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多種肺線維症マウスモデル間のシングルセル解析データ比較による炎症細胞機能の解析

Research Project

Project/Area Number 22K16195
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 53030:Respiratory medicine-related
Research InstitutionThe University of Tokushima

Principal Investigator

小山 壱也  徳島大学, 病院, 助教 (90724089)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2024-03-31
Project Status Discontinued (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Keywords肺線維症 / マクロファージ / 炎症細胞 / シングルセル解析
Outline of Research at the Start

本研究の目的は様々なマウスモデルでの肺線維化を炎症細胞の関与という視点から探究することである。特にシリカ誘発性肺線維症モデルとブレオマイシン(BLM)誘発性肺線維症モデルにおけるシングルセル解析のデータを元に1) マクロファージをはじめとする肺線維化促進に関わる共通の炎症細胞を同定し機能を解析するとともに、2) 肺線維化の改善に関わる炎症細胞を解明し治療標的を明らかにする。

Outline of Annual Research Achievements

マウスのブレオマイシンモデル及びシリカモデルにおける肺線維症に関わるマクロファージの違いを検討するため、それぞれのモデルでシングルセル解析を実施した。マウスにシリカを気管内投与しDay0、Day14, Day42にサクリファイス、またブレオマイシンを気管内投与しDay7, 14, 21にサクリファイスし、CD45陽性細胞をcell sorterで採取しsc RNA-seqを実施した(各群3匹分をまとめた)。回収したCD45陽性細胞をcell sorterで採取しsc RNA-seqを実施した(各群3匹分をまとめた)。scRNAseqデータではマクロファージはCluster0(Spp1, Ccl2, AA467197, Inhba, Gpnmb, Fabp5が高発現)、Cluster1(Plac8, Ly6c2, Thbs1, Ifitm3, Ccr2, F13a1が高発現)、Cluster2(Plet1, Lpl, Wfdc21, Chil3, Car4, Mrc1が高発現)、Cluster3(Dusp16, Zfp36l1, Pou2f2, Pglyrp1, Itgal, Adgre4が高発現)の4つの群に分けられた。Cluster0でprofibrotic geneが高発現でありprofibroticマクロファージに該当するpopulationと考えられた。ブレオマイシンモデルとシリカモデルでそれぞれに特異的なマクロファージ群は特定されなかった。他の施設のデータではシリカモデルで特異的なマクロファージが見られとする報告もあり、他データとの比較や解析方法の再検討を行いそれぞれに特徴的な線維化過程を検討していく予定である。

Report

(2 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (1 results)

All 2022

All Presentation (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Presentation] Evaluation of fibrocytes in silica-induced and bleomycin-induced pulmonary fibrosis model in mice by single cell RNA-seq analysis.2022

    • Author(s)
      Kazuya Koyama, Seidai Sato, Hiroshi Kawano, Atsushi Mitsuhashi, Kojin Murakami, Yuya Yamashita, Keiko Haji, Kozo Kagawa, Hirohisa Ogawa, Yasuhiko Nishioka
    • Organizer
      Asian Pacific Society of Respirology
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2025-02-13  

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