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Determination of immunodestructive mechanism and development of prediction marker of disease severity in COVID-19

Research Project

Project/Area Number 22K15675
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 52010:General internal medicine-related
Research InstitutionJuntendo University

Principal Investigator

武井 理美  順天堂大学, 医学部, 助教 (80939968)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2024: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
KeywordsCOVID-19 / シングルセルRNA-seq / サイトカイン
Outline of Research at the Start

COVID-19患者の数%は重症化し致死的な経過を辿り、ワクチン接種後の感染例でも重症化の報告がある。大量の感染者の中から重症化する症例を予測し、適切な治療を実施するための重症化識別マーカーを確立することは、治療・予防法の開発と共に喫緊の課題である。本研究では重症化に伴う特定の免疫応答を明らかにし、重症化に先行して変化する免疫細胞/サイトカイン(=重症化予測マーカー)を同定する。

Outline of Annual Research Achievements

新型コロナウイルス感染症 (COVID-19) は世界的な流行を引き起こし、ワクチン接種で得られた抗体からの逃避能力を獲得した感染力の強い変異株の流行が拡大している。COVID-19患者の数%は重症化し致死的な経過を辿り、ワクチン接種後の感染例でも重症化の報告がある。このような状況において、大量の感染者の中から重症化する症例を予測し、適切な治療を実施するための重症化識別マーカーを確立することは、治療・予防法の開発と共に喫緊の課題である。そこで、本研究ではこれらの発見に立脚し、重症化に伴う特定の免疫応答を明らかにし、重症化に先行して変化する免疫細胞/サイトカイン(=重症化予測マーカー)を同定する。
当該年度の研究では、SARS-CoV-2に感染した患者から回収した末梢血単核細胞を用いて single cell RNA-seq解析を行った。また、SARS-CoV-2に感染した患者やワクチンを2回接種した医療従事者から採取した血清を用いて、中和抗体活性、抗S蛋白抗体:IgG, IgM、抗N蛋白体:IgG, IgMについて測定し、臨床情報と合わせて評価した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本年度の研究では、SARS-CoV-2に感染した患者6名分の末梢血単核細胞を用いてsingle cell RNA-seq解析を実施した。ワクチン接種前の患者の内、致命的な経過を辿った患者と回復した患者の2グループに分け、T細胞受容体とB細胞受容体の免疫反応を解析した。それぞれの受容体の多様性と患者の回復の指標となる予後マーカーを探索している。また、SARS-CoV-2に感染した患者やワクチンを2回接種した医療従事者から採取した血清を用いた抗体検査を実施し抗S IgG抗体価が中和能を反映しているか評価した。

Strategy for Future Research Activity

今後の研究では、single cell RNA-seq解析を進め、シングルセルレベルで免疫細胞クラスターの増減を検出し、受容体の多様性と患者の回復の指標となるマーカーを同定する。
SARS-CoV-2抗体検査に関しても引き続き解析を続ける。

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 8 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] The epidemiology of pulmonary Mycobacterium abscessus species in Japanese population2024

    • Author(s)
      Ihara Hiroaki、Kondo Kanami、Muto Yuki、Haba Manami、Nakazawa Hiroki、Handoh Tetsuya、Arai Yuta、Shibayama Kohei、Sumiyoshi Issei、Ochi Yusuke、Watanabe Junko、Takei Satomi、Nakamura Ayako、Fujimoto Yuichi、Togo Shinsaku、Takahashi Kazuhisa
    • Journal Title

      Journal of Infection and Chemotherapy

      Volume: - Issue: 8 Pages: 757-767

    • DOI

      10.1016/j.jiac.2024.02.018

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Isolation and identification of Wickerhamiella tropicalis from blood culture by MALDI-MS2024

    • Author(s)
      Takei Satomi、Teramoto Kanae、Fujimura Junya、Fujiwara Megumi、Suzuki Mai、Fukui Yukiko、Sekiguchi Yuji、Kawakami Takaaki、Chonan Masayoshi、Wakita Mitsuru、Horiuchi Yuki、Miida Takashi、Naito Toshio、Kirikae Teruo、Tada Tatsuya、Tabe Yoko
    • Journal Title

      Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

      Volume: 14

    • DOI

      10.3389/fcimb.2024.1361432

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Investigation of the individual genetic evolution of SARS-CoV-2 in a small cluster during the rapid spread of the BF.5 lineage in Tokyo, Japan2023

    • Author(s)
      Jin Bo、Oyama Rieko、Tabe Yoko、Tsuchiya Koji、Hando Tetsuya、Wakita Mitsuru、Yan Yan、Saita Mizue、Takei Satomi、Horiuchi Yuki、Miida Takashi、Naito Toshio、Takahashi Kazuhisa、Ogawa Hideoki
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 14

    • DOI

      10.3389/fmicb.2023.1229234

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Assessment of antibody dynamics and neutralizing activity using serological assay after SARS-CoV-2 infection and vaccination2023

    • Author(s)
      Takahashi T, Ai T, Saito K, Nojiri S, Takahashi M, Igawa G, Yamamoto T, Khasawneh A, Paran FJ, Takei S, Horiuchi Y, Kanno T, Tobiume M, Hiki M, Wakita M, Miida T, Okuzawa A, Suzuki T, Takahashi K, Naito T, Tabe Y
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 18 Issue: 9 Pages: e0291670-e0291670

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0291670

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A Systemic Lupus Erythematosus Patient with Cutaneous <i>Mycobacterium haemophilum</i> Infection under Belimumab Treatment: A Case Report2023

    • Author(s)
      Kim Jonghun、Hasegawa Toshio、Tada Kurisu、Uehara Yuki、Fukui Yukiko、Nakamura Ayako、Takei Satomi、Mitarai Satoshi、Aono Akio、Ikeda Shigaku
    • Journal Title

      Annals of Dermatology

      Volume: 35

    • DOI

      10.5021/ad.21.077

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Open Access
  • [Journal Article] Performance evaluation of the Ortho VITROS SARS-CoV-2 Spike-Specific Quantitative IgG test by comparison with the surrogate virus neutralizing antibody test and clinical assessment2023

    • Author(s)
      Takahashi M, Saito K, Ai T, Nojiri S, Khasawneh A, Paran FJ, Horiuchi Y, Takei S, Yamamoto T, Wakita M, Hiki M, Miida T, Naito T, Takahashi K, Tabe Y
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 18 Issue: 1 Pages: e0279779-e0279779

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0279779

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Performance evaluation of the Roche Elecsys? Anti-SARS-CoV-2 immunoassays by comparison with neutralizing antibodies and clinical assessment2022

    • Author(s)
      Takei S, Ai T, Yamamoto T, Igawa G, Kanno T, Tobiume M, Hiki M, Saito K, Khasawneh A, Wakita M, Misawa S, Miida T, Okuzawa A, Suzuki T, Takahaishi K, Naito T, Tabe Y
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 17 Issue: 9 Pages: 0274181-0274181

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0274181

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Activation of SARS-CoV-2 neutralizing antibody is slower than elevation of spike-specific IgG, IgM, and nucleocapsid-specific IgG antibodies2022

    • Author(s)
      Takahashi M, Ai T, Sinozuka K, Baba Y, Igawa G, Nojiri S, Yamamoto T, Yuri M, Takei S, Saito K, Horiuchi Y, Kanno T, Tobiume M, Khasawneh A, Paran FJ, Hiki M, Wakita M, Miida T, Suzuki T, Okuzawa A, Takahashi K, Naito T, Tabe Y
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12 Issue: 1

    • DOI

      10.1038/s41598-022-19073-z

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 3種のタンパク質をバイオマーカーとしたMALDI-MSプロテオタイピングによるMycobacterium abscessus complex の亜種分類2024

    • Author(s)
      武井理美、寺本華奈江、関口勇地、井原宏彰、遠矢真理、岩本慎一、田中耕一、Abdullah Khasawneh、三澤成毅、内藤俊夫、切替照雄、多田達哉、田部陽子
    • Organizer
      第35回日本臨床微生物学会総会・学術集会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Identification of Mycobacterium abscessus complex using the peaks of ribosomal protein L29, L30 and hemophore-related protein by MALDI-MS proteotyping2023

    • Author(s)
      Satomi Takei, Kanae Teramoto, Yuji Sekiguchi, Hiroaki Ihara, Mari Tohya, Shinichi Iwamoto, Koichi Tanaka, Abdullah Khasawneh, Shigeki Misawa, Toshio Naito, Teruo Kirikae, Tatsuya Tada, Yoko Tabe
    • Organizer
      3rd International BMS Symposium 2023 in Kyoto
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] MALDI-MS プロテオタイピングによるMycobacterium abscessus complex の亜種分類2023

    • Author(s)
      武井理美、寺本華奈江、関口勇地、井原宏彰、遠矢真理、岩本慎一、田中耕一、Abdullah Khasawneh、三澤成毅、内藤俊夫、切替照雄、多田達哉、田部陽子
    • Organizer
      第70回日本臨床検査医学会学術集会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] ミャンマーの医療施設で分離されたNew Delhi metallo-β-lactamase(NDM)産生のKlebsiella pneumoniae の分子疫学解析2023

    • Author(s)
      武井理美、Yu Jie Lu 、遠矢真理、渡邉心、三澤成毅、田部陽子、三井田 孝、San Mya 、Htay Htay Tin 、多田達哉、切替照雄
    • Organizer
      第34回日本臨床微生物学会総会・学術集会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Book] 抗菌薬の併用効果の検査法2023

    • Author(s)
      武井理美
    • Total Pages
      3
    • Publisher
      近代出版
    • Related Report
      2023 Research-status Report

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Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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