オミクス解析を用いた口腔癌における歯周病原菌の役割の解明
| Project/Area Number |
22K17202
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 57060:Surgical dentistry-related
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| Research Institution | Osaka University |
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Principal Investigator |
西山 今日子 大阪大学, 大学院歯学研究科, 招へい教員 (70846542)
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| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
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| Keywords | 口腔癌 / 歯周病原菌 / 浸潤・転移 / 癌微小環境 / オミクス解析 |
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| Outline of Research at the Start |
口腔細菌感染である歯周病は口腔癌のリスク因子として挙げられ、歯周病原菌が原因の一つと考えられている。近年、TCGAデータ解析を用いた研究は様々報告されており、網羅的な生体内分子解析(オミクス解析)によって生み出された大量のデータを、横断的に分析し生命現象を解明していくバイオインフォマティクスは急速に拡大・発展している。頭頸部癌における飢餓誘導遺伝子の予後への影響を次世代シークエンサーやTCGAデータを用いて解析を行ってきた3次元組織モデルを用い、歯周病態下における口腔癌環境を生体に近い状態で再現し、シークエンス解析を行い、口腔癌への歯周病原菌が及ぼす影響を網羅的に解析し明らかにする。
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| Outline of Annual Research Achievements |
口腔細菌感染である歯周病は口腔癌リスク因子として挙げられ、歯周病原菌が原因の一つと考えられている。近年、TCGAデータを用いた網羅的オミクス解析により生み出された大量データを、横断的に分析し生命現象を解明するバイオインフォマティクスは急速に発展している。これまでに我々は頭頸部癌(HNSCC)における飢餓誘導遺伝子の予後への影響を次世代シークエンサーやTCGAデータを用いて解析を行ってきた。同様の方法で、今回我々はHNSCCへの歯周病原菌が及ぼす影響を網羅的に解析し明らかにすることを目的とし研究を遂行した。具体的には、歯周病原菌P. gingivalis ATCC 33277またはF. nucleatum ATCC 25586（MOI:1）で口腔扁平上皮癌細胞株SASを処理し、RNAを抽出後、次世代シークエンサーにて解析を行った。著明な発現変化を示す322遺伝子を抽出し、F. nucleatum感染細胞では120遺伝子の発現上昇と、202遺伝子の発現低下を認めた。また、P. gingivalis感染細胞では160遺伝子の発現上昇と、162遺伝子の発現低下を認めた。F. nucleatumもしくはP. gingivalis感染細胞で著明な発現変化を示す共通遺伝子として31遺伝子（上昇）、48遺伝子（低下）を特定した。さらに、HNSCCのTCGAデータベースにて変化を認めた共通遺伝子の発現を調べたところ、CACYR、DHRS2、DLEU7、WISP1、AKAPS、C2orf88、KIAA1456、SLC47A1は、癌組織で正常組織と比較し発現に差を認めた。これら8遺伝子について生存率について詳細に調べたところ、DHRS2高発現群では生存率が低下することが明らかとなった。したがって、DHRS2は、口腔細菌に関連した頭頸部癌患者の生命予後予測マーカーとなる可能性があると考えられた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
当初の計画通り、実験はおおむね順調に進展したが、補助事業の目的をより精緻に達成するための研究の実施(追加(再現)実験の実施や学会参加、論文投稿など)が必要となり、研究実施期間の延長を行った。
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| Strategy for Future Research Activity |
当初の計画通り、実験はおおむね順調に進展したが、補助事業の目的をより精緻に達成するための研究の実施(追加(再現)実験の実施や学会参加、論文投稿など)が必要となっている。今後学会発表と論文投稿を行っていく予定である。
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Report
(2 results)
Research Products
(6 results)
