• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Development of a method for determining celebral infarction sites by serum omics analysis

Research Project

Project/Area Number 22K19280
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 43:Biology at molecular to cellular levels, and related fields
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

清水 義宏  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, チームリーダー (90401231)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 砂川 玄志郎  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, チームリーダー (70710250)
Project Period (FY) 2022-06-30 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2023: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Keywords脳梗塞 / プロテオミクス解析 / 質量分析 / オミクス解析 / プロテオーム / 無細胞タンパク質合成システム
Outline of Research at the Start

脳卒中は介護を必要とする原因疾患の中で最も頻度が高く、脳卒中全体の4分の3は脳梗塞が原因である。脳梗塞は部位により予後が大きく変わる。急性期に梗塞部位を高精度に診断できることは治療方針の決定に重要である。そこで、急性期虚血性脳疾患の部位を患者の血液検査から簡便かつ安価に判定するために、本プロジェクトでは血清オミックス解析による脳梗塞部位同定技術の開発を行う。

Outline of Annual Research Achievements

脳卒中は、介護が必要とされる疾患の中で最も高頻度に観察され、また、脳卒中の直接の病因は脳梗塞である場合がほとんどである。梗塞部位を迅速に同定し、治療方針の決定に役立てることが患者の予後を向上させるために必須であるが、現在はリソースや安定性に制限のある画像診断技術に依存しているという問題が存在する。本研究では、これを解決し、迅速に血液検査のみで梗塞部位の診断につなげる手法を開発しようとするものである。これまでマウス血清のプロテオミクス解析を行い、血清の前処理方法の検討を行っている。しかしながら、前年度の測定結果において、血清アルブミンや免疫グロブリンが幅広い分画に高い検出感度で存在していることが明らかになっており、アルブミン除去カラムやグロブリン除去カラムの検討などを行う必要があった。本年度は、この検討を進め、より同定数の高い手法の構築を進めている。上記したように、アルブミンやグロブリンを除去可能なカラム使用の検討などを行い、同定数が向上可能な手法を構築している。また、実際にマウスから梗塞部位を同定を可能とするサンプルの取得を進めており、構築した手法を応用することによってプロテオミクス解析を進めている。本研究開発は、目的をより精緻に達成するための研究の実施を目指し、補助事業機関延長の承認を受けており、次年度も引き続き解析を行い、脳梗塞部位を高い精度で判別できるペプチドマーカーセットを同定したいと考えている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

血清プロテオミクスを行うためのサンプル調製方法の検討をさらに行うことにより、測定可能分子種を向上させることに成功し、本課題を遂行可能とする技術基盤を構築できた。構築した技術基盤を元に、サンプル取得と解析を進めているところである。

Strategy for Future Research Activity

手法は概ね確立できたので、サンプルの取得と解析を行い、マーカーペプチド/タンパク質情報の取得を目指したい。

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2024 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results)

  • [Int'l Joint Research] Leiden University(オランダ)

    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Journal Article] Development of PCR primers enabling the design of flexible sticky ends for efficient concatenation of long DNA fragments2024

    • Author(s)
      Nomura Kohei、Onda Kaoru、Murase Hirotaka、Hashiya Fumitaka、Ono Yukiteru、Terai Goro、Oka Natsuhisa、Asai Kiyoshi、Suzuki Daisuke、Takahashi Naho、Hiraoka Haruka、Inagaki Masahito、Kimura Yasuaki、Shimizu Yoshihiro、Abe Naoko、Abe Hiroshi
    • Journal Title

      RSC Chemical Biology

      Volume: 5 Issue: 4 Pages: 360-371

    • DOI

      10.1039/d3cb00212h

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Ebola virus-like particles reprogram cellular metabolism2023

    • Author(s)
      Tang Huaqi、Abouleila Yasmine、Saris Anno、Shimizu Yoshihiro、Ottenhoff Tom H. M.、Mashaghi Alireza
    • Journal Title

      Journal of Molecular Medicine

      Volume: 101 Issue: 5 Pages: 557-568

    • DOI

      10.1007/s00109-023-02309-4

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A large‐scale targeted proteomics of plasma extracellular vesicles shows utility for prognosis prediction subtyping in colorectal cancer2022

    • Author(s)
      Kasahara Keiko、Narumi Ryohei、Nagayama Satoshi、Masuda Keiko、Esaki Tsuyoshi、Obama Kazutaka、Tomonaga Takeshi、Sakai Yoshiharu、Shimizu Yoshihiro、Adachi Jun
    • Journal Title

      Cancer Medicine

      Volume: 12 Issue: 6 Pages: 7616-7626

    • DOI

      10.1002/cam4.5442

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] PURE-ly synthetic ribosome biogenesis in DNA compartments on a chip2023

    • Author(s)
      清水義宏
    • Organizer
      BioJapan2023セミナー「HFSP-成果発表会-」
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Social implementation of a cell-free protein synthesis system2023

    • Author(s)
      清水義宏
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会シンポジウム
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] An attempt to reconstitute a translation system from genetic information alone2023

    • Author(s)
      Yoshihiro Shimizu
    • Organizer
      2nd Cell Free Systems Conference at Austin, USA
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2022-07-05   Modified: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi