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Development of micropore devise to detect chromosome aberrations

Research Project

Project/Area Number 22K19318
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 44:Biology at cellular to organismal levels, and related fields
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology

Principal Investigator

Takata Hideaki  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 (20455207)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 横田 一道  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究員 (50633179)
Project Period (FY) 2022-06-30 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Keywords染色体異常 / ポアデバイス / 細胞老化 / 染色体診断 / 染色体 / 染色体構造解析 / 染色体異常検出
Outline of Research at the Start

遺伝情報の担体である染色体の構造や数の異常は、癌をはじめとする多くの疾患を引き起こす原因となる。染色体異常の検出は、スライドガラス上に作製した染色体標本を顕微鏡下で観察することが一般的であるが、標本作製に時間がかかる、画像解析が煩雑、自動化が困難、観察後の試料の再利用が困難といった多くの問題点が挙げられる。これらの問題を克服するため、本研究では、DNA塩基配列の決定やウィルス・細菌の識別に用いられてきたポアデバイスを染色体に適用し、染色体の異常を高感度かつ迅速に検出する新規デバイスを開発することを目的とする。これにより、染色体研究や医療分野における新たな染色体解析のアプローチを創出する。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we developed a new method for detecting chromosome aberrations using a micropore device to obtain structural information of chromosomes with high speed and sensitivity. Chromosomes isolated from human cultured cells were used to evaluate chromosome structure by the peak width and height (waveform pattern) of the current blockade waveform observed when the chromosome passes through the pores. The results showed that efficient acquisition of chromosome structural information is expected by reducing the size of micropores and controlling the direction of particles passing through the pores. In addition, by inducing cellular senescence, chromosomes exhibiting abnormal structures were successfully obtained.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

染色体異常を伴う疾患には、ダウン症に代表される先天的な染色体異常だけでなく、がんで観察されるクロモスリプシスとして知られる加齢と関連した後天的な染色体異常が存在する。このため、超高齢化社会を迎えるにあたり、染色体異常を伴う疾患の発症メカニズムを解明する基礎研究だけでなく、染色体異常の早期発見を必要とする染色体診断の分野において、染色体検査の高精度化・高速化が必要とされる。本研究により、ポアデバイスを用いた染色体構造評価の可能性を示すことができたことから、従来法に代わってポアデバイスを利用することで染色体異常検出のハイスループット化が見込まれる。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (1 results)

All 2023

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results)

  • [Journal Article] CRISPR imaging reveals chromatin fluctuation at the centromere region related to cellular senescence2023

    • Author(s)
      Takata Hideaki、Masuda Yumena、Ohmido Nobuko
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 13 Issue: 1 Pages: 14609-14609

    • DOI

      10.1038/s41598-023-41770-6

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access

URL: 

Published: 2022-07-05   Modified: 2025-01-30  

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