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Elucidation of transcription regulation mechanism through MED26 droplet formation mediated by nascent RNAs

Research Project

Project/Area Number 22K15041
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 43010:Molecular biology-related
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

SUZUKI Hidefumi  横浜市立大学, 医学部, 助教 (00793770)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Keywords遺伝子発現制御 / メディエーター複合体 / MED26 / 天然変性領域 / 液滴形成 / 新生RNA鎖 / Mediator Body / 新生RNA / 転写活性化 / Mediator Bodies / 液-液相分離 / 転写バースト
Outline of Research at the Start

最近の解析から、MED26を中心とした液滴が転写を制御していることがわかってきた。われわれは、MED26を中心とする液滴"Mediator Bodies (MBs)"が、液滴内に必要な調節因子を高密度に濃縮することで、 (i) 転写バーストを活性化し、(ii) 液滴内で転写された新生RNA鎖がMBsの液滴形成を促進・安定化する、新規の転写機構“ポジティブフィードバック制御モデル”を提唱する。本研究では、このモデルを検証し、MED26の液滴による新規の転写制御機構を解明する。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we aimed to elucidate the mechanism of transcription regulation by MED26, one of subunits of Mediator complex, through its nuclear droplet formation. The results of this study showed that MED26 interacts with various RNAs, that nascent RNAs are required for MED26 droplet formation, and that MED26 droplet formation is dependent on its intrinsically disordered region. These results of this research are expected to lead to the elucidation of a novel mechanism of transcription regulation by Mediator complex.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

メディエーター複合体は遺伝子発現制御において中心的な働きをする巨大な転写制御複合体であり、近年、その液滴形成を介した転写制御機構が世界的に注目を集めている。本研究では、その機能的サブユニットであるMED26に着目し、MED26タンパク質の液滴形成能についての解析を行うことで、メディエーター複合体の転写制御機構を解明しようと試みた。本研究によってMED26の液滴形成についての新規の知見が得られたことで、メディエーター複合体を中心とした未知の転写制御機構の解明につながると期待される。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (21 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 4 results) Presentation (16 results) (of which Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Chimera RNA transcribed from integrated HPV18 genome with adjacent host genomic region promotes oncogenic gene expression through condensate formation2024

    • Author(s)
      Furugori K, Suzuki H, Abe R, Horiuchi K, Akiyama T, Hirose T, Toyoda A, Takahashi H
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: - Issue: 7 Pages: 532-548

    • DOI

      10.1111/gtc.13121

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    • Author(s)
      Wada Taishi、Doi Hiroshi, et al.
    • Journal Title

      Annals of Neurology

      Volume: 95 Issue: 3 Pages: 607-613

    • DOI

      10.1002/ana.26848

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    • Author(s)
      Suzuki Hidefumi、Furugori Kazuki、Abe Ryota、Ogawa Shintaro、Ito Sayaka、Akiyama Tomohiko、Horiuchi Keiko、Takahashi Hidehisa
    • Journal Title

      BioEssays

      Volume: 45 Issue: 4

    • DOI

      10.1002/bies.202200178

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    • Author(s)
      Nakai Yusuke、Miyakawa Kei、Yamaoka Yutaro、Hatayama Yasuyoshi、Nishi Mayuko、Suzuki Hidefumi、Kimura Hirokazu、Takahashi Hidehisa、Kimura Yayoi、Ryo Akihide
    • Journal Title

      Microorganisms

      Volume: 10 Issue: 12 Pages: 2381-2381

    • DOI

      10.3390/microorganisms10122381

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    • Author(s)
      Kitamura Koji、Suzuki Hidefumi、Abe Ryota、Inohara Hidenori、Kaneda Yasufumi、Takahashi Hidehisa、Nimura Keisuke
    • Journal Title

      Cell & Bioscience

      Volume: 12 Issue: 1 Pages: 92-92

    • DOI

      10.1186/s13578-022-00812-8

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      第45回日本分子生物学会年会
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Published: 2022-04-19   Modified: 2025-01-30  

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