| Project/Area Number |
22K16690
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 56010:Neurosurgery-related
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| Research Institution | Kyushu University (2022, 2024)
The University of Tokyo (2023) |
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Principal Investigator |
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| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2024)
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| Budget Amount *help |
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2022: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
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| Keywords | cell free DNA / glioblastoma / glioma / liquid biopsy / digital PCR / MLPA / BRAFV600E / diitalPCR / plasma / CSF / cell free tumor DNA / liquid iopsy |
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| Outline of Research at the Start |
神経膠腫の時間的空間的不均一性の克服にはliquid biopsyが大きく寄与すると予想される。 神経膠腫において 髄液中cell free tumor DNAが検出できることはわかってきた。しかし現段階では採取 できるDNA量が極微量であることで網羅的な解析が可能な症例は限られ、髄液採取よりもよ り侵襲性の低い血液では感度が十分ではない。本研究はより高感度なassay開発による神経膠 腫由来の血漿ctDNAの検出、髄液ctDNA増幅による網羅的解析方法の開発を遂行し、神経膠腫liquid biopsyの臨床での実用性を向上させる。
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| Outline of Final Research Achievements |
In this study, we reported for the first time in the world the copy number alteration of glioblastoma by the MLPA method using cfDNA, and presented its usefulness as a new diagnostic method that is noninvasive and allows multiple-task analysis. We also introduced a new digital PCR system (QuantStudio Absolute Q) to improve the sensitivity of the method compared to the conventional method, because it is difficult to improve the sensitivity by amplifying cfDNA in spinal fluid, and confirmed the BRAF assay and established the assay for MYD88, and demonstrated the usefulness of the digitalPCR method for various targets. We demonstrated the possibility of brain tumor liquid biopsy using digitalPCR for various targets.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
本研究は、脳腫瘍由来cfDNAの検出法の改善、開発を目的とした。新型digital PCRによる実臨床glioma検体における検出感度の改善の可能性を示し、新たなアッセイの開発及び検証を含め、脳腫瘍liquid biopsyの臨床応用へ向けた一歩となった。また、髄液cfDNAを使用したMLPA法を用いたcopy number alterationの評価を世界で初めて報告し、安価かつ多項目解析可能な新しいliquid biopsy手法を提案した。
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