• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

プログラム可能な水性二相系DNA液滴の単分散生成と集積化を行うマイクロ流路の開発

Research Project

Project/Area Number 22K14528
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 27010:Transport phenomena and unit operations-related
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

鵜殿 寛岳  東京工業大学, 情報理工学院, JSPS特別研究員 (50895761)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
KeywordsDNAナノテクノロジー / マイクロ流体 / 液液相分離 / 人工細胞 / マイクロ流体デバイス / DNA / マイクロ流路
Outline of Research at the Start

DNAが相分離したDNA液滴は,塩基配列の設計により配列選択的な相互作用や分子認識能をプログラムできる.しかし,試験管内の自発的な生成に限定され,物性評価や高次構造体の構築ができていない.本研究では,高単分散な液滴の生成と操作を行うマイクロ流路を開発することで,集合的な機能と構造をプログラムできるDNA機能性流体を創出する.

Outline of Annual Research Achievements

研究代表者が2023年度に主に取り組んだことは、(1)昨年度末に査読誌から要修正として戻ってきた投稿論文(相状態の光制御が可能なDNA液滴)の修正対応および(2)演算を行うRNA液滴の研究である。(2)に関して、英文の化学・マイクロ工学系の査読誌に提出して要修正として戻ってきた。
(1)に関して査読者から要求されていた追加実験は、(A)光応答能を持つDNAの基本的な性質をより明確にするための対照実験、(B)相挙動を基礎づける熱力学的な議論に関して、定性的な議論にとどまらず定量的なデータの裏付けを与える基礎的な実験、(C)光応答DNAの挙動を用いた何らかのデモンストレーション(例えば、一方向に自走するシステム)である。このうち、(A)および(B)に関して、研究代表者は実験を完了して修正原稿に反映した。特に、マイクロ構造体の熱力学的な変数を実験的に推定することで、液滴の光誘発ダイナミクスの物理的な基礎付けを与えた点は初の試みである。(C)は、本研究の直接的な範囲ではないが、査読者が真剣に原稿を読み建設的な見解を述べていることをふまえて、この追加実験にトライした。当初案では、ガラス基板上にDNAパターンを作製して光応答するDNAとの相互作用を利用して一方向に移動させる手法を着想した。しかし、技術的なハードルおよび時間の制約から当初案は中途断念した。現在は、相分離して散在しているマイクロ構造物を遠心で集めて巨大化させることで、光応答能が非対称的に分布した構造体の作製に取り組んでいる。
(2)演算を行うRNA液滴については、先日アクセプトされた.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

査読対応で要求された追加実験が質・量ともにハードルが高い.

Strategy for Future Research Activity

査読者が要求していることがらを柔軟に解釈して,はやく再投稿する.

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2023 2022

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] DNA Droplets: Intelligent, Dynamic Fluid2022

    • Author(s)
      Udono Hirotake、Gong Jing、Sato Yusuke、Takinoue Masahiro
    • Journal Title

      Advanced Biology

      Volume: 7 Issue: 3 Pages: 2200180-2200180

    • DOI

      10.1002/adbi.202200180

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] DNA condensate capable of photocontrollable rheological change creates multi-mode DNA microflow2023

    • Author(s)
      Hirotake Udono, Shin-ichiro. M. Nomura, Masahiro Takinoue
    • Organizer
      DNA29
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] miRNAの入力に応じてAND演算を行うRNA液滴2023

    • Author(s)
      鵜殿寛岳、范敏之、齊藤洋子、大野博久、野村M.慎一郎、清水義宏、齊藤博英、瀧ノ上正浩
    • Organizer
      CBI学会分子ロボット倫理研究会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Kissing-loop相互作用により構築されたRNA液滴によるAND論理演算2023

    • Author(s)
      鵜殿寛岳、范敏之、齊藤洋子、大野博久、野村M.慎一郎、清水義宏、齊藤博英、瀧ノ上正浩
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Remotely controllable DNA microflow2022

    • Author(s)
      H. Udono, S. M. Nomura, M. Takinoue
    • Organizer
      The 26th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 光応答能を持つDNA液滴のマイクロ流れ2022

    • Author(s)
      鵜殿寛岳,野村M慎一郎,瀧ノ上正浩
    • Organizer
      第8回サイボウニクス研究会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 光制御によるDNA液滴の『ゲル-液』相転移ダイナミクスで駆動するマイクロ流れ2022

    • Author(s)
      鵜殿寛岳,野村M慎一郎,瀧ノ上正浩
    • Organizer
      第6回分子ロボティクス年次大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 遠隔操作が可能なDNA流体のマイクロ流制御2022

    • Author(s)
      鵜殿寛岳,野村M慎一郎,瀧ノ上正浩
    • Organizer
      第60回日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] DNA流体の『ゲル-液』相転移ダイナミクスにより駆動されるマイクロ流れ遠隔操作2022

    • Author(s)
      鵜殿寛岳,野村M慎一郎,瀧ノ上正浩
    • Organizer
      生物物理学会サブグループ人工細胞&分子ロボティクス第3回研究会
    • Related Report
      2022 Research-status Report

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi