| Project/Area Number |
22K16349
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 54020:Connective tissue disease and allergy-related
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| Research Institution | Osaka University (2023)
Ehime Prefectural University of Health Science (2022) |
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Principal Investigator |
荒川 裕也 大阪大学, 大学院医学系研究科, 助教 (30733175)
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| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
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| Keywords | PHF2 / CD4T細胞 / ヒストンメチル化 / エピジェネティクス / ふたご研究 / GWAS / EWAS / RNA-Seq / Phf2 / 遺伝子欠損マウス / アトピー性皮膚炎 / CD4 T細胞 / アレルギー / ヒストン修飾 / T細胞 / ノックアウトマウス / 免疫疾患 |
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| Outline of Research at the Start |
T細胞は、生体防御に働く正の側面のほか、免疫疾患を引きおこす負の側面も持っており、身体の恒常性を維持するためにはT細胞における免疫制御が重要である。T細胞の免疫制御には、ヒストンへの化学的修飾などを介して遺伝子発現変化が生じるエピジェネティック調節が働いているが、その制御機構は明らかでない。そこで本研究では、T細胞のエピジェネティック調節異常による免疫疾患の解明を行う。具体的には、ヒストンH3K9脱メチル化酵素Phf2によるT細胞制御に焦点をあて、遺伝子欠損マウスモデルを用いた免疫疾患の解明を目的とする。本研究の成果により、新たな免疫疾患の発見や治療法の開発につながることが期待できる。
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| Outline of Annual Research Achievements |
R4年度において、我々はPhf2KOマウスを用いてPhf2がIL4発現亢進およびアレルギー増悪に関与している可能性を明らかにし、R5年度において、その結果をCytokine誌に公表した（Yuya Arakawa, Yuzuki Tano, Moe Fujii, Yuuki Imai, Yoshiaki Norimatsu, Masaki Yasukawa, Mikio Watanabe, Takeshi Yamada, The H3K9 demethylase plant homeodomain finger protein 2 regulates interleukin 4 production in CD4+ T cells, 2024 Mar:175:156506）。また、ヒトの双生児検体を用いて、Phf2が制御している遺伝子発現を推定するためRNA-seqデータを用いた発現量解析を行った。さらにPhf2発現に影響する遺伝因子（一塩基多型；SNP）および環境因子（DNAメチル化）を明らかにするためGWASおよびEWAS解析を行った。その結果、Phf2はTh2分化に関連するいくつかの遺伝子発現に影響している可能性を見出した。また、PHF2発現を制御するいくつかのSNPを発見し、PHF2発現量と関連するSNPリスクスコアを作成した。この結果は、日本双生児研究学会第38回学術講演会で発表を行った。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
予定通り、ヒトにおけるPHF2機能の解析が進行している。
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| Strategy for Future Research Activity |
R6年度は、PHF2によるヒトの形質への影響について解析を行う。対象形質として、白血球分画、IgE抗体価、アレルギーの有無、抗核抗体価、抗甲状腺自己抗体価など免疫に関わるものを優先的に解析する。また、GEOデータベースよりアレルギーを対象としたRNA-seq研究データを引用し、再現性を検証する。さらに、PHF2以外のH3K9メチル化関連酵素についても同様の解析（発現量解析、GWAS、EWASなど）を行い、PHF2の結果と比較を行う。
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