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Elucidation of Shu exclusion in cytoplasmic droplet Yb bodies and its application to droplet-specific proteomes

Research Project

Project/Area Number 22K15056
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 43030:Functional biochemistry-related
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

Hirakata Shigeki  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (40844791)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
KeywordspiRNA / Shutdown / トランスポゾン / 無精子症 / FKBP6 / Yb body / ミトコンドリア / 液-液相分離 / プロテオーム
Outline of Research at the Start

動物の生殖組織に特異的な小分子RNAであるpiRNAは、トランスポゾンの抑制に働く。ショウジョウバエ卵巣体細胞(OSC)では、液-液相分離(LLPS)によって形成される非膜系オルガネラYb bodyにおいてpiRNAの生合成が行われる。piRNA生合成因子ShuはYb bodyにpiRNA結合タンパク質Piwiをリクルートするものの、自身はYb bodyには蓄積せず排除される。本研究では、ShuがYb bodyから排除される機構を解明するとともに、この機構を応用して、Shuの排除が持つ生理的意義の解明やYb body特異的なタンパク質標識技術の確立を目指す。

Outline of Final Research Achievements

In Drosophila ovarian somatic cells, Shu recruits Piwi to the cytoplasmic granule Yb body, but Shu quickly leaves the granule. In this study, I investigated the mechanism of this process and clarified that repulsion between Shu is important for Shu release. I also found that Shu release is essential for Piwi to leave the Yb body in a later process, and I have identified a region responsible for Shu repulsion. In addition, I found the existence of feedback regulation in the piRNA biogenesis pathway and that a mutation reported in human azoospermia prevents the release of Shu.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究の成果は、piRNA生合成経路の全容解明、特に、PiwiがpiRNAの生合成過程に応じて細胞内局在を変えていく機構を理解する上で重要である。加えて、Shuの反発に働く領域を同定できたため、今後はこれを応用してYb body特異的近接依存標識法の確立に取り組むことができる。また、当初想定していなかった成果として、ヒト不妊の原因変異がもたらすpiRNA経路の異常について新しい知見が得られた。本成果は医療応用、特に不妊治療への貢献が期待できる。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2023 2022 Other

All Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (2 results)

  • [Presentation] ショウジョウバエ卵巣体細胞におけるpiRNA生合成の場Yb bodyへのPiwi局在化機構とその制御2023

    • Author(s)
      平形 樹生, 藤田 あおい, 塩見 美喜子
    • Organizer
      第75回日本細胞生物学会大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Mechanism and regulation of Piwi localization to Yb body, the site of piRNA biogenesis in Drosophila ovarian somatic cells2023

    • Author(s)
      Shigeki Hirakata, Aoi Fujita, Yumiko Tomoe, Mikiko C. Siomi
    • Organizer
      The 28th Annual Meeting of the RNA Society
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ショウジョウバエ卵巣体細胞におけるpiRNA生合成の場Yb bodyへのPiwi局在化のメカニズムとその制御2022

    • Author(s)
      平形 樹生, 藤田 あおい, 巴 裕美子, 塩見 美喜子
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Mechanism and regulation of Piwi localization to Yb bodies the piRNA biogenesis center in Drosophila ovarian somatic cells2022

    • Author(s)
      Shigeki Hirakata, Aoi Fujita, Yumiko Tomoe, Mikiko C. Siomi
    • Organizer
      第23回日本RNA学会年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Remarks] 塩見研究室ホームページ

    • URL

      http://www-siomilab.biochem.s.u-tokyo.ac.jp/

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Remarks] 塩見研究室ホームページ

    • URL

      http://www-siomilab.biochem.s.u-tokyo.ac.jp/index.html

    • Related Report
      2022 Research-status Report

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Published: 2022-04-19   Modified: 2025-01-30  

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