| Project/Area Number |
22K19107
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Medium-sized Section 37:Biomolecular chemistry and related fields
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| Research Institution | Nagoya University |
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Principal Investigator |
Kashida Hiromu 名古屋大学, 工学研究科, 准教授 (30452189)
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| Project Period (FY) |
2022-06-30 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
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| Keywords | 蛍光バーコード / 抗体 / インタラクトーム / セリノール核酸 |
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| Outline of Research at the Start |
我々は核酸の鎖交換反応を利用することで多数の分子を同時にラベル化する蛍光バーコードの開発に成功した。この蛍光バーコードは蛍光色素の種類や蛍光変化回数を増加させることで、ラベルの種類を指数関数的に増大できるという特長がある。そこで、本研究では蛍光バーコードを利用することで生体分子間相互作用を可視化する手法の開発を目指す。
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| Outline of Final Research Achievements |
In this study, we aimed to develop a method to visualize interactions among biomolecules by using color-changing fluorescent barcodes (CCFB). First, we analyzed strand displacement reaction of acyclic D-threoninol nucleic acid and revealed optimal chain length and temperature. We prepared a barcode which changes its color three times. Fluorescent measurements indicated that the barcode worked as designed. Moreover, we tried to visualize protein-protein interaction by using proximity ligation assay. As a result, interaction could be visualized by using fluorescently labeled DNAs. From these results, we successfully developed basic technologies necessary for interactome imaging in cells.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
生体分子間の相互作用は全ての生命現象の基盤であるため、これを可視化することは生命現象を理解する上で非常に重要である。これを実現するためには多数の蛍光ラベルを調製する必要があるが、従来の技術では蛍光波長にオーバーラップがあるため同時検出可能な数に大きな制約があった。それに対し、我々が開発した蛍光バーコードは膨大な種類の蛍光ラベルを簡便に調製することが可能である。また、本研究成果によって生体分子間相互作用イメージングに必要な基盤技術を確立することが出来た。今後、我々が開発した技術を更に発展させることで複数の生体分子間相互作用の同時イメージングが期待できる。
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