都市構造の変化が結核罹患構造へおよぼす影響に関する研究
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22K17318
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 58010:Medical management and medical sociology-related
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| Research Institution | Osaka Institute of Public Health |
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Principal Investigator |
山本 香織 地方独立行政法人 大阪健康安全基盤研究所, 微生物部, 主任研究員 (70649011)
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| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
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| Keywords | 結核 / 感染伝播 / 遺伝子型別 / クラスター / 地区類型 / 都市部 / 地域差 |
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| Outline of Research at the Start |
結核は我が国における最大の細菌感染症であり、長期にわたり中蔓延状態を持続してきた。結核の原因となる結核菌はヒトからヒトへ感染伝播するため、結核患者からの感染の広がりを抑止することが重要である。地域の社会経済的特徴の違いは、結核の発生状況の地域差を生じさせる一要因と考えられ、外国人の流入や再開発によって発生する流動的な都市の構造変化は、地域居住者の構成だけでなく結核の発生動向にも変化をおよぼすと考えられる。本研究では、網羅的に収集した結核患者情報と患者由来菌株の遺伝子情報、および地域居住者の特性を分析し、変化する都市構造の中での結核発生状況とその伝播関係の地域的変化を捉えることを目的とする。
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| Outline of Annual Research Achievements |
地域内の感染伝播を検証するためのゲノム解析対象サンプルセットを抽出する方法として、遺伝子型別によるスクリーニングを行うが、その際のクラスター定義を検討するために以下の分析を行った。
結核分子疫学調査における遺伝子型別法はJATA12領域のVNTR型別が主流である。一方、サーベイランス調査ではJATA12領域に追加領域を加え、菌株識別能を高める必要がある。現状では菌株間のVNTR型の1領域違いを遺伝子型一致とするか、明確な判定基準は無い。2012-20年の大阪市新登録結核患者由来の結核菌505株について24領域のVNTR型別を行い、23領域が一致した菌株群（23領域クラスター）内で、不一致となった領域の分布を検討した。結果、199株が70パターンの23領域クラスターを形成した。23領域クラスター内で不一致であった領域は、多様度が高いとされているVNTR3820(14.3%)、QUB-3232(10.0%)、VNTR4120(8.6%)、QUB-26(8.6%)の順に多く、多様度が低いとされているMIRU40(7.1％)が続いた。23領域クラスターにおける、不一致領域の違いが菌株の異同判定の参考情報となり得るか、ゲノム解析での検証が必要であることを確認した。本研究では対象とする菌株が多く、ゲノム解析対象株のサンプルセットを選出するための検討を引き続き行う。
また、本研究対象となる2017年から2021年までに大阪市の新登録結核患者から分離された結核菌2,316株について、遺伝子型別(VNTR法）を進めた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
初年度の予定として、研究対象となる結核菌株の収集およびVNTR型別の実施、疫学情報の収集についてほぼ予定の通り進めている。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和5年度は令和2年度国勢調査の結果による社会地区類型の構築を行い、10年前（平成22年度）の国勢調査の結果から構築した社会地区類型からの地域構成の変化について検証する。併せて、対象株の24領域VNTR型別結果から、VNTRパターンが一致したサンプルセットについてゲノム解析を行い、結核の地域内における感染伝播について検討する。
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Report
(1 results)
Research Products
(1 results)
