オルガノイドとシングルセル解析を用いた、乳癌細胞が正常細胞にもたらす変化の解明
Project/Area Number |
22K16473
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Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Review Section |
Basic Section 55010:General surgery and pediatric surgery-related
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Research Institution | Japanese Foundation for Cancer Research |
Principal Investigator |
尾辻 和尊 公益財団法人がん研究会, NEXT-Gankenプログラム がん細胞多様性解明プロジェクト, クリニカルリサーチフェロー (00827313)
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Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2023: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2022: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
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Keywords | 乳癌 / オルガノイド / シングルセル解析 |
Outline of Research at the Start |
癌細胞は、腫瘍内や腫瘍近傍の正常乳管上皮細胞に働きかけ、腫瘍増殖を促進させる役割をもたらすことが知られている。正常細胞に対して癌細胞がどのような影響を与えるのかについてはこれまで細胞株を用いたものが多かった。一方この分野に対してシングルセル解析を応用した報告はまだほとんどない。 本研究では、乳癌細胞由来影響を受け、変化を遂げるのかについて観察する。さらに回収したオルガノイドに対してシングルセル解析を行うことで、正常細胞がエピゲノム・トランスクリプトームのレベルでどのように変化しているのかを解明する。
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Outline of Annual Research Achievements |
乳癌細胞が正常細胞にもたらす変化を解明することを目的とし、以下の2点を行っている。1. 乳癌患者由来の臨床検体を用いてシングルセル解析を行っている。2022年4月から2023年3月までにシングルセルRNA-seqを6検体で、シングルセルATAC-seqを1検体で行った。現在解析を行っている。2. 乳癌患者由来の臨床検体からオルガノイドの作製を試みている。2022年4月から2023年3月までに計47検体からオルガノイド樹立を試み、そのうち26検体で細胞が増殖し凍結保存にまで至っている。凍結保存した一部の検体でシングルセルRNA-seq・シングルセルATAC-seqを行い、こちらも現在解析中である。
また研究の中間報告として、第30回日本乳癌学会学術総会 (演題名:治療抵抗性を示す乳癌臨床検体1例でのsingle-cell RNA-seq解析) および第81回日本癌学会学術総会 (シングルセルRNA-seqを用いた乳癌患者由来オルガノイドの腫瘍間・腫瘍内不均一性の探究) で演題発表を行った。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
検体採取とオルガノイド培養については概ね予定通り。臨床検体のシングルセル解析についても概ね予定通りに進んでいる。
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Strategy for Future Research Activity |
引き続き患者由来のシングルセル解析をベースに、癌と正常細胞の相互作用について検討を行っていく。その上でオルガノイドを用いた介入実験に持っていきたいと考えている。
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Report
(1 results)
Research Products
(5 results)