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Investigating Radiation-induced Carcinogenesis via NGS Analysis of Clustered Mutations Caused by Cellular Senescence

Research Project

Project/Area Number 22K12375
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 63020:Radiation influence-related
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

Kawai Hidehiko  広島大学, 医系科学研究科(薬), 准教授 (30379846)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 紙谷 浩之  広島大学, 医系科学研究科(薬), 教授 (10204629)
Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywords放射線影響 / 発がん / クラスター性変異 / 放射線被曝 / がん / 幹細胞 / 細胞老化
Outline of Research at the Start

放射線被曝によって間質系細胞に誘導された細胞老化が、局所的に慢性炎症を惹起し、段階的プロセスを介して組織幹細胞に“クラスター性変異”生成を誘発することが放射線発がんに寄与している可能性が考えられる。そこで本研究計画では、その検証を目的として、我々が最近独自に開発した次世代シークエンサー(NGS)を用いたハイスループットの変異解析法により、損傷誘発クラスター性変異の解析を進めることで、放射線発がんのメカニズムを明らかにする。

Outline of Final Research Achievements

It was revealed that, in human cells, characteristic mutations likely dependent on APOBEC3 cytidine deaminases increase in a DNA strand-biased manner in response to radiation exposure and oxidative base damage. Ultimately, a correlation was identified between nucleotide sequence, secondary DNA structure, and the frequency of mutation induction. These findings suggest that increased levels of reactive oxygen species, triggered by environmental changes associated with cellular senescence, may enhance intrinsic clustered mutagenesis mechanisms such as those mediated by APOBEC3, thereby potentially inducing mutations in stem cells. The novel mutation analysis method developed in this study is expected to contribute to the elucidation of previously unknown carcinogenic mechanisms driven by environmental mutagens.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究では、放射線被曝によって直接生成される活性酸素種や、間質系細胞に誘導された細胞老化や生成される活性酸素種が、細胞内で二次的にクラスター性塩基置換変異を増加させる可能性を見出した。また、本研究においては、新たにシャトルベクターを用いたハイスループットかつ高感度の変異解析法を開発することに成功し、更に、様々な種類の環境変異原による変異解析に応用可能な手法として改良した。今後、この解析法を用いることにより、放射線発がんだけでなく、環境変異原による未知の発がん機構や自然発がんの機構解明に貢献できるものと期待する。

Report

(4 results)
  • 2024 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (32 results)

All 2025 2024 2023 2022

All Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 8 results) Presentation (23 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Visualization of oxidized guanine nucleotides accumulation in living cells with split MutT.2025

    • Author(s)
      Fujikawa Y, Kawai H, Suzuki T, Kamiya H.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res.

      Volume: 52(11) Issue: 11 Pages: 6532-6542

    • DOI

      10.1093/nar/gkae371

    • Related Report
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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] NEIL1: The second DNA glycosylase involved in action-at-a-distance mutations induced by 8-oxo-7,8-dihydroguanine2025

    • Author(s)
      Fujikawa Yoshihiro、Suzuki Tetsuya、Kawai Hidehiko、Kamiya Hiroyuki
    • Journal Title

      Free Radical Biology and Medicine

      Volume: 229 Pages: 374-383

    • DOI

      10.1016/j.freeradbiomed.2025.01.041

    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Correction of substitution, deletion, and insertion mutations by 5'-tailed duplexes2024

    • Author(s)
      Kawai H, Sato K, Kato T, Kamiya H.
    • Journal Title

      J Biosci Bioeng

      Volume: 137(3) Issue: 3 Pages: 157-164

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2023.12.011

    • Related Report
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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Methylmercury Decreases AMPA Receptor Subunit GluA2 Levels in Cultured Rat Cortical Neurons2023

    • Author(s)
      Ishida K, Takeda K, Takehara Y, Takabayashi T, Miyara M, Sanoh S, Kawai H, Ohta S, Kotake Y
    • Journal Title

      Biological and Pharmaceutical Bulletin

      Volume: 46 Issue: 2 Pages: 292-300

    • DOI

      10.1248/bpb.b22-00744

    • ISSN
      0918-6158, 1347-5215
    • Year and Date
      2023-02-01
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  • [Journal Article] Correction of monomeric enhanced green fluorescent protein (mEGFP) gene by short 5′-tailed duplexes2022

    • Author(s)
      Kawai H, Kamitsubo R, Kamiya H
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: 134 Issue: 3 Pages: 175-181

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2022.06.014

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] RFWD3 and translesion DNA polymerases contribute to PCNA modification dependent DNA damage tolerance2022

    • Author(s)
      Kanao Rie、Kawai Hidehiko、Taniguchi Toshiyasu、Takata Minoru、Masutani Chikahide
    • Journal Title

      Life Science Alliance

      Volume: 5 Issue: 12 Pages: e202201584-e202201584

    • DOI

      10.26508/lsa.202201584

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Development of a versatile high-throughput mutagenesis assay with multiplexed short-read NGS using DNA-barcoded supF shuttle vector library amplified in E. coli2022

    • Author(s)
      Kawai H, Iwata R, Ebi S, Sugihara R, Masuda S, Fujiwara C, Kimura S, Kamiya H
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 11

    • DOI

      10.7554/elife.83780

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] ACTIVATION OF HUMAN FIBROBLASTS BY CHRONIC RADIATION RATHER THAN ACUTE RADIATION2022

    • Author(s)
      Shimura T, Zaharieva E, Sasatani M, Kawai H, Kamiya K, Ushiyama A
    • Journal Title

      Radiation Protection Dosimetry

      Volume: 198 Issue: 13-15 Pages: 1098-1103

    • DOI

      10.1093/rpd/ncac065

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] DDX41 coordinates RNA splicing and transcriptional elongation to prevent DNA replication stress in hematopoietic cells2022

    • Author(s)
      Satoru Shinriki;Mayumi Hirayama;Akiko Nagamachi;Akihiko Yokoyama;Takeshi Kawamura;Akinori Kanai;Hidehiko Kawai;Junichi Iwakiri;Rin Liu;Manabu Maeshiro;Saruul Tungalag;Masayoshi Tasaki;Mitsuharu Ueda;Kazuhito Tomizawa;Naoyuki Kataoka;Takashi Ideue;Yutaka Suzuki;Kiyoshi Asai;Tokio Tani;Toshiya Inaba;Hirotaka Matsui
    • Journal Title

      Leukemia

      Volume: 36 Issue: 11 Pages: 2605-2620

    • DOI

      10.1038/s41375-022-01708-9

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      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Tailed duplex による遺伝子編集効率を上昇させる第 3 のオリゴ核酸 A'(A prime)鎖2024

    • Author(s)
      紙谷浩之、平賀史恵、上坪諒太郎、河合秀彦
    • Organizer
      ゲノム編集学会第9回大会
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      2024 Annual Research Report
  • [Presentation] A'(A prime)鎖はtailed duplexによる遺伝子編集効率を向上させる2024

    • Author(s)
      紙谷浩之、平賀史恵、上坪諒太郎、河合秀彦
    • Organizer
      第40回日本DDS学会学術集会
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      2024 Annual Research Report
  • [Presentation] Shuttle Vector (SV)-NGS法を用いた任意の変異解析ライブラリーにおけるDNA酸化損傷誘発遠隔作用変異解析2024

    • Author(s)
      藤原千穂、河合秀彦、紙谷浩之
    • Organizer
      第47回日本分子生物学会年会
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      2024 Annual Research Report
  • [Presentation] 人工ヌクレアーゼを用いない遺伝編集ツール5’-tailed duplex’における化学修飾の影響2024

    • Author(s)
      加藤太樹、上坪諒太郎、小路貴生、小泉誠、河合秀彦、紙谷 浩之
    • Organizer
      第47回日本分子生物学会年会
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      2024 Annual Research Report
  • [Presentation] 遺伝子編集用一本鎖DNAの化学修飾による変異誘発能の解析2024

    • Author(s)
      蔡豪挺、小路貴生、小泉誠、河合 秀彦、紙谷 浩之
    • Organizer
      第47回日本分子生物学会年会
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      2024 Annual Research Report
  • [Presentation] 遺伝子変異研究における新しい基盤技術の開発2024

    • Author(s)
      河合 秀彦
    • Organizer
      第149回日本薬学会中国四国支部例会
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 人工ヌクレアーゼを用いない遺伝子編集:様々な遺伝子配列の編集効率2023

    • Author(s)
      紙谷 浩之、加藤 太樹、河合 秀彦
    • Organizer
      日本分析化学会第72回年会
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  • [Presentation] supF-NGS 法を用いたガンマ線照射の変異シグネチャー解析2023

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      岩田 廉、河合 秀彦、紙谷 浩之
    • Organizer
      日本環境変異原ゲノム学会第52回大会
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  • [Presentation] 酸化損傷塩基の修復に関わる DNA グリコシラーゼの遠隔作用変異における役割2023

    • Author(s)
      藤川 芳宏、鈴木 哲矢、河合 秀彦、紙谷 浩之
    • Organizer
      日本環境変異原ゲノム学会第52回大会
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  • [Presentation] 5’-tailed duplexes による複数の置換・欠失・挿入変異の遺伝子編集2023

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      天崎 光、河合 秀彦、佐藤 健斗、加藤 太樹、紙谷 浩之
    • Organizer
      日本環境変異原ゲノム学会第52回大会
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  • [Presentation] 酸化グアニンが誘発する遠隔作用変異におけるDNAグリコシラーゼNEIL1の役割2023

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      藤川 芳宏、鈴木 哲矢、河合 秀彦、紙谷 浩之
    • Organizer
      日本放射線影響学会第66回大会
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  • [Presentation] 人工ヌクレアーゼを用いない遺伝編集ツール5’-tailed duplexの遺伝子編集能の配列依存性2023

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      加藤 太樹、河合 秀彦、紙谷 浩之
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      第46回日本分子生物学会年会
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  • [Presentation] Analysis of PCNA ubiquitination-dependent DNA damage tolerance in human cells2023

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      Rie Kanao, Hidehiko Kawai, Toshiyasu Taniguchi, Minoru Takata, Chikahide Masutani
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      AT workshop
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  • [Presentation] supF 遺伝子と Next Generation Sequencer を用いたハイスループット変異解析法の開発2022

    • Author(s)
      岩田 廉, 河合 秀彦, 紙谷 浩之
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      日本環境変異原ゲノム学会第51回大会
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  • [Presentation] 8-Oxo-7,8-dihydroguanine の遠隔作用変異への NEIL1 及び NTH1 のノックダウンの影響2022

    • Author(s)
      藤川 芳宏 , 鈴木 哲矢 , 河合 秀彦 , 紙谷 浩之
    • Organizer
      日本環境変異原ゲノム学会第51回大会
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      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 人工ヌクレアーゼを用いない遺伝子編集ツールTailed Duplexにおける配列依存性の検討2022

    • Author(s)
      上坪 諒太郎, 河合 秀彦, 紙谷 浩之
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      第61回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
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  • [Presentation] Shuttle Vector NGS 変異解析法による遠隔作用変異誘発機構解析2022

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      藤原 千穂, 海老 駿吾, 河合 秀彦, 紙谷 浩之
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      第61回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
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  • [Presentation] 次世代シークエンサーを用いたsupF遺伝子変異解析系の開発2022

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      増田 翔吾, 岩田 廉, 海老 駿吾, 河合 秀彦, 紙谷 浩之
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      第61回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
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  • [Presentation] ヒト細胞においてRFWD3はPCNAの翻訳後修飾依存的なDNA損傷トレランスに関与する2022

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      金尾 梨絵, 河合 秀彦, 谷口 俊恭, 高田 穣, 益谷央豪
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
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      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 人工ヌクレアーゼを用いない遺伝編集ツール5'-tailed duplexの遺伝子編集能の向上2022

    • Author(s)
      上坪 諒太郎, 河合 秀彦, 紙谷 浩之
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
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  • [Presentation] RFWD3 mediates a crucial pathway of PCNA ubiquitination-dependent DNA damage tolerance in human cells2022

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      Rie Kanao, Hidehiko Kawai, Toshiyasu Taniguchi, Minoru Takata, Chikahide Masutani
    • Organizer
      遺伝研国際シンポジウム2022
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] RFWD3 and TLS polymerases play crucial roles in PCNA ubiquitination-dependent DNA damage tolerance in human cells2022

    • Author(s)
      Rie Kanao, Hidehiko Kawai, Toshiyasu Taniguchi, Minoru Takata, Chikahide Masutani
    • Organizer
      Meeting on Endogenous DNA Damage and Repair
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] DDX41変異によるR-loop増加を介した細胞増殖障害2022

    • Author(s)
      神力 悟, 平山 真弓, トンガラグ・サロール, 長町 安希子, 金井 昭教, 片岡 直行, 河合 秀彦, 横山 明彦, 稲葉 俊哉, 松井 啓隆
    • Organizer
      第84回日本血液学会学術集会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Invited

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2026-01-16  

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