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Graft Polymer Discs: A Novel Platform for Membrane Protein Analysis

Research Project

Project/Area Number 22K19057
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 35:Polymers, organic materials, and related fields
Research InstitutionShinshu University

Principal Investigator

Nishimura Tomoki  信州大学, 学術研究院繊維学系, 助教 (60648070)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 安藤 満  京都大学, 医生物学研究所, 助教 (70737460)
Project Period (FY) 2022-06-30 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Keywordsナノディスク / 膜タンパク質 / グラフトポリマー / 無細胞タンパク質合成 / 自己組織化 / ポリマーディスク
Outline of Research at the Start

膜タンパク質は創薬のターゲットとして重要な分子である。その構造解析は、界面活性剤などによる可溶化が必要となる。しかし、界面活性剤による可溶化は、生体膜環境と異なるため膜タンパク質が天然構造を形成しない懸念がある。また、ナノディスクは、生体膜類似の環境を持つが、その作製が極めて難しい。そこで、本研究では、申請者が開発した両親媒性グラフトポリマーを基盤とした簡便なナノディスク作製法の構築、無細胞タンパク質合成を用いたナノディスクへの膜タンパク質の直接組み込み法を確立する。これにより、既存の膜タンパク質可溶化法の問題点を解決した新しい膜タンパク質構造解析ツールを創出することを目的とする。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we developed polymer nanodiscs based on temperature-responsive graft polymers to address the challenges in the structural analysis of membrane proteins. The polymers self-assemble to form nanodiscs, and small-angle scattering measurements revealed that these nanodiscs have hydrophobic regions similar in size to biological membranes. Additionally, we discovered that model membrane proteins can be directly incorporated into the nanodiscs using cell-free protein synthesis. Furthermore, this method confirmed that the membrane proteins are correctly folded and retain their functionality. These findings indicate that this new approach can solve the issues of traditional membrane protein solubilization methods and shows potential as a novel tool for membrane protein structural analysis.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究は、温度応答性グラフトポリマーベースのナノディスクを開発し、膜タンパク質の構造解析における課題の解決に寄与すると考えられる。この手法により、膜タンパク質が天然の構造を保持できることが示され、構造生物学研究における有用な技術となる可能性がある。今後、膜タンパク質の構造解析が進むことで、新しい治療薬の設計が期待される。特に、がんや神経変性疾患などの治療において、新たな治療法の開発が見込まれ、製薬業界やバイオテクノロジー分野で広く応用され、健康の向上に貢献することが期待される。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (5 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Macromolecular architectural effects on solution self-assembly of amphiphilic AB-type block copolymers2024

    • Author(s)
      Ozawa Naoki、Nishimura Tomoki
    • Journal Title

      Polymer Chemistry

      Volume: 15 Issue: 5 Pages: 349-370

    • DOI

      10.1039/d3py01324c

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Journal Article] Exploring the effects of glyco-copolymer architectures on the solution self-assembly of amphiphilic thermoresponsive linear, star, and cyclic polymers2023

    • Author(s)
      Ozawa Naoki、Lee Ji Ha、Akiba Isamu、Nishimura Tomoki
    • Journal Title

      Polymer Chemistry

      Volume: 14 Issue: 33 Pages: 3834-3842

    • DOI

      10.1039/d3py00729d

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Journal Article] Bilayer-domain formation of thermoresponsive amphiphilic block copolymers in hybrid liposomes for synthetic molecular channels2023

    • Author(s)
      Ozawa Naoki、Kosaka Shunji、Fujii Shota、Nishimura Tomoki
    • Journal Title

      Polymer Chemistry

      Volume: 14 Issue: 18 Pages: 2198-2204

    • DOI

      10.1039/d3py00223c

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Journal Article] Recent advances in the self-assembly of sparsely grafted amphiphilic copolymers in aqueous solution2022

    • Author(s)
      Sakamoto Yusuke、Nishimura Tomoki
    • Journal Title

      Polymer Chemistry

      Volume: 13 Issue: 46 Pages: 6343-6360

    • DOI

      10.1039/d2py01018f

    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Journal Article] Single-component nanodiscs <i>via</i> the thermal folding of amphiphilic graft copolymers with the adjusted flexibility of the main chain2022

    • Author(s)
      Nishimura Tomoki、Hatatani Yusuke、Ando Mitsuru、Sasaki Yoshihiro、Akiyoshi Kazunari
    • Journal Title

      Chemical Science

      Volume: 13 Issue: 18 Pages: 5243-5251

    • DOI

      10.1039/d2sc01674e

    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Design of Permeable Polymersomes and Hybrid Liposomes with Block Copolymer Channels2024

    • Author(s)
      Tomoki Nishimura
    • Organizer
      10th Catalysis and Sensing for Our Environment Symposium
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] イイオン透過性高分子ベシクルの合成と人工イオンチャネルとしての機能2023

    • Author(s)
      小坂峻史、西村智貴
    • Organizer
      第72回高分子学会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 直鎖、星型及び環状両親媒性糖鎖高分子の水溶液中での自己組織挙動2023

    • Author(s)
      小澤直生、西村智貴
    • Organizer
      第72回高分子学会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] グラフトポリマー1次元集合体の長さ制御と生体内動態評価2023

    • Author(s)
      坂本悠輔、西村智貴
    • Organizer
      第72回高分子学会年会
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      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 温度応答性高分子を基盤とした分子透過性高分子ベシクルの設計と反応場、分子チャネルとしての機能2023

    • Author(s)
      西村智貴、小坂峻史、小澤直生
    • Organizer
      第72回高分子討論会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 構造の異なる両親媒性糖鎖ポリマーの合成と自己組織化体のモルフォロジー制御2023

    • Author(s)
      小澤直生、Jiha Lee、秋葉勇、西村智貴
    • Organizer
      第72回高分子討論会
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      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 温度応答性ブロックポリマーを基盤とした人工イオンチャネルの創製と機能評価2023

    • Author(s)
      小坂峻史、西村智貴
    • Organizer
      第72回高分子討論会
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      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 抗がん活性を有する白金触媒を担持したグラフトポリマー集合体の創製と機能2023

    • Author(s)
      瀬立恭介、西村智貴
    • Organizer
      第72回高分子討論会
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      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] サイズ制御可能なグラフトポリマー一次元分子集合体 の創製と生体内動態評価…2023

    • Author(s)
      坂本 悠輔、藤井 翔太、安藤 満、古寺 哲幸、西村 智貴
    • Organizer
      第72回高分子討論会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report

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Published: 2022-07-05   Modified: 2025-01-30  

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