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自然言語処理を用いた画像診断レポートのビッグデータ疾患サーベイランス実証研究

Research Project

Project/Area Number 22K10535
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 58030:Hygiene and public health-related: excluding laboratory approach
Research InstitutionJuntendo University

Principal Investigator

明石 敏昭  順天堂大学, 医学部, 准教授 (40623492)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywordsデータベース / 言語解析 / CT / MR / 自然言語処理 / サーベイランス
Outline of Research at the Start

COVID-19肺炎の世界的なパンデミックの初期において、PCR検査の不足が問題となったが、CTが普及している日本においては画像診断が迅速・簡便であることから、肺炎のスクリーニングとしてCTによる画像診断が有効であった。そこで、本邦屈指の医療系ビッグデータである日本医用画像データベース(J-MID)にある約100万件の画像診断レポートを利用して、特定の疾患や画像所見の有無の事実性を判定するBERT言語モデルを開発し、自然言語処理を用いることによって、疾患の全国的な発生状況をモニタリング可能であることを実証し、画像診断レポートによる疾患サーベイランス法を確立する。

Outline of Annual Research Achievements

医療情報を全国10施設の大学病院から一元的に画像および画像診断レポートを収集している日本医用画像データベース(Japan-MedicalImage Database; JMID)には5億枚、150万件を超える検査が収集されているが、2023年4月にシステムをオンプレミスサーバーからクラウド化し、大量のデータを容易に検索し、ダウンロードすることを可能にした。
当初は対象とする疾患名もしくは画像所見の有無を判定するBERTを用いた事実性判定モデルを作成することを目標としていたが、この数年で自然言語解析の進歩が著しく、計画を再検討した。まずは、レポートにCOVID-19に関連する単語とAIによってCOVID-19肺炎と典型度が高いと判断された胸部CTとの相関を検討した結果、画像よりも明らかにレポートとの相関が高いことが判明した。また、レポートを用いて下垂体腺腫の症例をJ-MIDから抽出し、造影MRIのダイナミックスタディーにおける病変抽出を行うAIを作成に利用した。
また、データベースの整備として、人工知能を用いて検査情報の構造化(モダリティ、検査部位、画像の種類、造影の有無などをDICOMのメタデータおよび画像から統一されたオントロジーに従って分類)を行ない、検索性能の向上に努めているが、その精度について検討中である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

利用しているデータベースのシステム基盤が改築されたため、すでに準備していたシステムが機能しなくなり、適宜対応している。また、自然言語解析の進歩が著しく、それに伴った計画の調整を行なっている。

Strategy for Future Research Activity

現在検査の抽出には検査の構造化が不十分で、適切な検査の抽出ができない。これを解決するために人工知能を用いたシステムを整え、自然言語によるレポートの検索性能の向上を図る。

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2023 2022

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 4 results)

  • [Journal Article] Improved method for COVID-19 classification of complex-architecture CNN from chest CT volumes using orthogonal ensemble networks2023

    • Author(s)
      Toda Ryo、Oda Masahiro、Hayashi Yuichiro、Otake Yoshito、Hashimoto Masahiro、Akashi Toshiaki、Aoki Shigeki、Mori Kensaku
    • Journal Title

      SPIE Medical Imaging, 2023

      Volume: 12465 Pages: 11-11

    • DOI

      10.1117/12.2653792

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Classification of COVID-19 cases from chest CT volumes using hybrid model of 3D CNN and 3D MLP-mixer2023

    • Author(s)
      Oda Masahiro、Zheng Tong、Hayashi Yuichiro、Otake Yoshito、Hashimoto Masahiro、Akashi Toshiaki、Aoki Shigeki、Mori Kensaku
    • Journal Title

      SPIE Medical Imaging, 2023

      Volume: 12465 Pages: 1246534-1246534

    • DOI

      10.1117/12.2654706

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Performance improvement for medical image classification model by using gradient-based analytical feature selection2023

    • Author(s)
      Toda Ryo、Itoh Hayato、Oda Masahiro、Hayashi Yuichiro、Otake Yoshito、Hashimoto Masahiro、Akashi Toshiaki、Aoki Shigeki、Mori Kensaku
    • Journal Title

      SPIE Medical Imaging, 2024

      Volume: 12927 Pages: 85-85

    • DOI

      10.1117/12.3006620

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Deep Learning-Driven Transformation: A Novel Approach for Mitigating Batch Effects in Diffusion MRI Beyond Traditional Harmonization.2023

    • Author(s)
      Wada A, Akashi T, Hagiwara A, Nishizawa M, Shimoji K, Kikuta J, Maekawa T, Sano K, Kamagata K, Nakanishi A, Aoki S.
    • Journal Title

      Journal of magnetic resonance imaging : JMRI.

      Volume: Oct 25 Issue: 2 Pages: 1-13

    • DOI

      10.1002/jmri.29088

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Attention induction for a CT volume classification of COVID-192022

    • Author(s)
      Takateyama Yusuke、Haruishi Takahito、Hashimoto Masahiro、Otake Yoshito、Akashi Toshiaki、Shimizu Akinobu
    • Journal Title

      International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery

      Volume: 18 Issue: 2 Pages: 289-301

    • DOI

      10.1007/s11548-022-02769-y

    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Journal Article] Classification and visual explanation for COVID-19 pneumonia from CT images using triple learning2022

    • Author(s)
      Kato Sota、Oda Masahiro、Mori Kensaku、Shimizu Akinobu、Otake Yoshito、Hashimoto Masahiro、Akashi Toshiaki、Hotta Kazuhiro
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12 Issue: 1

    • DOI

      10.1038/s41598-022-24936-6

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 日本医学放射線学会による日本医用画像データベース(J-MID)構築とデータサイエンスでの利活用に向けて2023

    • Author(s)
      明石敏昭
    • Organizer
      第6回全国医療AIコンテスト
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Japan Safe Radiologyのための日本医用画像データベース開発とそのデータ利活2022

    • Author(s)
      明石敏昭
    • Organizer
      第81回日本医学放射線学会総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] AIによる画像診断の現状とこれから2022

    • Author(s)
      明石敏昭
    • Organizer
      第119回日本内科学会講演会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 放射線ナショナル画像データベースJ-MIDとその発展2022

    • Author(s)
      明石敏昭
    • Organizer
      第41回日本医用画像工学会大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] COVID-19: radiology response in Japan2022

    • Author(s)
      明石敏昭
    • Organizer
      50th National Congress of the Italian Society of Medical and Interventional Radiology
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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