検査や網羅的な遺伝子解析等を行っても確定診断に至らない患者が多く存在する。既知の自己免疫疾患、自己炎症性疾患には当てはまらない原因不明の炎症性疾患患者は多数存在し、その病態は明らかになっていない。
本研究の目的は、原因不明の炎症性疾患患者におけるⅠ型IFNの関与の明らかにするとともに、炎症の原因となる新規責任遺伝子の同定とその病態を解明することである。具体的には、原因不明の炎症性疾患患者の末梢血を用いた①Ⅰ型IFN応答遺伝子群の発現解析：代表的なIFI27、IFI44L、IFIT1、ISG15、RSAD2、SIGLEC1の6遺伝子解析を行う。健常人、既知の自己炎症性疾患、自己免疫疾患との比較も行う。② RNA-seqを用いた網羅的遺伝子発現解析、③上記の①と②の解析を免疫抑制剤導入前後での変動、臨床症状との関連性を評価する、また、④全エクソーム解析による新規責任遺伝子の同定、⑤ 新規責任遺伝子変異による病態機序の解明を行う。本研究では、原因不明の炎症性疾患患者における炎症の病態解明、治療標的経路の同定に寄与することが期待される。
①、③については論文報告を行うことができた。②については有意な結果は得られなかった。④、⑤に関しては現在継続して解析を行っている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
Ⅰ型インターフェロン（IFN）の血中濃度は微量であり、通常のELISAでは測定が困難である。そのため、Ⅰ型IFN応答遺伝子（Interferon stimulated genes:
ISG）の発現解析を行うことで、Ⅰ型IFNの解析を行うことが一般的である。我々は、原因不明の炎症性疾患において末梢血 ISGの発現が上昇していることを見出
し論文報告を行った(Miyamoto T et al. Assessment of type I interferon signatures in undifferentiated inflammatory diseases: A Japanese
multicenter experience. Front Immunol. 2022)。RNA-seqを用いた網羅的遺伝子発現解析を行ったが、それぞれの疾患における検体数が少ないためか、有意な結果は得られなかった。すでに新規責任遺伝子候補を同定しており、培養細胞への遺伝子導入を行った。また、患者さんからiPS細胞を樹立し、単球・マクロファージへの分化を行い解析を行うことができた。
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| Strategy for Future Research Activity |
引き続き新規責任遺伝子候補についての解析を進めていく。
また、シングルセルRNA-Seqの解析も行う。
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Report
(2 results)
Research Products
(2 results)
