| Project/Area Number |
22K09563
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 56040:Obstetrics and gynecology-related
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| Research Institution | National Cancer Center Japan |
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Principal Investigator |
加藤 友康 国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 非常勤医師 (50224522)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
白石 航也 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 部門長 (80609719)
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| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2024: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
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| Keywords | 子宮頸がん / ゲノムプロファイル |
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| Outline of Research at the Start |
本研究では、日本人子宮頸がんに対する体細胞変異や分子標的薬の適応となるゲノムプロファイルを明らかにする。さらに国立がん研究センター中央病院で子宮頸がんと診断されたが、ゲノム解析が未解析の症例に対してもホットスポット変異解析を行うことで対象となる解析数を増やす。共通した遺伝子異常の有無や予後・臨床病理学的因子との関連解析を行うことで、精度の高い治療方針決定のための基盤的情報の取得を目指す。
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究の目的は、既報の遺伝子異常が検出されなかった症例を対象に全エクソン・RNAシークエンスを実施することで、新たな治療標的になりうる遺伝子異常や免疫シグネチャーを同定である。昨年度に引き続き申請者らは、子宮頸がん116例に対してRNAシークエンスを実施し、STARを用いてhg38にマッピングを行い、遺伝子発現量の算出はRSEMで、融合遺伝子の同定はSTAR-FUSION/ARIBAを用いて検討を行った。その結果、116例中、ROS1融合遺伝子並びにFGFR3融合遺伝子を計4例に認めた。これらの融合遺伝子に対する複数の候補となる分子標的薬が報告されており、治療標的になりうると考えられた。さらにがん種横断的にFGFR融合遺伝子が検出されるか確認するため、C-CAT (21,789例）並びにcbioportal (32,608例)を用いて検討を行った。その結果、子宮頸がんにおいて最もFGFR3融合遺伝子に検出された（1.5-0.6％）。FGFR融合遺伝子にはFGFR1/2/3があり、遺伝子のタイプによって発生するがん種の頻度が異なることを見出した。またNMFを用いたクラスター解析により、予後不良群を同定し、その不良群の免疫活性が低下していることを見出した（Hiranuma et al., Cancer Med. 2023 Sep;12(17):17835-17848.）。最終年度は、HPV-independentで発症することが知られている胃型子宮頸がんの発症メカニズムを検討するため、公開データベース・トランスクリプトーム・ターゲットシークエンス・メタボロームデータに基づく、オミックス解析を実施し、発がんメカニズムを検討する。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
研究目的の一つである予後不良群並びに治療標的群の同定を行うことができ、一部の結果がCancer Medicineに採択された。引き続き、HPV陰性子宮頸がんを対象とした研究をさらに進める予定である。
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| Strategy for Future Research Activity |
研究目的の一つである予後不良群並びに治療標的群の同定を行うことができ、一部の成果がCancer Medicineに採択された。今後は、HPVワクチンの普及によりHPV陰性子宮頸がん症例が増えることが予想されるため、HPV陰性胃型子宮頸がん症例を対象とした研究を最終年度に実施する予定である。
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