| Project/Area Number |
22K10501
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 58020:Hygiene and public health-related: including laboratory approach
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| Research Institution | National Institute of Infectious Diseases |
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Principal Investigator |
Takemae Nobuhiro 国立感染症研究所, 感染症危機管理研究センター, 室長 (10584386)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
百瀬 文隆 国立感染症研究所, 感染症危機管理研究センター, 主任研究官 (90332204)
ドアンハイ イエン 国立感染症研究所, 感染症危機管理研究センター, 主任研究官 (90701243)
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| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2024)
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| Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
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| Keywords | ターゲットキャプチャー法 / A型インフルエンザウイルス / ハイブリダイゼーションプローブ / 次世代シーケンサー / ターゲットキャプチャー / 臨床検体 |
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| Outline of Research at the Start |
国際公共データベースに登録されたA型インフルエンザウイルスの全塩基配列から、全ての亜型（H1-H18及びN1-N11亜型）ウイルスに網羅的にハイブリダイズするプローブを設計する。ヒト臨床検体中に、濃度別に調整した様々な亜型の検証用ウイルスが添加し、設計したプローブパネル候補とハイブリダイゼーション（ターゲットキャプチャー）させた後に、次世代シーケンスを実施する。得られた配列データを詳細に解析し、PCR法と比較した場合の検出感度、濃縮効率、非標的遺伝子の低下率などからプローブパネルを評価し、臨床検体中のA型インフルエンザウイルスの全遺伝子配列を直接に解読可能な高感度な検出方法を創出する。
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| Outline of Final Research Achievements |
The influenza A virus is one of the pathogens most likely to cause the next pandemic. In this study, we designed a custom probe panel that enriches the genomes of all influenza A virus subtypes and developed a target capture method that yields the complete genome sequence of the virus directly from clinical specimens. This method could allow for the direct identification of IAV genomes from patients with unknown subtypes that cannot be diagnosed by conventional tests in hospitals and other institutions, and from clinical specimens with low viral concentrations. Therefore, this method is expected to contribute to the early detection of new IAVs with pandemic potential.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
本研究では、A型インフルエンザウイルスの全ての亜型のゲノムを濃縮可能なターゲットキャプチャー法を開発することを目的とした。既存の方法では亜型同定ができない未知のA型インフルエンザウイルスのゲノム解析や、ウイルス濃度が低い臨床検体中ののウイルスゲノム配列を効率よく決定する方法が開発できれば、A型インフルエンザウイルスに限らず野生動物や家畜に存在するパンデミックリスクの高い病原体を早期に検出する技術開発につながると考えた。
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