| Project/Area Number |
22K16120
|
|---|
| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
|
| Allocation Type | Multi-year Fund |
|---|
| Review Section |
Basic Section 53020:Cardiology-related
|
|---|
| Research Institution | Institute of Physical and Chemical Research |
|---|
Principal Investigator |
宮澤 一雄 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 研究員 (10843609)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2027-03-31
|
| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
|
| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2026: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2025: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2024: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2023: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
|
|---|
| Keywords | 心房細動 / ゲノムワイド関連解析 / レアバリアント / マルチオミックス解析 / 精密化医療 |
|---|
| Outline of Research at the Start |
疾患の遺伝構造は民族間で異なることが知られている。しかし、心房細動のゲノム研究の多くはヨーロッパ人を中心に解析されているため、非ヨーロッパ人での遺伝構造は十分に解明されていない。本研究は日本で最大規模であるバイオバンクジャパンのデータを解析することで、疾患に関連する民族特異的な遺伝子多型を同定する。そしてエピゲノムやトランスクリプトームなどのデータと統合したマルチオミックス解析を行うことで、より詳細な疾患の病態生理を明らかにする。更に、これらの結果を実際の臨床医療に応用するため、ゲノム情報に基づいた疾患の層別化や新しいゲノム創薬へと繋げることで、心房細動の精密化医療の実現を進める。
|
| Outline of Annual Research Achievements |
昨年度は一般集団における頻度の高いコモンバリアンを用いて心房細動と関連するバリアントの同定を行ったが、今年度はwhole-genome sequenceのデータを使用し集団において頻度の低いレアバリアントと心房細動との関連解析を実施した。使用したデータは、新しくwhole-genome sequencingを行った心房細動のサンプルを用いた。このサンプルは、コモンバリアントの解析で用いた心房細動サンプルから若年発症のサンプルを抽出し、さらに共同研究機関から提供された心房細動のサンプルを加えた。コントロールサンプルとして、理化学研究所生命医科学研究センターが所有するバイオバンクジャパンからwhole-genome sequenceを施行した非心房細動サンプルを対象とした。シークエンスデータはクオリティーチェックを行い解析に用いるバリアントを選定し、さらにレアバリアントに絞るためバリアントのフィルタリングとアノテーションを行なった。ケース・コントロールの解析では、遺伝子に対する影響力の大きいレアバリアントを遺伝子ごとにまとめて心房細動との関連解析を実施し、関連遺伝子の同定を行った。さらに心房細動のサンプルだけを用いたケース内の解析では、いくつかの遺伝子が心房細動の発症年齢と関わることが示唆された。これらの結果に関して、当研究所内での議論や海外での学会発表を通して多くの研究者と意見交換を行い、解析手法の追加と改善に繋げることとした。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
昨年度はコモンバリアントの解析を実施し、得られた疾患関連領域の機能解析を進める予定であった。しかし、実際の機能解析を進める前に、レアバリアントも含めた網羅的なゲノムデータの構築が必要と判断し、今年度はwhole-genome sequenceのデータを用いたレアバリアントの同定とその関連解析を実施した。実際に、ケースコントロールの関連解析ではこれまでに報告のある心房細動の関連遺伝子を同定し、さらにケース内解析を行うことで疾患の病態と関連する遺伝子も複数候補が挙げられた。この網羅的なゲノムデータの構築と関連解析の結果から、次年度は疾患の病態解明を目指した機能解析へと繋げることができ、進捗状況としては問題なく進められていると考える。
|
| Strategy for Future Research Activity |
今後はこれまでに得られたゲノムデータとその関連解析の結果を用いて、疾患の病態生理を理解するための機能解析を進める。具体的には遺伝子発現量やクロマチン修飾、プロテオーム、メタボロームといったオミックスデータと統合解析を実施する。さらに臨床実装を目指したリスクスコアを構築し、独立したコホートデータに適用して臨牀応用に向けた性能評価を進める。
|
