Project/Area Number |
22K08388
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 53050:Dermatology-related
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Research Institution | Sapporo Medical University |
Principal Investigator |
宇原 久 札幌医科大学, 医学部, 教授 (40201355)
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Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
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Keywords | 悪性黒色腫 / リキッドバイオプシー / 個別化医療 / デジタルPCR / ctDNA / メラノーマ / 遺伝子パネル |
Outline of Research at the Start |
1)2020年に我々が開発したメラノーマに特化した遺伝子パネルによって腫瘍組織から同定された複数の遺伝子変異から候補遺伝子を選択し、患者から定期的に採取された末梢血(血漿)からデジタルPCRを用いて、腫瘍由来変異遺伝子群についてモニターし、単独の遺伝子を用いた場合と感度を比較する。 2)アジュバント療法中の患者について、腫瘍組織の遺伝子パネル情報を元に、複数の遺伝子を検査対象としたときに、末梢血腫瘍由来変異遺伝子のモニターが定期的な画像検査による再発の発見に勝るか検証する。
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Outline of Annual Research Achievements |
本年度は1)メラノーマの転移を有する症例からの経時的な血清採取と保存、2)原発巣のパネルシークエンスによる個々の患者における特異的な遺伝子変異の検索、3)2)の情報に基づいて1症例をピックアップした。この症例の原発巣はBRAF V600E変異、MTOR,POLE,NTRK3の変異が確認されたため、当該変異部位の遺伝子配列を合成し、デジタルPCRによる患者特異的な腫瘍関連遺伝子を同定するためのプライマーの作成とポジティブコントロール、ネガティブコントロールの作成までを行った。今後はデジタルPCR(QuantStudio Absolute Q)機器で実際に保存されている患者血清から腫瘍特異的な遺伝子変異が検出できるか検索を開始する。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本年度の予定である、1)メラノーマの転移を有する症例からの経時的な血清採取と保存、2)原発巣のパネルシークエンスによる個々の患者における特異的な遺伝子変異の検索、3)2)の情報に基づいて1症例をピックアップした。この症例の原発巣はBRAF V600E変異、MTOR,POLE,NTRK3の変異が確認されたため、当該変異部位の遺伝子配列を合成し、デジタルPCRによる患者特異的な腫瘍関連遺伝子を同定するためのプライマーの作成とポジティブコントロール、ネガティブコントロールの作成までが完了でき、デジタルPCR(QuantStudio Absolute Q)機器で実際に保存されている患者血清から腫瘍特異的な遺伝子変異が検出できるか検証が開始できるため。
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Strategy for Future Research Activity |
原発巣のパネルシークエンスによって、原発巣からBRAF V600E変異、MTOR,POLE,NTRK3の変異が確認された症例について、当該変異部位の遺伝子配列を合成し、デジタルPCRによる患者特異的な腫瘍関連遺伝子を同定するためのプライマーの作成とポジティブコントロール、ネガティブコントロールを用いてデジタルPCR(QuantStudio Absolute Q)機器で実際に保存されている患者血清から腫瘍特異的な遺伝子変異が検出できるか検証を開始する。手技が安定すれば症例数を増やして検証する。
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