Understanding endoscopic morphology during immune reconstitution using single cell analysis of small intestinal disease
Project/Area Number |
22K07994
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 53010:Gastroenterology-related
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Research Institution | Keio University |
Principal Investigator |
細江 直樹 慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 准教授 (90317131)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
筋野 智久 慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 講師 (40464862)
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Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000)
Fiscal Year 2024: ¥260,000 (Direct Cost: ¥200,000、Indirect Cost: ¥60,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
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Keywords | 小腸疾患 / シングルセル解析 / 小腸移植 |
Outline of Research at the Start |
小腸において未だに形態学では判別が困難である栄養吸収不全や、原因が明らかでない小腸疾患が数多く存在する。近年シングルセル解析技術が進み、さらに多くの細胞集団の同定が可能となってきた。小腸の内視鏡像を理解するために細胞集団の情報に加え「なぜある一つの細胞が、特定の場所に誘導され、その場所に存在をしなくてはならないのか?」という局在が重要になることをマウス研究より見出した。そこで申請者は1細胞遺伝子発現解析と各細胞集団の局在を着目した3次元解析を利用し内視鏡像の統合的理解に着手し、小腸移植を中心とした免疫再構築における内視鏡像との形態学との統合を目指す。
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Outline of Annual Research Achievements |
アプローチが困難なため暗黒大陸と言われてきた小腸はバルーン小腸内視鏡とカプセル内視鏡の開発により少しずつではあるがアプローチが可能となってきた。多彩なアプローチにより形態学的に所見を認める疾患(例えば小腸腫瘍等)に関しては分類と治療が確立しつつある。しかし、未だに形態学では判別が困難である栄養吸収不全や、原因が明らかでない小腸疾患が数多く存在する。この治療法の確立していない小腸疾患に対し1細胞レベルでの遺伝子発現解析により特徴的な細胞集団の抽出に加え、時空間的な解析手法を取り入れることで4次元構造を解析することを内視鏡的な形態学的特徴と統合する研究を計画した。実際に ① 脳死小腸移植患者における移植後腸管の1細胞レベル時空間解析、発現遺伝子解析 ② 骨髄移植患者における移植後腸管の1細胞レベル時空間解析、発現遺伝子解析 を計画した。 ①、②ともに3例をエントリーし検体を収集した。①については経時的に検体を採取し、1細胞レベル時空間解析、発現遺伝子解析を行った。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
① 脳死小腸移植患者における移植後腸管の1細胞レベル時空間解析、発現遺伝子解析 ② 骨髄移植患者における移植後腸管の1細胞レベル時空間解析、発現遺伝子解析 を計画した。 ①、②ともに3例をエントリーし検体を収集した。症例収集が計画よりもやや遅れているため、進捗がやや遅れる結果となった。
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Strategy for Future Research Activity |
① 脳死小腸移植患者における移植後腸管の1細胞レベル時空間解析、発現遺伝子解析 ② 骨髄移植患者における移植後腸管の1細胞レベル時空間解析、発現遺伝子解析
①については、小腸移植患者という特殊な病態のため、エントリーを促進する方策はないが、②に関しては、血液内科とも協力し、過去の骨髄移植患者も含め患者を組み入れることとし、研究を推進する。
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Report
(1 results)
Research Products
(7 results)
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[Journal Article] Single-cell transcriptomics of human gut T cells identifies cytotoxic CD4+CD8A+ T cells related to mouse CD4 cytotoxic T cells2022
Author(s)
Tanemoto Shun,Sujino Tomohisa,Miyamoto Kentaro,Moody Jonathan,Yoshimatsu Yusuke,Ando Yoshinari,Koya Ikuko,Harada Yosuke,Tojo Anna Okuzawa,Ono Keiko,Hayashi Yukie,Takabayashi Kaoru,Okabayashi Koji,Teratani Toshiaki,Mikami Yohei,Nakamoto Nobuhiro,Hosoe Naoki,Ogata Haruhiko,Hon Chung-Chau,Shin Jay W,Kanai Takanori
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Journal Title
Frontiers in Immunology
Volume: 13
Pages: 977117-977117
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Intracellular metabolic adaptation of intraepithelial CD4+CD8αα+ T lymphocytes2022
Author(s)
Harada Y, Sujino T, Miyamoto K, Nomura E, Yoshimatsu Y, Tanemoto S, Umeda S, Ono K, Mikami Y, Nakamoto N, Takabayashi K, Hosoe N, Ogata H, Ikenoue T, Hirao A, Kubota Y, Kanai T.
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Journal Title
iScience
Volume: 25
Issue: 4
Pages: 104021-104021
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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