| Project/Area Number |
22K19503
|
|---|
| Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
|
| Allocation Type | Multi-year Fund |
|---|
| Review Section |
Medium-sized Section 52:General internal medicine and related fields
|
|---|
| Research Institution | Chiba University |
|---|
Principal Investigator |
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
石毛 崇之 千葉大学, 医学部附属病院, 主任臨床検査技師 (30757315)
村田 正太 千葉大学, 医学部附属病院, 副臨床検査技師長 (30888144)
田中 知明 千葉大学, 大学院医学研究院, 教授 (50447299)
川崎 健治 千葉大学, 医学部附属病院, 臨床検査技師長 (50842902)
松下 一之 千葉大学, 医学部附属病院, 准教授 (90344994)
高田 護 千葉大学, 総合安全衛生管理機構, 助教 (90800392)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2022-06-30 – 2024-03-31
|
| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2024)
|
| Budget Amount *help |
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2023: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
|
|---|
| Keywords | 臨床検査 / 細菌検査 / 遺伝子検査 / 遺伝学的検査 / ロングリード / 長鎖DNA / DNAメチル化 / 臨床バイオーム |
|---|
| Outline of Research at the Start |
いわゆる NGS（次世代シーケンサー）の中でもlong-read seqneuncer (LRS)と呼ばれるタイプのシーケンサーを遺伝子検査に応用し、これまでにない臨床検査アプリケーション群を可能とするプラットフォームの開発を目指す研究である。
従来型NGSと異なったLRSならではの得られる情報を目的とした、臨床検査アプリケーション群とその共通プラットフォーム開発を本邦で行うことは、これまでのゲノム臨床検査体系が多く外資系企業・外国企業によって担われ資金と検体情報（多数の日本人のゲノム配列情報が当然に含まれる）が海外流出している実情を脱するには、欠かすことができない挑戦的研究であると考える。
|
| Outline of Final Research Achievements |
This study aims to develop a suite of genetic tests on a unified, long-read DNA analysis platform, with an emphasis on utilizing domestically developed technologies and reagents, including those stemming from the research team itself. However, shortly after the research period began, we were impacted by the acquisition of OriCiro, the Japanese company holding the proprietary RCR (Replication Cycle Reaction) technology, which was originally planned as a core component of our platform. This event made it difficult to procure the necessary reagents. In response, we explored alternative approaches using domestically available reagents as much as possible. As a result, we have successfully applied long-read DNA analysis to diagnose hereditary rare diseases that are difficult to confirm using conventional methods. Furthermore, we are continuing to develop long-read DNA testing systems for high-priority diseases and clinically significant pathogens, along with progressing in diagnostics.
|
| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
述べたようにモデルナ社によるオリシロ社買収劇の影響を本研究は受けたと見られる。しかしながら臨床検査・患者還元という面では成果を出しつつあり、進行中の内容を含めるとやはり当初の目的である「long-read seqneuncer (LRS)と呼ばれるタイプのシーケンサーを遺伝子検査に応用し、これまでにない臨床検査アプリケーション群を可能とするプラットフォームを開発する」ことに着実に向かうことはできたと考えている。
|
