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オルガノイドとシングルセル解析を用いた、乳癌細胞が正常細胞にもたらす変化の解明

Research Project

Project/Area Number 22K16473
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 55010:General surgery and pediatric surgery-related
Research InstitutionJapanese Foundation for Cancer Research

Principal Investigator

尾辻 和尊  公益財団法人がん研究会, NEXT-Gankenプログラム がん細胞多様性解明プロジェクト, クリニカルリサーチフェロー (00827313)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2023: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2022: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Keywords乳癌 / オルガノイド / シングルセル解析
Outline of Research at the Start

癌細胞は、腫瘍内や腫瘍近傍の正常乳管上皮細胞に働きかけ、腫瘍増殖を促進させる役割をもたらすことが知られている。正常細胞に対して癌細胞がどのような影響を与えるのかについてはこれまで細胞株を用いたものが多かった。一方この分野に対してシングルセル解析を応用した報告はまだほとんどない。
本研究では、乳癌細胞由来影響を受け、変化を遂げるのかについて観察する。さらに回収したオルガノイドに対してシングルセル解析を行うことで、正常細胞がエピゲノム・トランスクリプトームのレベルでどのように変化しているのかを解明する。

Outline of Annual Research Achievements

乳癌細胞が正常細胞にもたらす変化を解明することを目的とし、以下の2点を行っている。1. 乳癌患者由来の臨床検体を用いてシングルセル解析を行っている。
2022年4月から2024年3月までにシングルセルRNA-seqを34検体で、シングルセルATAC-seqを1検体で行った。現在解析を行っている。
2. 乳癌患者由来の臨床検体からオルガノイドの作製を試みている。2022年4月から2024年3月までに計115検体を採取し、オルガノイド樹立を試み、クライオチューブ800本分以上を凍結保存した。凍結保存した検体のうち、2022年4月から2024年3月までにシングルセルRNA-seqを20検体で、シングルセルATAC-seqを1検体で行った。現在解析を行っている。
また研究の中間報告として、第31回日本乳癌学会学術総会シンポジウム (演題名:腫瘍内不均一性の解明による乳癌治療の展望) および第81回日本癌学会学術総会 (演題名:Single-cell analyses of temporally and spatially multiple samples from a Stage IV breast cancer case) で演題発表を行った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

検体採取とオルガノイド培養については概ね予定通り。臨床検体のシングルセル解析についても概ね予定通りに進んでいる。現在収集したデータの解析を順次行い、学会発表・論文化を進めている。

Strategy for Future Research Activity

検体採取とオルガノイド培養については概ね予定通り。臨床検体のシングルセル解析についても概ね予定通りに進んでいる。現在主にデータ解析を行っており、乳癌の臨床検体・オルガノイド検体を用いた研究の成果についてまとめている。

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2023 2022

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (11 results)

  • [Journal Article] Transcriptomic intratumor heterogeneity of breast cancer patient-derived organoids may reflect the unique biological features of the tumor of origin2023

    • Author(s)
      Saeki Sumito、Kumegawa Kohei、Takahashi Yoko、Yang Liying、Osako Tomo、Yasen Mahmut、Otsuji Kazutaka、Miyata Kenichi、Yamakawa Kaoru、Suzuka Jun、Sakimoto Yuri、Ozaki Yukinori、Takano Toshimi、Sano Takeshi、Noda Tetsuo、Ohno Shinji、Yao Ryoji、Ueno Takayuki、Maruyama Reo
    • Journal Title

      Breast Cancer Research

      Volume: 25 Issue: 1 Pages: 21-21

    • DOI

      10.1186/s13058-023-01617-4

    • Related Report
      2023 Research-status Report 2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Cancer evolutionとヘテロジェネイティの新展開 腫瘍内不均一性の解明による乳癌治療の展望2023

    • Author(s)
      尾辻 和尊、高橋 洋子、小林 隆之、佐伯 澄人、野田 哲生、大野 真司、高野 利実、上野 貴之、丸山 玲緒
    • Organizer
      第31回日本乳癌学会総会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 乳癌患者由来オルガノイドにおけるがん細胞の腫瘍内不均一性2023

    • Author(s)
      佐伯 澄人、高橋 洋子、尾辻 和尊、尾崎 由記範、大迫 智、高野 利実、大野 真司、上野 貴之、丸山 玲緒
    • Organizer
      第31回日本乳癌学会総会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 治療経過中に原発巣が急速増大したStage IV授乳期乳癌症例1例のシングルセルトランスクリプトーム解析2023

    • Author(s)
      尾辻 和尊、高橋 洋子、小林 隆之、佐伯 澄人、野田 哲生、大野 真司、高野 利実、上野 貴之、丸山 玲緒
    • Organizer
      第31回日本乳癌学会総会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 患者由来オルガノイドの同所移植マウスモデル樹立の試み 転移性乳がんの病態解明を目指して2023

    • Author(s)
      土屋 あい、佐伯 澄人、高橋 洋子、尾辻 和尊、伊坂 泰嗣、麻賀 創太、井本 滋、大野 真司、上野 貴之、丸山 玲緒
    • Organizer
      第31回日本乳癌学会総会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 転移能を有する乳がん由来オルガノイドの異種移植における腫瘍内不均一性の評価(Assessment of intra-tumor heterogeneity in the xenograft of breast cancer-derived organoids with metastatic potential)2023

    • Author(s)
      土屋 あい、粂川 昂平、佐伯 澄人、尾辻 和尊、楊 麗英、鈴鹿 淳、宮田 憲一、高橋 洋子、野田 哲生、大野 真司、井本 滋、上野 貴之、丸山 玲緒
    • Organizer
      第82回日本癌学会総会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 乳がん患者由来オルガノイドにおける腫瘍内不均一性 共有される細胞状態とユニークな細胞状態の識別(Intratumoral Heterogeneity in Patient-Derived Breast Cancer Organoids: Identifying Shared and Unique Cellular States)2023

    • Author(s)
      佐伯 澄人、粂川 昂平、高橋 洋子、大迫 智、亜森 馬合木特、尾辻 和尊、宮田 憲一、鈴鹿 淳、尾崎 由記範、高野 利実、野田 哲生、大野 真司、八尾 良司、上野 貴之、丸山 玲緒
    • Organizer
      第82回日本癌学会総会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 時間的・空間的に複数サンプルを取得しシングルセル解析を行ったステージ4乳癌の一例(Single-cell analyses of temporally and spatially multiple samples from a Stage IV breast cancer case)2023

    • Author(s)
      尾辻 和尊、高橋 洋子、小林 隆之、佐伯 澄人、野田 哲生、大野 真司、高野 利実、鈴木 拓、上野 貴之、丸山 玲緒
    • Organizer
      第82回日本癌学会総会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 治療抵抗性を示す乳癌臨床検体1例でのsingle-cell RNA-seq解析2022

    • Author(s)
      尾辻 和尊, 佐伯 澄人, 高橋 洋子, 大野 真司, 上野 貴之, 丸山 玲緒
    • Organizer
      第30回日本乳癌学会総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 乳癌患者由来オルガノイドの樹立と単一細胞エピゲノム解析による腫瘍内不均一性の検討2022

    • Author(s)
      佐伯 澄人, 高橋 洋子, 尾崎 由記範, 尾辻 和尊, 大野 真司, 高野 利実, 上野 貴之, 丸山 玲緒
    • Organizer
      第30回日本乳癌学会総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] シングルセルRNA-seqを用いた乳癌患者由来オルガノイドの腫瘍間・腫瘍内不均一性の探究(Exploration for inter- and intra-tumor heterogeneity with scRNA-seq in breast cancer-patient derived organoid samples)2022

    • Author(s)
      尾辻 和尊, 佐伯 澄人, 高橋 洋子, 馬合木特 亜森, 野田 哲生, 大野 真司, 上野 貴之, 丸山 玲緒
    • Organizer
      第81回日本癌学会総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 乳がん患者由来オルガノイドのシングルセル解析による炎症性乳癌の機能的特徴の探索(Single-cell analysis of patient-derived organoids to explore functional features of inflammatory breast cancer.)2022

    • Author(s)
      佐伯 澄人, 粂川 昂平, 高橋 洋子, 尾辻 和尊, 鈴鹿 淳, 馬合木特 亜森, 上野 貴之, 丸山 玲緒
    • Organizer
      第81回日本癌学会総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report

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Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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