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Multi-component linking strategy for the natural product drug discovery.

Research Project

Project/Area Number 22K15241
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 47010:Pharmaceutical chemistry and drug development sciences-related
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

Katsuyama Akira  北海道大学, 薬学研究院, 助教 (20824709)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywords創薬化学 / ペプチド / 構造最適化 / ペプチドスキャニング / ケミカルライゲーション / 構造活性相関研究 / 天然物 / 化合物ライブラリー / 抗菌薬 / 薬剤耐性菌 / 有機合成化学
Outline of Research at the Start

中分子天然物は低分子が標的とすることが困難な標的に対しても作用することが可能であり、新規医薬品のリード化合物としてのポテンシャルを秘めている。従来の全合成を基盤とした逐次的な方法では、多数の誘導体合成の段階に多大な労力を有する。この問題に対して申請者はこれまで、「天然物ビルドアップライブラリー戦略」を考案し、天然物誘導体を迅速に合成する方法論を確立してきた。本申請課題では、天然物ビルドアップライブラリーを多成分連結型へと発展させることで、既存の天然物誘導体ライブラリーを飛躍的に上回る大規模ライブラリーを構築する。また、構築したライブラリーを用いて、細菌感染症治療薬のリード化合物の獲得を目指す。

Outline of Final Research Achievements

As structural modification of natural products with complex structures is labour intensive, there is a need to improve the efficiency of this step. The primary objective of this study was to develop a multi-component linking strategy for structural optimization of peptide-based natural products. This method allows the introduction of multiple chemical modifications in natural products. To demonstrate the efficacy of this method, the antimicrobial natural product polymyxin B was used in this study. Using a serine-threonine ligation (STL), a number of derivatives were synthesised comprehensively and successfully modified for antimicrobial activity.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

細菌による感染症は、現代の公衆衛生においても再び脅威となりつつあるが、どのような感染症が流行するかを事前に予測し、それに対して適切な抗菌薬を開発するのは困難である。こうした疾患に対しては、多数の性質の異なる候補化合物を迅速に提供することが重要であり、抗菌ペプチドポリミキシンを用いて抗菌スペクトルを迅速に改変できた事実は、予測の難しい感染症に対して本研究で確立した手法が機能することを示している。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2023 2022

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (3 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Solid-Phase Synthesis of Nannocystin Ax and Its Analogues2023

    • Author(s)
      Miyakita Daiki、Kawanishi Kohei、Katsuyama Akira、Yamamoto Kazuki、Yakushiji Fumika、Ichikawa Satoshi
    • Journal Title

      The Journal of Organic Chemistry

      Volume: 88 Issue: 15 Pages: 11367-11371

    • DOI

      10.1021/acs.joc.3c01189

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Solid-Phase Total Synthesis of Sandramycin and Its Analogues2023

    • Author(s)
      Komatani Yuya、Momosaki Kyoka、Katsuyama Akira、Yamamoto Kazuki、Kaguchi Rintaro、Ichikawa Satoshi
    • Journal Title

      Organic Letters

      Volume: 25 Issue: 3 Pages: 543-548

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.2c04327

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Discovery of Biologically Optimized Polymyxin Derivatives Facilitated by Peptide Scanning and In Situ Screening Chemistry2023

    • Author(s)
      Kaguchi R, Katsuyama A, Sato T, Takahashi S, Horiuchi M, Yokota SI, Ichikawa S
    • Journal Title

      J Am Chem Soc

      Volume: 145 Issue: 6 Pages: 3665-3681

    • DOI

      10.1021/jacs.2c12971

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 人工核酸抗体の開発を指向したサンドラマイシン誘導体の合成研究2022

    • Author(s)
      駒谷優弥、百﨑恭佳、勝山彬、山本一貴、市川聡
    • Organizer
      第34回 万有札幌シンポジウム
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] スレオニルジアミノブタン酸スキャニングを用いたポリミキシン耐性菌に有効な創薬リードの創製2022

    • Author(s)
      家口凜太郎、勝山彬、佐藤豊孝、堀内基広、横田伸一、市川聡
    • Organizer
      第64回天然有機化合物討論会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] ビルドアップ法に基づくコリスチン誘導体の多数供給と評価2022

    • Author(s)
      家口凜太郎、勝山彬、喜多俊介、前仲勝実、市川聡
    • Organizer
      日本薬学会北海道支部第149回例会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] スキャニング用アミノ酸化合物、スキャニング用改変ペプチド、スキャニング用キット及びペプチドの活性部位のスキャニング方法2023

    • Inventor(s)
      市川聡、勝山彬、家口凜太郎
    • Industrial Property Rights Holder
      市川聡、勝山彬、家口凜太郎
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2025-01-30  

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