p53の機能獲得変異は口腔扁平上皮癌の治療標的となり得るか
Project/Area Number |
22K10177
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 57060:Surgical dentistry-related
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Research Institution | Sapporo Medical University |
Principal Investigator |
松田 亜沙実 札幌医科大学, 医療人育成センター, 研究員 (30897533)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
佐々木 泰史 札幌医科大学, 医療人育成センター, 教授 (70322328)
荻 和弘 札幌医科大学, 医学部, 講師 (40433114)
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Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
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Keywords | p53 / 機能獲得変異 / 口腔扁平上皮癌 / トランスクリプトーム |
Outline of Research at the Start |
がん領域においても遺伝子異常を基にして適切な治療法や発症予防法を開発するPrecision medicineが推進されているが,がんゲノム検査から治療根拠となる遺伝子変異が検出される割合は10-30%程度と低く,広く臨床応用される状況には到っていない.本研究では,癌抑制遺伝子TP53の変異を高頻度に認める口腔扁平上皮癌に着目し,TP53機能獲得変異によって起こるトランスクリプトームの変動を分析し,機能解析へと展開する.さらに発現異常,遺伝子変異の有無,悪性度および治療効果との関連性を解析することで,p53ネットワーク破綻のメカニズムを標的とした口腔扁平上皮癌の治療法開発の基盤形成を目指す.
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Outline of Annual Research Achievements |
本研究では,癌抑制遺伝子TP53の変異を高頻度に認める口腔扁平上皮癌に着目し,TP53機能獲得変異によって起こるトランスクリプトームの変動を分析し,機能解析へと展開する.さらに発現異常,遺伝子変異の有無,悪性度および治療効果との関連性を解析することで,p53ネットワーク破綻のメカニズムを標的とした口腔扁平上皮癌の治療法開発の基盤形成を目指す.本研究の目的は,口腔扁平上皮癌をモデルとして,変異型p53のGOF(gain-of-function)によって変化するトランスクリプトームの全貌を解明し,p53ネットワークのさらなる理解につなげることである.変異型p53を標的とした治療法の開発につながる基礎研究を目指している.TP53のGOF変異は,がん遺伝子の活性化変異と類似の作用を示すことが予想され,新しい分子標的の同定に進展する可能性がある.
本年度は以下の研究成果をあげた。 1)種々の細胞株に野生型,および3種の変異型p53(R175H, R249S, R273C)をアデノウイルスベクターを用いて導入し,非コードRNAに重点をおいたトランスクリプトーム解析を試みた.同定したトランスクリプトについては,qRT-PCRにより発現変化の再現性を順次確認し,変異型p53に発現変化する12の非コードRNAを同定した. 2)食道扁平上皮癌関連疾患である頭頚部扁平上皮癌26症例を対象に治療前後のctDNAの分析が治療効果と再発モニタリングに有用かを評価した。根治的治療後にctDNAが陰性化しない、または陰性化後早期に陽転化した症例全例で再発を認め、ctDNAが頭頚部扁平上皮癌の有望なバイオマーカーであることが示唆された。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
1)次世代シークエンサー解析、およびp53結合コンセンサス配列の全ゲノム網羅的解析から、野生型、および変異型p53に制御されるタンパクコード遺伝子、非コードRNA、miRNAを複数同定している。
2)今年度は新規口腔扁平上皮癌症例29例のDNA, RNAの抽出を行い、p53,およびがん関連遺伝子の変異を解析した。その結果、20/29(69.0%)でp53変異を認めた。19のミスセンス変異を認め、今後GOF変異かどうかの検証を行う予定である。
3)GOF活性を評価した変異型p53発現プラスミド、またはアデノウイルスベクターを細胞株に導入し、細胞増殖能、抗がん剤感受性の解析を進めている。
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Strategy for Future Research Activity |
本研究では野生型・変異型p53によって制御されるトランスクリプトームを網羅的,かつ効率的に同定し,がんの発症・進展における役割を分析することで,p53ネットワークによる腫瘍抑制メカニズムのさらなる理解を目指す.
今年度は同定された変異型p53標的候補となるトランスクリプトームのうち、マイクロプロテインについて特に着目する.上記ゲノムレベルに加え,ペプチド抗体の作成,および質量分析等でタンパク質レベルでの解析を行う.また発現ベクターの導入による浸潤能,遊走能,増殖能などに与える影響,種々の分子生物学的手法を用いた転写・翻訳調節機構の解析を行う.さらに公共のデータベース(RefExA,GEO, cBioPortalなど)の活用,文献情報,モチーフ検索などを行い,増殖,細胞死,細胞分化などの機能的な面から,腫瘍の進展に関与することが予想される分子を絞り込む.また,臨床病理学的因子や治療反応性との相関を分析することで,臨床的な意義を見いだしていく.
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Report
(1 results)
Research Products
(3 results)
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[Journal Article] Serum soluble Fas levels and incidence of liver cancer in nested case-control study.2023
Author(s)
Adachi Y, Nojima M, Mori M, Kubo T, Akutsu N, Sasaki Y, Nakase H, Lin Y, Kurozawa Y, Wakai K, Tamakoshi A
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Journal Title
Cancer Epidemiol Biomarkers Prev.
Volume: -
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[Journal Article] Individualized circulating tumor DNA monitoring in head and neck squamous cell carcinoma.2022
Author(s)
Kogo R, Manako T, Iwaya T, Nishizuka S, Hiraki H, Sasaki Y, Idogawa M, Tokino T, Koide A, Komune N, Yasumatsu R, Nakagawa T.
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Journal Title
Cancer Med.
Volume: 11
Pages: 3960-3968
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[Journal Article] Genomic analysis of an aggressive case with metastatic intrahepatic mucinous cholangiocarcinoma.2022
Author(s)
Masaki Y, Akutsu N, Adachi Y, Ishigami K, Iwata N, Endo T, Ishii Y, Sasaki Y, Nagayama M, Kimura Y, Nakase H.
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Journal Title
Clin J Gastroenterol.
Volume: 15
Pages: 809-817
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