Capturing the behavior of functional RNAs across the plant-animal boundary contributing to bioregulatory actions
| Project/Area Number |
22K19154
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Medium-sized Section 38:Agricultural chemistry and related fields
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
藤村 由紀 九州大学, 農学研究院, 准教授 (20390304)
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| Project Period (FY) |
2022-06-30 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2023: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
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| Keywords | miRNA / 機能性RNA / ファイトケミカル / 緑茶 / circRNA |
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| Outline of Research at the Start |
近年、食餌性の植物由来機能性RNAの一種であるmicroRNA(miRNA)が動物体内でも作用する可能性が示され、植物-動物間の界を超えたmiRNAの役割が注目されつつある。そこで本研究では、生体調節作用を有する代表的な食餌性植物のmiRNA発現プロファイルを取得すると共に、その機能制御に関わることが最近明らかになりつつある新規ノンコーディングRNAである環状RNA(circRNA)にも焦点を当て、生体調節作用と連動する特徴的なcircRNA-miRNA-mRNA制御ネットワーク構造の一端を明らかにし、植物-動物間の界を超えた機能性RNAのふるまいの可視化を試みる。
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| Outline of Annual Research Achievements |
近年、食餌性の植物由来機能性RNAの一種であるmicroRNA(miRNA)が動物体内でも作用する可能性が示され、植物-動物間の界を超えたmiRNAの役 割が注目されつつある。そこで本研究では、生体調節作用を有する代表的な食餌性植物のmiRNA発現プロファイルを取得すると共に、その機能制御に関わることが最近明らかになりつつある新規ノンコーディングRNAである環状RNA(circRNA)にも焦点を当て、生体調節作用と連動する特徴的なcircRNA-miRNA-mRNA制御ネットワーク構造の一端を明らかにし、植物-動物間の界を超えた機能性RNAのふるまいの可視化を試みる。
そこで本研究では、多彩な生体調節作用を有し、かつ、申請者の研究実績のある緑茶(Camellia sinensis L.)に着目し、独自保有の緑茶品種ライブラリーの中から生理活性の異なる数種の茶葉エキスから RNA を抽出し、次世代シーケンス解析で品種固有の miRNA 発現プロファイルの取得を試みた。その結果、品種によって同様なmiRNA発現パターンを示すものや異なるパターンを示すmiRNAが存在することが明らかとなった。また、これらmiRNAの標的遺伝子や関連するcircRNA 、関連する生体側の生物学的イベント・シグナル伝達経路を明らかにするために複数の公共データベースを用いて調査を行った。本解析により、circRNA-miRNA-mRNA-シグナル伝達経路・生物学的イベント間の潜在的関係性の一端を推定することが可能となった。
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Report
(2 results)
Research Products
(11 results)
