| Project/Area Number |
22K16319
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 54010:Hematology and medical oncology-related
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
Yamamoto Keita 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 助教 (70899301)
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| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
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| Keywords | CRISPR／Cas１３ / 膜の無い構造体 / BiFC / NanoBiT / Split-TurboID / split-TurboID |
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| Outline of Research at the Start |
細胞内には複数の蛋白質と核酸によって形成される膜の無い構造体（MOs: Membraneles Organelles）が多数存在している。MOsは細胞内で様々な機能を有していると考えられるが、その生物学的役割の多くは謎に包まれている。MOsの形成や機能には蛋白質-RNA相互作用が重要な役割を担っていると考えられる。
申請者は蛋白質-RNA相互作用を調べるため、CRISPR/Cas13を応用した新技術を開発した。本研究ではこの技術を応用し、代表的なMOsの一つであるパラスペックルを対象に、MOs形成における蛋白質-RNA相互作用の役割を明らかにすることを目標とする。
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| Outline of Final Research Achievements |
Inside the cells, there are many structures composed of proteins and nucleic acids. Because they exist without membranes, they are called membraneless organelles (MOs). MOs are expected to have a lot of functions, most of which have not been elucidated. To establish the technique to analyze the function of MOs, we combined CRISPR/Cas13 systems and BiFC, NanoBiT, and Split-TurboID, and developed novel methods. We named them BiFC-dCas13, NanoBiT-dCas13, and Split-TurboID-dCas13, respectively. They are useful for understanding the interaction between protein and RNA, which is important for MOs.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
細胞内には膜のない構造体と呼ばれる蛋白質とRNAの複合体が多数あります。その役割については大部分が未解明です。膜のない構造体の機能を明らかにするため、RNAを標的とするCRISPR/CasシステムのCRISPR/Cas13とBiFC、NanoBiT、Split-TurboIDの三つの技術を組み合わせた新しいシステムを開発し、代表的な膜の無い構造体「パラスペックル」の解析を行いました。
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