Project/Area Number |
22K19380
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Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Review Section |
Medium-sized Section 47:Pharmaceutical sciences and related fields
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Research Institution | Okayama University |
Principal Investigator |
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Project Period (FY) |
2022-06-30 – 2024-03-31
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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Budget Amount *help |
¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2023: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
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Keywords | 一酸化窒素 / 酸化ストレス / エピゲノム / DNAメチル化 / トランスクリプトーム / 遺伝子発現 / 誘導遺伝子 / メチル化 / データベース |
Outline of Research at the Start |
NOによるエピジェネティクスを介した遺伝子発現をデータベース化することは初の試みである.さらに,細胞種間で共通に誘導される,あるいは,特異的に誘導されるものを同定することで,今後,病態サンプルを解析した際に,対象遺伝子のプロファイリングに貢献できると推定される.最終的には,NOによる遺伝子発現を比較・個別化を図ることで、エピゲノム変化が介在する疾患発症のメカニズム解明の一助を目指す.
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Outline of Final Research Achievements |
The aim of this study was to identify a group of genes epigenetically regulated by NO through changes in DNMT activity. We exposed various cultured cells to NO donor and identified a group of genes with altered expression levels. The results revealed that: 1) NO alters the expression patterns of genes that differ among cell lines, 2) genes whose expression changes due to NO are not enriched in common pathways among cell lines, and 3) many genes are involved in cancer development and malignant transformation. These results suggested that NO may promote cancer development and malignant transformation by inducing DNA demethylation and broadly altering the expression of genes that differ from cell to cell.
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Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
NOによって発現が変動する遺伝子の機能的なプロファイリングを行った.同定した発現変動遺伝子をそれぞれの由来組織の機能・がんに関与するかを文献やデータベースによって調査し,発現変動遺伝子と細胞株の由来組織との関連を推定した.その結果,各細胞株の由来組織の機能に関連した発現変動遺伝子はあまり得られず,がんの発症や悪性化に関わることが知られている遺伝子が多く発現上昇している傾向が見られた.以上の結果より,NOはその組織の機能に関与する変化を引き起こす可能性が低く,特定の遺伝子発現の変化を介したがんの発症や悪性化を促す可能性が示唆された.
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