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Comprehensive analysis of effectors to elucidate infection strategies of plant parasitic nematodes

Research Project

Project/Area Number 22K14904
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 39050:Insect science-related
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

Sato Kazuki  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 基礎科学特別研究員 (90842071)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Keywords植物寄生性線虫 / ネコブセンチュウ / 植物免疫 / エフェクター / 生物間相互作用 / RNA結合タンパク質 / 植物寄生線虫
Outline of Research at the Start

植物寄生線虫は世界で最も農業被害の大きい植物病原体の一つである。線虫は病原性タンパク質であるエフェクターを分泌し、植物の免疫応答を抑制することで寄生を成立させていると考えられる。しかし、線虫がどのようなエフェクターを分泌しているのか?そして植物のどの分子を標的として免疫応答をかく乱しているのか?といった分子レベルでのメカニズムの理解はほとんど進んでいない。本研究では、線虫ゲノム・トランスクリプトーム情報とハイスループットなスクリーニング手法を駆使し、線虫エフェクターの網羅的な機能解析を行なう。本研究により、寄生をめぐる線虫-植物間の分子レベルでの攻防の全体像の理解を目指す。

Outline of Final Research Achievements

Plant parasitic nematodes are among the most devastating plant pathogens worldwide. To parasite host plants, nematodes secret effectors, which are virulence factors that suppress the plant immune responses. However, our knowledge on nematode effector is limited. In this study, effector mining based on genomic and transcriptomic information of plant parasitic nematodes and functional analyses of effector candidates using a high-throughput screening strategy were carried out. As a result, novel nematode effector that targets RNA-binding protein and drastically suppresses plant immune responses was identified. This study provides new insight into the molecular level interactions that take place between nematodes and plants.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

植物寄生性線虫は多様な作物に甚大な被害を与えており、その被害額は世界全体で年間14兆円に上ると試算されている。従来、線虫の防除は毒性の強い農薬に大きく依存してきたが、人体や環境への悪影響から世界的にその使用が禁止されてきており、より持続可能な防除法への転換が求められている。本研究では、線虫のエフェクターが標的とする植物側因子の解析から、植物のRNA結合タンパク質が免疫の制御に関与しており、線虫への防御応答において重要な役割を持つことを明らかにした。このことから、将来的に線虫に強い作物を創出し、農薬に依存しすぎない線虫防除法を確立する上で、重要な知見を得ることができたといえる。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (17 results)

All 2024 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (8 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] The University of Alabama at Birmingham/University of California, Davis(米国)

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] フランス国立農学研究所(INRA)(フランス)

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] University of Bonn(ドイツ)

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] University of Cambridge(英国)

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] The University of Alabama at Birmingham/University of California, Davis(米国)

    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] フランス国立農学研究所(INRA)(フランス)

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      2022 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] University of Bonn(ドイツ)

    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] University of Cambridge(英国)

    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 免疫を負に制御するRNA結合タンパク質を標的としたネコブセンチュウエフェクターの機能解析2024

    • Author(s)
      佐藤 一輝, 門田 康弘, Pamela Gan, 植原 健人, 槇 紀子, M, Shahid Mukhtar, 白須 賢
    • Organizer
      令和6年度 日本植物病理学会大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 線虫学者はどう生きるか ~寄生虫に学ぶ研究者の多様性~2023

    • Author(s)
      佐藤一輝
    • Organizer
      令和5年度 日本植物病理学会関東部会 若手の会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] RNA結合タンパク質を標的とする線虫エフェクターの機能解析2023

    • Author(s)
      佐藤 一輝, 門田 康弘, Pamela Gan, 植原 健人, 槇 紀子, M, Shahid Mukhtar, 白須 賢
    • Organizer
      日本線虫学会 第30回大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] RNA結合タンパク質を標的とするネコブセンチュウエフェクターによる免疫抑制機構の解析2023

    • Author(s)
      佐藤 一輝, 門田 康弘, ガン パメラ, 植原 健人, 槇 紀子, ムフタル M シャヒード, 白須 賢
    • Organizer
      令和5年度 日本植物病理学会大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Understanding the molecular basis of plant and root-knot nematode interaction2022

    • Author(s)
      Kazuki Sato, Yasuhiro Kadota, Pamela Gan, Taketo Uehara, Noriko Maki, M. Shahid Mukhtar, Ken Shirasu
    • Organizer
      International Symposium on Plant Development and Biotic Interaction
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ネコブセンチュウエフェクターによる植物免疫抑制機構の解析2022

    • Author(s)
      佐藤 一輝, 門田 康弘, Gan Pamela, 植原 健人, 槇 紀子, Mukhtar M. Shahid, 白須 賢
    • Organizer
      日本線虫学会 第29回大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 植物と線虫の双方から寄生の分子メカニズムに迫る2022

    • Author(s)
      佐藤 一輝
    • Organizer
      線虫研究の未来を創る会2022
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Molecular insights into an interaction of resistant plant Solanum torvum and virulent/avirulent root-knot nematodes2022

    • Author(s)
      Kazuki Sato, Yasuhiro Kadota, Pamela Gan, Taketo Uehara, Takahiro Bino, Katsushi Yamaguchi, Yasunori Ichihashi, Hideaki Iwahori, Noriko Maki, Shuji Shigenobu, Takamasa Suzuki, Bruno Favery, Shahid M. Mukhtar, Ken Shirasu
    • Organizer
      7th International Congress of Nematology
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 理化学研究所 環境資源科学研究センター 植物免疫研究グループ

    • URL

      http://plantimmunity.riken.jp/

    • Related Report
      2023 Annual Research Report 2022 Research-status Report

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2025-01-30  

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