地域住民における腸管への口腔細菌異所性定着とそのリスク因子の解明
Project/Area Number |
22K17269
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Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Review Section |
Basic Section 57080:Social dentistry-related
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Research Institution | Kyushu University |
Principal Investigator |
影山 伸哉 九州大学, 歯学研究院, 助教 (90822495)
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Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2024-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
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Keywords | 口腔マイクロバイオーム / 腸管マイクロバイオーム / ロングリードシークエンサー / 異所性定着 |
Outline of Research at the Start |
口腔には膨大な数の細菌が複雑な常在細菌叢(マイクロバイオーム、MB)を構築して生息しており、我々はこれらの細菌を嚥下の度に飲み込んでいる。一方、様々な疾患患者の腸管MBにおいて口腔細菌が検出されており、口腔細菌の腸管への異所性定着が疾患発症に関わっていると考えられるようになってきた。本研究では、地域住民における腸管への口腔細菌異所性定着を高精度に検証し、そのリスク因子の同定を試みる。
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Outline of Annual Research Achievements |
本年度は、唾液検体ならびに便検体のマイクロバイオーム解析を行った。唾液検体、便検体からのDNA抽出はすでに完了しており、まずはPCR法を用いて採取した検体に含まれる16S rRNA遺伝子の全長を網羅的に増幅した。プライマーにはサンプル識別用の8塩基のタグ配列を付与した8Fと1492Rを使用した。ロングリードシークエンサーのPacBio Sequel IIを用いて、得られた増幅断片の塩基配列を解読し、各検体に含まれる細菌構成を明らかにした。この解析手法では細菌の識別に用いる16S rRNA遺伝子の可変領域(V1-V9領域)の塩基配列が全て解読されるため、遺伝子の相同性の高い細菌についても高解像度に識別することが可能となる。そのため、口腔マイクロバイオームと腸管マイクロバイオームから検出された細菌が同一細菌かどうかをより高精度に検証できる。得られた塩基配列を解析した結果、唾液マイクロバイオームと腸管マイクロバイオームが大きく異なる細菌構成を示す一方、StreptococcusやVeillonellaは口腔と腸管から共通して検出されることが明らかとなった。また、これらの細菌は一部の対象者の腸管マイクロバイオームにおいて高い比率を占めていた。これらの結果より、口腔細菌が腸管まで到達していることが示唆された。現在はさらなる解析を継続中である。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
選定した唾液検体、便検体について、ロングリードシークエンサーのPacBio Sequel IIによる16S rRNA遺伝子全長シークエンスが完了し、順調に解析が進んでいるため。
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Strategy for Future Research Activity |
唾液マイクロバイオームと腸管マイクロバイオームの関連性について、さらなる解析を進めていく。
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Report
(1 results)
Research Products
(8 results)