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エピジェネティクスおよび細菌叢解析に基づくOral Aging Clockの開発

Research Project

Project/Area Number 22K10296
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 57080:Social dentistry-related
Research InstitutionHealth Sciences University of Hokkaido

Principal Investigator

植原 治  北海道医療大学, 歯学部, 講師 (00709248)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 三浦 宏子  北海道医療大学, 歯学部, 教授 (10183625)
安彦 善裕  北海道医療大学, 歯学部, 教授 (90260819)
長澤 敏行  北海道医療大学, 歯学部, 教授 (90262203)
Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
KeywordsRRBS / エイジングクロック / 口腔の老化 / 細菌叢解析 / DNAメチル化解析 / マイクロバイオーム / エピジェネティクス
Outline of Research at the Start

口腔疾患を考慮した老化年齢を予測するには、宿主および病原性因子の両因子に基づいたAging Clockを開発することが望ましい。本研究では、口腔のエピジェネティクスおよび細菌叢解析に基づいた宿主の口腔老化年齢を予測する方法(Oral Aging Clock)を開発する。Oral Aging Clock開発は、歯周炎をはじめとする口腔疾患の精度の高い予知診断や予防治療へ応用できるものと考えられる。

Outline of Annual Research Achievements

DNAメチル化レベルより求めた生物学的年齢(Epigenetic Aging Clock)は、近年、有力な老化の指標の一つとして考えられはじめている。Epigenetic Aging Clockは、種々の細胞でもエピジェネティクス的年齢の顕著な相関性が示唆されている。しかし、口腔スワブでは、他臓器や細胞よりも相関性がないことも示されている。免疫系と多くの口腔疾患との相互作用の特徴は十分に解明されているが、口腔疾患を発症するリスクが非常に高い人を予測するために使用できる免疫指標は、極めて少ない。口腔疾患を考慮した老化年齢を予測するには、宿主および病原性因子の両因子に基づいたAging Clockを開発することが望ましい。
本年度は、マウスのOral Aging Clockを開発する上で重要となる若年マウス(10週齢)および高齢マウス(80週齢)の歯肉のDNAメチル化の変化とその変化をエイジングクロックに適応させた。RRBSを実施した.データからHorvath,Han,Stubbs,Meerのクロックを適用させエピジェネティック年齢を予測した.これらのうちMeerのクロックのみ統計学的な優位差を認めた(若年マウス:高齢マウス=33.74±0.02:33.90±0.08)。これらのことからMeerのクロックは口腔の老化の変化を再現できる可能性がある。一方で、マウスの週齢と大きく異なることから、口腔に特化したエイジングクロックに関連する遺伝子をRRBSのメチル化変動遺伝子(CpGアイランドのプロモーター領域を対象)から探索する必要性がある。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

昨年度進まなかったRRBSを実施し既存のエイジングクロックに適応できた。

Strategy for Future Research Activity

口腔に特化したエイジングクロックに関連する遺伝子をRRBSのメチル化変動遺伝子から探索する。

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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