Capturing the behavior of functional RNAs across the plant-animal boundary contributing to bioregulatory actions
Project/Area Number |
22K19154
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Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Review Section |
Medium-sized Section 38:Agricultural chemistry and related fields
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Research Institution | Kyushu University |
Principal Investigator |
藤村 由紀 九州大学, 農学研究院, 准教授 (20390304)
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Project Period (FY) |
2022-06-30 – 2024-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2023: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
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Keywords | miRNA / 機能性RNA / ファイトケミカル / 緑茶 / circRNA |
Outline of Research at the Start |
近年、食餌性の植物由来機能性RNAの一種であるmicroRNA(miRNA)が動物体内でも作用する可能性が示され、植物-動物間の界を超えたmiRNAの役割が注目されつつある。そこで本研究では、生体調節作用を有する代表的な食餌性植物のmiRNA発現プロファイルを取得すると共に、その機能制御に関わることが最近明らかになりつつある新規ノンコーディングRNAである環状RNA(circRNA)にも焦点を当て、生体調節作用と連動する特徴的なcircRNA-miRNA-mRNA制御ネットワーク構造の一端を明らかにし、植物-動物間の界を超えた機能性RNAのふるまいの可視化を試みる。
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Outline of Annual Research Achievements |
近年、食餌性の植物由来機能性RNAの一種であるmicroRNA(miRNA)が動物体内でも作用する可能性が示され、植物-動物間の界を超えたmiRNAの役割が注目されつつある。そこで本研究では、生体調節作用を有する代表的な食餌性植物のmiRNA発現プロファイルを取得し、その機能制御に関わるmRNAにも焦点を当て、生体調節作用と連動する特徴的な機能性RNA-mRNA制御構造の一端を明らかにし、植物-動物間の界を超えた機能性RNAのふるまいの可視化を試みる。そこで本年度の研究では、多彩な生体調節作用を有し、かつ、申請者の研究実績のある緑茶(Camellia sinensis L.)の miRNA 発現プロファイリングと共に、その機能制御に関わる circRNA あるいは miRNA の標的となる mRNA を見出すことを試みた。代表的な機能性植物(緑茶)中の miRNA 発現プロファイリング、すなわち、独自保有の緑茶品種ライブラリーの中から生理活性の異なる数種の茶葉を選抜し、それらの試料から RNA を抽出し、次世代シーケンス解析によって品種固有の miRNA 発現プロファイルを取得した。また、取得した miRNA 発現プロファイル情報を公共 Public Database に供することで、miRNA と相互作用を示す一連の mRNA候補情報を取得した。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
従来予定していた茶サンプルの次世代シーケンス解析が完了するとともに、機能性RNAの標的となるmRNA情報が取得できたため。
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Strategy for Future Research Activity |
今後は、緑茶の特徴的な miRNA の機能制御に関わると推察されるノンコーディングRNAの一種である環状RNA(circRNA)を探索する。また、投与動物における緑茶由来の機能性RNA の 体内レベルの検証を行う。さらに、これら機能性RNAに影響を受ける動物細胞内 miRNA/circRNA /mRNA との潜在的関係性も調査し、それらの機能的ネットワーク構造の理解を目指す。
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Report
(1 results)
Research Products
(7 results)