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Elucidation of the mechanism of arrestin activation by G protein-coupled receptors using nuclear magnetic resonance

Research Project

Project/Area Number 22K15052
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 43020:Structural biochemistry-related
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

Shiraishi Yutaro  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 研究員 (10894412)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Keywords核磁気共鳴法 / アレスチン / Gタンパク質共役型受容体 / 核磁気共鳴分光法
Outline of Research at the Start

β-アレスチンは、リガンドにより膜貫通ドメイン (TM core) が活性化され、かつC末端領域 (C tail) がリン酸化されたGPCRに結合することで、細胞内シグナルを制御する。しかしながら、TM coreとC tailが、それぞれ β-アレスチンの結合親和性・構造変化をどのように制御しているかは不明である。本研究では、TM coreの活性化状態、C tailのリン酸化状態を制御したGPCRを調製したうえで、これらがβ-アレスチンの結合親和性・構造変化をそれぞれどのように変化させているかを、核磁気共鳴 (NMR) 法を用いた相互作用解析により解析する。

Outline of Final Research Achievements

β-arrestins (βarrs) play multifaceted roles in the function of G protein-coupled receptors (GPCRs). βarrs typically interact with phosphorylated C-terminal tail (C tail) and transmembrane core (TM core) of GPCRs. However, the effects of the C tail- and TM core-mediated interactions on the conformational activation of βarrs have remained elusive. Here, we show the conformational changes for βarr activation upon the C tail- and TM core-mediated interactions with a prototypical GPCR by nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy. Our NMR analyses demonstrated that while the C tail-mediated interaction alone induces partial activation, in which βarr exists in equilibrium between basal and activated conformations, the TM core- and the C tail-mediated interactions together completely shift the equilibrium toward the activated conformation. This plasticity of βarr conformation in complex with GPCRs engaged in different binding modes may explain the multifunctionality of βarrs.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究により、医薬品と結合したGPCRによるβarrの活性化が、GPCRのC tailを介した強い結合による複合体形成と、TM coreとの弱い結合により誘起される構造変化の2段階で達成される動的な過程であることが明らかとなった。GPCRを標的とした医薬品のβarr活性化能は、従来はβarrの結合親和性のみを指標としてたが、本研究の結果は、βarrの構造変化を指標に加えることで、医薬品によるアレスチン活性化能をより正確に評価できることを示している。この活性評価法は、GPCRを標的とした新しい医薬品の開発に貢献すると考えられる。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] インド工科大学(インド)

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Journal Article] NMR Characterization of the Papain-like Protease from SARS-CoV-2 Identifies the Conformational Heterogeneity in Its Inhibitor-Binding Site2023

    • Author(s)
      Shiraishi Yutaro、Shimada Ichio
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 145 Issue: 30 Pages: 16669-16677

    • DOI

      10.1021/jacs.3c04115

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Function-Related Conformational Dynamics of GPCRs Revealed by Solution NMR2022

    • Author(s)
      UEDA Takumi、KOFUKU Yutaka、TAKEUCHI Koh、IMAI Shunsuke、SHIRAISHI Yutaro、SHIMADA Ichio
    • Journal Title

      Nihon Kessho Gakkaishi

      Volume: 64 Issue: 4 Pages: 279-284

    • DOI

      10.5940/jcrsj.64.279

    • ISSN
      0369-4585, 1884-5576
    • Year and Date
      2022-12-15
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] SARS-CoV-2由来パパイン様プロテアーゼの阻害剤結合ポケットが示す構造柔軟性2023

    • Author(s)
      白石勇太郎,嶋田一夫
    • Organizer
      第62回NMR討論会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 交換モンテカルロ法を利用した、タンパク質の動的構造平衡と機能の解明2023

    • Author(s)
      上田卓見,今井駿輔,横溝智貴,猪野麻巳子,白石勇太郎,幸福裕,竹内恒,嶋田一夫
    • Organizer
      第62回NMR討論会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] マイクロ RNA 前駆体 pre-miR-21 の構造平衡が成熟阻害剤の活性へ及ぼす影響の NMR 解析2023

    • Author(s)
      西村優平,徳永裕二,幸福裕,白石勇太郎,今井駿輔,嶋田一夫,竹内恒
    • Organizer
      第62回NMR討論会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Structural equilibrium underlying ligand-dependent activation of b2-adrenoreceptor2022

    • Author(s)
      Imai Shunsuke, Yokomizo Tomoki, Kofuku Yutaka, Shiraishi Yutaro, Ueda Takumi, Shimada Ichio
    • Organizer
      29th International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Biphasic activation of β-arrestin 1 upon interaction with a GPCR revealed by methyl-TROSY NMR2022

    • Author(s)
      Shiraishi Yutaro, Kofuku Yutaka, Ueda Takumi, Pandey Shubhi, Dwivedi-Agnihotri Hemlata, Shukla Kumar Arun, Shimada Ichio
    • Organizer
      29th International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] GPCRとの相互作用によるβ-アレスチン1の2段階活性2022

    • Author(s)
      白石 勇太郎, 幸福 裕, 上田 卓見, Pandey Shubhi, Dwivedi-Agnihotri Hemlata, Shukla K. Arun, 嶋田 一夫
    • Organizer
      第61回NMR討論会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Gタンパク質共役型受容体b2ARのリガンド依存的活性化機構2022

    • Author(s)
      今井 駿輔, 横溝 智貴, 幸福 裕, 白石 勇太郎, 上田 卓見, 嶋田 一夫
    • Organizer
      第61回NMR討論会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] アデノシンA2A受容体とリガンドの滞在時間を規定する構造基盤の解明2022

    • Author(s)
      上田 卓見, 土田 知輝, 栗田 政稔, 水村 拓也, 今井 駿輔, 白石 勇太郎, 幸福 裕, 竹内 恒, 嶋田 一夫
    • Organizer
      第61回NMR討論会
    • Related Report
      2022 Research-status Report

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Published: 2022-04-19   Modified: 2025-01-30  

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