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Development of a novel gene therapy strategy using base editing for hyper-IgE syndrome caused by STAT3 mutations

Research Project

Project/Area Number 22K07951
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 52050:Embryonic medicine and pediatrics-related
Research InstitutionNational Center for Child Health and Development

Principal Investigator

内山 徹  国立研究開発法人国立成育医療研究センター, 成育遺伝研究部, 室長 (10436107)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords遺伝子治療 / ゲノム編集 / 高IgE症候群 / STAT3
Outline of Research at the Start

I型高IgE症候群(HIES)はSTAT3の片アレル変異によるドミナントネガティブ効果によって発症する原発性免疫不全症である。生理的な遺伝子発現制御の必要性や、残存する変異アレルによるアレルギー・炎症性病変の可能性から従来のウイルスベクターによる付加型遺伝子治療では対応が難しいとされる。本開発ではこれらの課題を克服すべく、①dead Cas9(dCas9)とtRNAアデノシンデアミナーゼ(Tad)からなる塩基編集ツールによる変異の修復と、②残存する変異アレルへのindel挿入、を組み合わせることで、変異の修復を同時に残存変異アレルの除去によるHIESへの新規の遺伝子治療法の開発を試みる。

Outline of Annual Research Achievements

I型高IgE症候群(HIES)はSTAT3の片アレル変異によるドミナントネガティブ効果によって発症する原発性免疫不全症である。生理的な遺伝子発現制御の必要性や、変異アレルによるアレルギー・炎症性病変の可能性から従来のウイルスベクターによる付加型遺伝子治療では対応が難しいとされる。本開発ではこれらの課題を克服すべく、①dead Cas9(dCas9)とtRNAアデノシンデアミナーゼ(Tad)からなる塩基編集ツールによる変異の修復と、②残存する変異アレルへのindel挿入、を組み合わせることで、変異の修復を同時に残存変異アレルの除去によるHIESへの新規の遺伝子治療法の開発を試みる。
HIESでは、免疫機能の低下による易感染性の他、IgEや好酸球の増加を伴うアトピー性皮膚炎などの免疫異常が混在する。In vivoでの有効性評価のため、ヒトに該当するSTAT3変異を持つマウスを作製し、末梢血中のIgEと好酸球数の上昇のほか、皮膚刺激に対して容易に脱毛を越すことなどから、ヒトに近いフェノタイプを示すことがわかった。次に造血幹細胞へのゲノム編集のための造血幹細胞の培養方法およびゲノム編集ツールの導入のためのエレクトロポレーション法の最適化を行った。最適化した手法によって、80%程度の効率で造血幹細胞へEGFP mRNAの導入が可能であった。また、変異アレルのみを認識・修復する必要があることから、変異アレル特異的な認識を可能にするガイドRNA配列を検討した。PAM配列がNGGおよびNGのCas9を用いて、複数のガイドRNAを検証したところNG-PAMを用いた場合に、変異アレル特異的なスペーサー配列を設計することが可能であった。
上記の条件を用いて、STAT3変異マウスの造血幹細胞に対して塩基編集ツールによる変異の修復を実施中である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

HIESでは免疫能の低下と免疫異常の両方が混在している。そのため、ゲノム編集を含めた遺伝子治療の有効性の評価には、細胞を用いた解析のみでは不十分であり、in vivoでの機能解析が必須である。昨年度までに作製したヒト(HIES患者)変異を持つマウスモデルでは、HIESの表現系を示すことがわかっており、このマウスを使用することで治療効果の評価が可能である。そのほか、治療効果が得られる効率でのゲノム編集を実施するためには、開発の各工程における条件の最適化が必須である。標的となる造血幹細胞の培養やゲノム編集ツールの導入方法は、ゲノム編集細胞のstemnessの維持に大きく影響する。また、HIESは常染色体顕性(優性)遺伝形式をとることから、健常アレルを壊すことなく、変異アレルのみを認識・編集するゲノム編集ツールの設計も必要となる。当該年度はHIESの造血幹細胞に対するゲノム編集に関わる様々な条件の最適化を完了し、次年度からこれらの条件によるゲノム編集の実施と有効性の評価を行っていく。

Strategy for Future Research Activity

造血幹細胞に対する変異アレル特異的なゲノム編集の条件検討が終了したことから、今後は作製したHIESマウスに対するゲノム編集を進めていく。血中のIgEの上昇、好酸球の増加、皮膚刺激による脱毛など、疾患特異的な所見も明確であることから、これらの改善を指標に有効性を評価することが可能である。

Report

(1 results)
  • 2023 Research-status Report
  • Research Products

    (21 results)

All 2024 2023

All Journal Article (16 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 11 results,  Open Access: 11 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 5 results)

  • [Journal Article] Pediatric Hemophagocytic lymphohistiocytosis after concomitant administration of SARS-CoV-2 vaccine and influenza vaccine.2024

    • Author(s)
      Kaizuka A, Tokuda Y, Morooka S, Gocho Y, Funaki T, Uchiyama T, Hirai Y, Yasumi T, Maekawa T, Kubota M, Ishiguro A.
    • Journal Title

      J infect Chemother.

      Volume: 30(1) Issue: 1 Pages: 67-70

    • DOI

      10.1016/j.jiac.2023.08.015

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  • [Journal Article] Melting temperature mapping method in children: Rapid identification of pathogenic microbes.2024

    • Author(s)
      Ishikawa T, Uejima Y, Okai M, Shiga K, Shoji K, Miyairi I, Kato M, Morooka S, Kubota M, Tagaya T, Tsuji S, Aoki S, Ide K, Niimi H, Uchiyama T, Onodera M, Kawai T.
    • Journal Title

      J Infect Chemother.

      Volume: 30(6) Issue: 6 Pages: 475-480

    • DOI

      10.1016/j.jiac.2023.11.024

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Congenital anaemia associated with loss-of-function variants in DNA polymerase epsilon 1.2024

    • Author(s)
      Takeuchi I, Tanase-Nakao K, Ogawa A, Sugawara T, Migita O, Kashima M, Yamazaki T, Iguchi A, Naiki Y, Uchiyama T, Tamaoki J, Maeda H, Shimizu H, Kawai T, Taniguchi K, Hirata H, Kobayashi M, Matsumoto K, Naruse K, Hata K, Akutsu H, Kato T, Narumi S, Arai K, Ishiguro A.
    • Journal Title

      J Med Genet.

      Volume: 61(3) Issue: 3 Pages: 239-243

    • DOI

      10.1136/jmg-2023-109444

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  • [Journal Article] HLA-haploidentical T-cell receptor αβT/B-cell-depleted stem cell transplantation for Fanconi anemia.2024

    • Author(s)
      Iguchi A, Uchiyama T, Fujimori K, Gocho Y, Sakaguchi H, Deguchi T, Tomizawa D, Imadome KI, Onodera M, Matsumoto K.
    • Journal Title

      Int J Hematol.

      Volume: 119(3) Issue: 3 Pages: 334-337

    • DOI

      10.1007/s12185-023-03703-x

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  • [Journal Article] Hematopoietic stem cell transplantation in two sisters with bone marrow failure associated with POLE gene variants.2024

    • Author(s)
      Fujimori K, Ikenobe N, Gocho Y, Uchiyama T, Deguchi T, Sakaguchi H, Tomizawa D, Takeuchi I, Shimizu H, Arai K, Ishiguro A, Matsumoto K, Iguchi A.
    • Journal Title

      Pediatr Blood Cancer.

      Volume: 71(5) Issue: 5

    • DOI

      10.1002/pbc.30919

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  • [Journal Article] A case of MYH7 and MYH9 genes variants with cardiomyopathy and macrothrombocytopenia.2024

    • Author(s)
      Ikawa Y, Nakamura T, Fujino N, Uchiyama T, Ishiguro A, Takenaka M, Sakai Y, Noguchi K, Fujiki T, Wada T.
    • Journal Title

      Clin Case Rep.

      Volume: 12(2) Issue: 2

    • DOI

      10.1002/ccr3.8304

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  • [Journal Article] Measurement of immature platelet fraction is useful in the differential diagnosis of MYH9 disorders.2023

    • Author(s)
      Kouno H, Kunishima S, Takebe J, Uchiyama T, Kaname T, Ishiguro A.
    • Journal Title

      Int J Lab Hematol.

      Volume: 45(5) Issue: 5 Pages: 700-706

    • DOI

      10.1111/ijlh.14123

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  • [Journal Article] Peripheral immune system modulates Purkinje cell degeneration in Niemann-Pick disease tyepe C1.2023

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      Yasuda T, Uchiyama T, Watanabe N, Ito N, Nakabayashi K, Mochizuki H, Onodera M.
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      Life Scie Alliance.

      Volume: 6(9) Issue: 9 Pages: e202201881-e202201881

    • DOI

      10.26508/lsa.202201881

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  • [Journal Article] Myelodysplasia after clonal hematopoiesis with APOBEC3-mediated CYBB inactivation in retroviral gene therapy for X-CGD2023

    • Author(s)
      Uchiyama T、Kawai T、Nakabayashi K、Nakazawa Y、Goto F、Okamura K、Nishimura T、Kato K、Watanabe N、Miura A、Yasuda T、Ando Y、Minegishi T、Edasawa K、Shimura M、Akiba Y、Sato-Otsubo A、Mizukami T、Kato M、Akashi K、Nunoi H、Onodera M
    • Journal Title

      Molecular Therapy

      Volume: 31 Issue: 12 Pages: 3424-3440

    • DOI

      10.1016/j.ymthe.2023.09.004

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  • [Journal Article] Inherited macrothrombocytopenia due to a novel splice donor site mutation in ITGB3.2023

    • Author(s)
      Komeno Y, Uchiyama T, Kawano F, Kurihara Y, Kurokawa M, Ohara O, Kunishima S, Ishiguro A.
    • Journal Title

      Ann Hematol.

      Volume: 102(10) Issue: 10 Pages: 2947-2949

    • DOI

      10.1007/s00277-023-05387-z

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  • [Journal Article] Safety and efficacy of elapegademase in patients with adenosine deaminase deficiency: A multicenter, open‐label, single‐arm, phase 3, and postmarketing clinical study2023

    • Author(s)
      Onodera M, Uchiyama T, Ariga T, Yamada M, Miyamura T, Arizono H, and Morio T.
    • Journal Title

      Immunity, Inflammation and Disease

      Volume: 11 Issue: 7

    • DOI

      10.1002/iid3.917

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  • [Journal Article] 造血幹細胞遺伝子治療―原発性免疫不全症2023

    • Author(s)
      内山 徹
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      日本医師会雑誌

      Volume: 第152巻(1) Pages: 248-252

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      内山 徹
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      医学のあゆみ

      Volume: Vol. 285 No5 Pages: 321-327

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      内山 徹
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URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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