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Comprehensive comparative genomic analysis of oral streptococci to explore the genetic characteristics of the pathogen causing infectious endocarditis

Research Project

Project/Area Number 22K16380
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 54030:Infectious disease medicine-related
Research InstitutionKurume University

Principal Investigator

Okuno Miki  久留米大学, 医学部, 講師 (30814462)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Keywords口腔レンサ球菌 / 比較ゲノム解析 / 全ゲノムシークエンス / NGS / ゲノム比較解析
Outline of Research at the Start

本研究では、感染性心内膜炎 (Infective endocarditis; IE) の主要な起因菌の一つである、口腔レンサ球菌に着目し、IE発症に関わる遺伝的因子および感染メカニズムの解明を試みる。IEは、細菌が心臓の内腔を覆う心内膜の表面または弁膜に感染して感染巣を形成することで起こるが、発症に関わる病原因子は明確になっていない。本研究では、IE起因菌と口腔内常在菌との全ゲノム比較解析を実施し、IE起因菌の遺伝的特徴を明らかにする。

Outline of Final Research Achievements

To gain insight into the pathogenesis of Infectious endocarditis and the development of prevention and treatment, I performed a comparative genomic analysis between the causative bacteria of infectious endocarditis and oral commensals. No phylogenetic bias was observed between the causative bacteria and oral commensals of both S. mutans and S. gordonii, and no genes were identified that were characteristic of the causative bacteria. It has been suggested that the factors involved in causing infectious endocarditis may not be the acquisition or loss of specific genes, but differences due to gene variants or regulatory regions of expression.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

感染性心内膜炎の発症率は3-7/10万人・年と推定されており、決して多くはないが、いったん発症すると重篤な転帰をたどり、手術や長期入院を要するために患者の負担が大きい疾患である。また、高齢者の罹患率が高いことから、超高齢化社会を迎える本邦では患者の増加が予想されており、発症メカニズムの解明や効果的な予防法の開発に取り組む必要がある。本研究は、そのための基盤となる起因菌のゲノム情報の整備および比較ゲノム解析を実施した。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (2 results)

All 2023

All Presentation (2 results)

  • [Presentation] ゲノム配列アライメント可視化ツールの開発と紹介2023

    • Author(s)
      奥野 未来、山本 武司、星子 裕貴、小椋 義俊
    • Organizer
      九州微生物研究フォーラム 2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 感染性動脈瘤を引き起こしたStreptococcus agalactiaeのゲノム解析結果2023

    • Author(s)
      有水 遥子、長崎 洋司、奥野 未来、星子 裕貴、山本 武司、小椋 義俊
    • Organizer
      九州微生物研究フォーラム 2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2025-01-30  

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