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Identification and analysis of the structure-function relationship of eukaryotic glycolipids involved in protein sorting and insertion into membanes

Research Project

Project/Area Number 22K19262
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 43:Biology at molecular to cellular levels, and related fields
Research InstitutionIwate University

Principal Investigator

Nishiyama Ken-ichi  岩手大学, 農学部, 教授 (80291334)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 永森 收志  東京慈恵会医科大学, 医学部, 教授 (90467572)
Project Period (FY) 2022-06-30 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2023: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Keywordsタンパク質細胞内輸送 / タンパク質選別輸送 / タンパク質膜挿入 / ミトコンドリア / 小胞体 / 糖脂質 / MPIase / 細胞内選別輸送 / リポソーム
Outline of Research at the Start

タンパク質が細胞質で生合成されたのち、それらが機能を発揮する場所に輸送され局在化する。申請者らは、モデル生物大腸菌のタンパク質膜挿入機構を研究し、膜挿入に必須の糖脂質MPIaseを発見した。タンパク質膜挿入機構は基本的にすべての生物で保存されているため、真核生物でもMPIase様の機能をもつ物質が存在する可能性を着想した。本研究では真核生物のMPIaseホモログを同定し、構造機能解析を進める。真核生物MPIaseホモログは、細胞内タンパク質局在化に関する未解明の問題をすべて解決する最後のミッシング・ピースと位置付けられる。

Outline of Final Research Achievements

After proteins are biosynthesized in the cytosol, they are localized where they function. Many proteins insert into organelles or cytoplasmic membranes. This molecular mechanism is conserved in all organisms at a fundamental level. In E. coli, the glycolipid MPIase is essential for membrane insertion. In this study, we demonstrated the presence of MPIase homologues in mitochondria and ER of cells of human origin, and through their purification and structure-function analysis, we aimed to clarify the sorting, transport, and membrane insertion mechanisms of membrane proteins whose localization mechanisms are unknown. We found that mitochondria and ER have unique MPIase homologs, which are involved not only in membrane insertion but also in sorting and transport.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

タンパク質の細胞内局在や膜挿入の分子機構については、様々な手法を用いて精力的に研究されている。特に、タンパク質性の因子については、局在化・選別輸送や膜挿入に関わる因子はすべて同定されていると考えられている。一方、非タンパク質性の因子については、比較的注目されてこなかった。本研究で同定した、オルガネラの各MPIaseホモログは、タンパク質選別輸送・膜挿入といったタンパク質局在化に関する未解明の問題をすべて解決する最後の「ミッシング・ピース」とも位置付けされるものと言える。特に、ミトコンドリアは老化や生活習慣病にも深くかかわるオルガネラであるため、これらの分子機構の解明も進むことが期待される。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (38 results)

All 2024 2023 2022 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 7 results) Presentation (29 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] CdsA, a CDP‐diacylglycerol synthase involved in phospholipid and glycolipid MPIase biosynthesis, possesses multiple initiation codons2024

    • Author(s)
      Hikage Runa、Sekiya Yusei、Sawasato Katsuhiro、Nishiyama Ken‐ichi
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 29 Issue: 4 Pages: 347-355

    • DOI

      10.1111/gtc.13104

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      Kohki Fujikawa, Youjung Han, Tsukiho Osawa, Shoko Mori, Kaoru Nomura, Maki Muramoto, Ken-ichi Nishiyama, Keiko Shimamoto
    • Journal Title

      Chemistry A European Journal

      Volume: - Issue: 30

    • DOI

      10.1002/chem.202300437

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  • [Journal Article] Coordinated upregulation of two CDP-diacylglycerol synthases, YnbB and CdsA, is essential for cell growth and membrane protein export in the cold2023

    • Author(s)
      Kamemoto Yuki、Hikage Runa、Han Youjung、Sekiya Yusei、Sawasato Katsuhiro、Nishiyama Ken-ichi
    • Journal Title

      FEMS Microbiology Letters

      Volume: 370

    • DOI

      10.1093/femsle/fnad131

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      Mori Shoko、Nomura Kaoru、Fujikawa Kohki、Osawa Tsukiho、Shionyu Masafumi、Yoda Takao、Shirai Tsuyoshi、Tsuda Shugo、Yoshizawa-Kumagaye Kumiko、Masuda Shun、Nishio Hideki、Yoshiya Taku、Suzuki Sonomi、Muramoto Maki、Nishiyama Ken-ichi、Shimamoto Keiko
    • Journal Title

      ACS Chemical Biology

      Volume: 17 Issue: 3 Pages: 609-618

    • DOI

      10.1021/acschembio.1c00882

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    • Journal Title

      Sci Rep.

      Volume: 12 Issue: 1 Pages: 12231-12231

    • DOI

      10.1038/s41598-022-16304-1

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      Nishikawa Hanako、Sawasato Katsuhiro、Mori Shoko、Fujikawa Kohki、Nomura Kaoru、Shimamoto Keiko、Nishiyama Ken-Ichi
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      Frontiers in Molecular Biosciences

      Volume: 9 Pages: 986602-986602

    • DOI

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      Volume: 81 Pages: 95-129

    • DOI

      10.1016/bs.accb.2022.09.005

    • ISBN
      9780323985888
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Published: 2022-07-05   Modified: 2025-01-30  

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