シスト・ネコブ・ネモグリの寄生環を支える線虫共生コアマイクロバイオームの実態解明
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22K19193
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Medium-sized Section 39:Agricultural and environmental biology and related fields
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| Research Institution | National Institute of Advanced Industrial Science and Technology |
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Principal Investigator |
黒田 恭平 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 (50783213)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
富田 駿 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究員 (00909343)
田淵 宏朗 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 九州沖縄農業研究センター, 上級研究員 (10355571)
島 武男 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 九州沖縄農業研究センター, 上級研究員 (20414427)
成廣 隆 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究グループ長 (20421844)
野口 太郎 都城工業高等専門学校, 物質工学科, 准教授 (90615866)
村田 岳 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 植物防疫研究部門, 研究員 (90760364)
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| Project Period (FY) |
2022-06-30 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
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| Keywords | 植物寄生性線虫 / 共生 / マイクロバイオーム / 生物防除 |
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| Outline of Research at the Start |
本研究では，植物寄生性線虫と共生するコアマイクロバイオームを同定しその機能を微生物培養・線虫操作・遺伝子レベルで解明することで，生物農薬及び土壌微生物機能を活用した植物寄生性線虫防除技術開発の新たな礎を築くことを目的とする。対象とする植物寄生性線虫をシスト・ネコブ・ネモグリセンチュウとすることで，国内外で波及可能な成果創出を目指す。
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| Outline of Annual Research Achievements |
令和4年度は、サツマイモネコブセンチュウおよびレンコンネモグリセンチュウを対象として、滅菌水洗浄処理の有無などの前処理を施した後に、個々の植物寄生性線虫についてDNAを抽出した。レンコンネモグリセンチュウについては、MiSeq(Illumina)を用いた16S rRNA遺伝子解析を実施し、StaphylococcusやCutibacteriumに感染している個体が存在すること、RickettsiellaやCandidatusPaenicardiniumなどに近縁な最近が共生している可能性があること、などの情報を得た。加えて、PacBioSequellleを用いたロングリードメタゲノムシークエンス解析により、レンコンネモグリセンチュウおよびその共生微生物の長いコンティグを得ることに成功した。レンコンネモグリセンチュウについては、寒天上での運動性試験も実施し、運動性の違いが見られた個体を採取し、DNA抽出に成功した。
令和5年度はヨモギシストセンチュウの培養系確立を目指した試験を実施した。加えて、レンコンネモグリセンチュウを対象として寒天上での走化性試験を行い、異なる走化特性を持つレンコンネモグリセンチュウを採取し、共生マイクロバイオームの解析を行った。さらに令和4年度でDNAを抽出した様々な洗浄処理の有無やレースの違いにおけるサツマイモネコブセンチュウやレンコンネモグリセンチュウについて、MiSeq(Illumina)を用いた16S rRNA遺伝子解析を実施し、異なる環境・系統によって共生するマイクロバイオームの違いを明らかにした。令和4年度および5年度において、異なる防除処理に暴露された植物寄生性線虫を採取するため、バチルス属細菌を含む生物農薬や化学農薬オンコル、天然資材などを添加したレンコン栽培試験を実施し、共生マイクロバイオーム同定のための試験区も作製し試験している。
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Report
(2 results)
Research Products
(2 results)
