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Membrane-less organelles and control of metabolic pathways

Research Project

Project/Area Number 22K19412
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 48:Biomedical structure and function and related fields
Research InstitutionNational Cancer Center Japan

Principal Investigator

Arakawa Hirofumi  国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 分野長 (70313088)

Project Period (FY) 2022-06-30 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Keywords相分離 / 液滴 / 非膜オルガネラ / ミトコンドリア / カルジオリピン / 酵素反応 / 代謝連続反応 / p53 / バイオサーファクタント / 界面 / 液-液相分離 / membrane-less organelles / がん抑制 / 代謝反応
Outline of Research at the Start

細胞における人為的代謝制御法の開発は人類の夢である。我々はMieapタンパク質がミトコンドリアに膜のないオルガネラ(Mieap液滴)を形成し、ミトコンドリアに特異的なリン脂質であるカルジオリピンの代謝反応(生合成とリモデリング)を区画化・促進している可能性を見出した。Mieap液滴はカルジオリピンの代謝を促進してミトコンドリアのエネルギー産生を上昇させ酸化ストレスを抑制することで健常なミトコンドリア機能を維持し老化や疾患の予防に重要である。本研究は、Mieap液滴による代謝連続反応制御のメカニズムを解明し、さらにそれを応用することで人為的代謝制御法を開発し、人類の健康長寿社会への貢献を目指す。

Outline of Final Research Achievements

Biomolecular condensates (BCs) are formed by proteins with intrinsically disordered regions (IDRs) via liquid-liquid phase separation.Here, we report that Mieap is an IDR-containing protein that drives formation of BCs involved in cardiolipin metabolism. Mieap BCs specifically phase separate the mitochondrial phospholipid, cardiolipin. Mieap directly binds to cardiolipin in vitro. Lipidomic analysis of cardiolipin suggests that Mieap promotes enzymatic reactions in cardiolipin biosynthesis and remodeling. Accordingly, four cardiolipin biosynthetic enzymes, TAMM41, PGS1, PTPMT1, and CRLS1, and two remodeling enzymes, PLA2G6 and TAZ, are phase-separated by Mieap BCs. Mieap-deficient cells exhibit altered crista structure, leading to decreased respiration activity and ATP production in mitochondria. These results suggest that Mieap may form membrane-less organelles to compartmentalize and facilitate cardiolipin metabolism, thus potentially contributing to mitochondrial quality control.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

古典的概念ではこれまで説明が難しかった代謝連続反応のメカニズムを液滴による代謝制御という全く新しい概念で解明することが可能になると期待される。細胞内の様々な生物活性の反応様式が、単なる教科書の図ではなく、リアリティーのある生物活性として説明可能になると期待される。Mieap液滴を応用することで、カルジオリピン代謝制御を介した全く新しいミトコンドリア健常性維持の手段を提供し、がん・認知症・老化などの予防や治療が可能になると期待され、広く人類の健康福祉に大きく貢献する可能性がある。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (17 results)

All 2024 2023 2022 Other

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 4 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 4 results) Book (3 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Mieap forms membrane-less organelles involved in cardiolipin metabolism2024

    • Author(s)
      Ikari Naoki、Honjo Katsuko、Sagami Yoko、Nakamura Yasuyuki、Arakawa Hirofumi
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 27 Issue: 2 Pages: 108916-108916

    • DOI

      10.1016/j.isci.2024.108916

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Recent advances and new perspectives in mitochondrial dysfunction2023

    • Author(s)
      Giulivi Cecilia、Zhang Kezhong、Arakawa Hirofumi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 13 Issue: 1 Pages: 7977-7977

    • DOI

      10.1038/s41598-023-34624-8

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Identification of a mitochondrial targeting sequence in cathepsin D and its localization in mitochondria2023

    • Author(s)
      Ikari Naoki、Arakawa Hirofumi
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 655 Pages: 25-34

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2023.03.016

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] MIEAP and ATG5 are tumor suppressors in a mouse model of BRAFV600E-positive thyroid cancer2022

    • Author(s)
      Hamada Koichiro、Kurashige Tomomi、Shimamura Mika、Arakawa Hirofumi、Nakamura Yasuyuki、Nagayama Yuji
    • Journal Title

      Frontiers in Endocrinology

      Volume: 13 Pages: 932754-932754

    • DOI

      10.3389/fendo.2022.932754

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Warburg effect as an anti-apoptotic strategy for cancer cells and membrane-less organelles involved in cardiolipin metabolism2023

    • Author(s)
      Hirofumi Arakawa
    • Organizer
      KSMRM(Korean Society for Mitochondrial Research and Medicine)2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] がんの細胞死回避戦略としてのワールブルグ効果とカルジオリピン代謝を制御するMieap液滴のがん抑制作用について2023

    • Author(s)
      荒川 博文
    • Organizer
      第31回日本Cell Death学会学術集会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Mieap液滴の生体内可視化:液滴はどのように腫瘍を抑制するか?2023

    • Author(s)
      中村 康之、荒川 博文
    • Organizer
      第82回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] がんとミトコンドリア2023

    • Author(s)
      荒川 博文
    • Organizer
      第7回ミトコンドリア病研究公開フォーラム
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Mieapが誘導する液滴とミトコンドリア制御2022

    • Author(s)
      荒川 博文
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Mieapは液滴を形成しカルジオリピン代謝を促進する2022

    • Author(s)
      碇 直樹、中村 康之、荒川 博文
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] p53-Mieap経路のがん抑制におけるカルジオリピン代謝の役割について2022

    • Author(s)
      碇 直樹、中村 康之、荒川 博文
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Mieap forms membraneless organelles to compartmentalize and facilitate cardiolipin metabolism2022

    • Author(s)
      Naoki Ikari, Yasuyuki Nakamura, Hirofumi Arakawa
    • Organizer
      AACR Annual Meeting 2022
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Book] Droplets of life, Chapter142022

    • Author(s)
      Hirofumi Arakawa
    • Total Pages
      16
    • Publisher
      Elsevier
    • ISBN
      9780128239674
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Book] 医学のあゆみ Vol.283 No.52022

    • Author(s)
      荒川 博文
    • Total Pages
      11
    • Publisher
      医歯薬出版
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Book] 細胞 Vol.54 No.82022

    • Author(s)
      碇 直樹、 荒川 博文
    • Total Pages
      5
    • Publisher
      ニューサイエンス
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Remarks] Dr. HIROFUMI ARAKAWA'S LABORATORY

    • URL

      https://hirofumi-arakawa-labo.jp/index.html

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      https://www.ncc.go.jp/jp/ri/division/cancer_biology/index.html

    • Related Report
      2022 Research-status Report

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Published: 2022-07-05   Modified: 2025-01-30  

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