形質細胞シングルセルRNAシークエンスによるALアミロイドーシス網羅的遺伝子解析
Project/Area Number |
22K08447
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 54010:Hematology and medical oncology-related
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Research Institution | Chiba University |
Principal Investigator |
竹田 勇輔 千葉大学, 医学部附属病院, 助教 (60772746)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
堺田 惠美子 千葉大学, 大学院医学研究院, 准教授 (60422218)
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Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
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Keywords | ALアミロイドーシス / シングルセル解析 / 網羅的遺伝子解析 / シングルセルRNAシークエンス / 形質細胞 |
Outline of Research at the Start |
全身性ALアミロイドーシスは、形質細胞が作るアミロイド蛋白が全身臓器に蓄積する、まれで治療が難しい病気です。しかし、病気を引き起こす形質細胞の割合が低いため、これまでは正常な細胞と区別することができず、遺伝子の異常を解析することが困難でした。 本研究では、ALアミロイドーシスの骨髄中の形質細胞に着目し、単一形質細胞レベルで分離を行って、網羅的に遺伝子変異解析とRNA発現解析を行い、アミロイドーシスを引き起こす原因遺伝子を調べ、明らかにすることを目標としています。
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Outline of Annual Research Achievements |
同じく骨髄腫類縁疾患であり、骨髄中の腫瘍細胞割合が少ないPOEMS症候群を対象とした、当教室の先行研究のシングルセル解析の手法を用い、ALアミロイドーシス患者の骨髄形質細胞解析に向けて準備を進めている。 POEMS症候群におけるシングルセル解析の報告については、昨年申請の時点では論文投稿中であったが、正式にacceptされた(JCI Insight. 2022 Oct 24;7(20):e151482.)。当該手法の先進性、および希少かつ難治性疾患であるPOEMS症候群の解析を行ったことが高く評価されたものであり、本研究のALアミロイドーシスの解析においても同様に重視される点であると考える。 ALアミロイドーシス患者は希少疾患であるため、検体のリクルートを行えるかどうかが非常に重要である。これについては、県内関連病院の当該症例ピックアップを進め、データベースを作成している。遺伝子の網羅的な解析においては、倫理的な面からも十分な配慮が必要であり、一部改訂された「人を対象とする生命科学・医学系研究に関する倫理指針」に準拠する形で改めて説明同意書の整備を行い、完了している。ALアミロイドーシスの患者検体は千葉大学医学部附属病院血液内科において、順調に検体数は収集されている。保存検体については、先行の共同研究より日本赤十字医療センター骨髄腫アミロイドーシスセンターから多数の検体の受け入れをすでに行っている。 並行して、ALアミロイドーシス患者検体におけるシングルセル解析条件の検定を進めており、最適な解析条件について設定を行っている。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
新型コロナ流行のため、昨年度は入院患者の受け入れに制限をかけざるを得ず、当初の見込みより新規症例の集積が遅れていると考えられる。また、シングルセル解析の条件検定などに想定より時間を要しており、進行はやや遅れていると判断している。
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Strategy for Future Research Activity |
今年度については、シングルセル解析を本格的に開始し、ALアミロイドーシス、多発性骨髄腫、MGUSの各症例から、単一形質細胞レベルで複数の遺伝子ライブラリーを作成し、RNAシークエンス解析を行う予定である。
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Report
(1 results)
Research Products
(1 results)
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[Journal Article] Unraveling unique features of plasma cell clones in POEMS syndrome with single-cell analysis.2022
Author(s)
Isshiki Y, Oshima M, Mimura N, Kayamori K, Miyamoto-Nagai Y, Seki M, Nakajima-Takagi Y, Kanamori T, Iwamoto E, Muto T, Tsukamoto S, Takeda Y, Ohwada C, Misawa S, Ikeda JI, Sanada M, Kuwabara S, Suzuki Y, Sakaida E, Nakaseko C, Iwama A.
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Journal Title
JCI Insight
Volume: 7
Issue: 20
Pages: 1-13
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research