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Researches on arseno-organic secondary metabolites produced by actinobacteria

Research Project

Project/Area Number 22K20566
Research Category

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section 0601:Agricultural chemistry and related fields
Research InstitutionGakushuin University (2023)
The University of Tokyo (2022)

Principal Investigator

Hoshino Shotaro  学習院大学, 理学部, 助教 (10962988)

Project Period (FY) 2022-08-31 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords有機ヒ素天然物 / 放線菌 / 二次代謝 / 生合成 / 単離構造決定 / メタボローム解析 / 有機ヒ素化合物 / 天然物
Outline of Research at the Start

微生物が生産するヒ素二次代謝産物は優れた生理活性を持つが、その生合成経路や構造多様性に対する知見は限定的である。最初に本研究では放線菌におけるヒ素二次代謝経路の立証を目的として、モデル放線菌Streptomyces lividans 66株が生産する構造未知の有機ヒ素化合物及びその推定生合成遺伝子クラスターに着目し、同株が生産する有機ヒ素化合物の構造決定と生合成経路の解明を目指す。続いて上記の生合成遺伝子に対するホモロジー検索とメタボロミクス解析手法を組み合わせ、更なるヒ素二次代謝産物生産放線菌の開拓及び新規ヒ素二次代謝産物の獲得を目指す。

Outline of Final Research Achievements

In this research, we initially attempted to elucidate the chemical structure of a structurally unknown organoarsenic metabolite (named bisenarsan) produced by Streptomyces lividans 66 (actinomycetes). Based on the preliminary structural analysis against trace purified material, we predicted the biosynthetic intermediate of bisenarsan and chemically synthesized it. By feeding the predicted biosynthetic intermediate into the culture medium, the production level of bisenarsan was significantly improved, enabling us to perform detailed structural analysis of bisenarsan and determine its chemical structure.
We also carried out gene disruption and genetic complementation of two enzyme genes and showed that they are involved in bisenarsan biosynthesis. These genes have previously been proposed to be implicated in bisenarsan biosynthesis and are widely distributed in the genomes of other actinomycetes.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

近年、微生物二次代謝によって生産される有機ヒ素化合物に優れた生理活性が見出された一方で、微生物ヒ素二次代謝に関する知見は依然乏しかった。本研究で化学構造が解明されたbisenarsanは放線菌二次代謝産物として同定された初の有機ヒ素化合物であった。すなわち、生理活性天然物の主要な生産者である放線菌において、ヒ素二次代謝経路の存在を実験的に立証された点で本研究は大きな学術的意義を持つ。
また、本研究でbisenarsan生合成への関与が立証された酵素遺伝子は他の放線菌ゲノムにも広く分布する事から、今後多様な代謝経路によって様々な生理活性を備えた有機ヒ素天然物の獲得に繋がることが期待される。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 4 results)

  • [Journal Article] A new 3,4-seco-isopimarane and three new isopimarane diterpenoids from Kaempferia champasakensis collected from Vietnam and their cytotoxic activities2024

    • Author(s)
      Do Kiep Minh、Hoshino Shotaro、Kodama Takeshi、Nguyen Hien Minh、Van Le Son、Ikumi Naotaka、Onaka Hiroyasu、Morita Hiroyuki
    • Journal Title

      Journal of Natural Medicines

      Volume: - Issue: 3 Pages: 537-546

    • DOI

      10.1007/s11418-024-01789-z

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] SolS-catalyzed sulfoxidation of labionin to solabionin drives antibacterial activity of solabiomycins2023

    • Author(s)
      Ijichi Shinta、Hoshino Shotaro、Asamizu Shumpei、Onaka Hiroyasu
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

      Volume: 89 Pages: 129323-129323

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2023.129323

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Insights into Arsenic Secondary Metabolism in Actinomycetes from the Structure and Biosynthesis of Bisenarsan2023

    • Author(s)
      Hoshino Shotaro、Ijichi Shinta、Asamizu Shumpei、Onaka Hiroyasu
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 145 Issue: 32 Pages: 17863-17871

    • DOI

      10.1021/jacs.3c04978

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 新規炭素-ヒ素結合形成反応を基盤とした未開拓天然物生合成経路の集積2024

    • Author(s)
      星野翔太郎
    • Organizer
      学術変革領域研究(A) 「予知生合成科学」 第3回公開シンポジウム
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 放線菌が拓く有機ヒ素天然物の世界2024

    • Author(s)
      星野翔太郎
    • Organizer
      日本薬学会第144年会 (横浜)
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 放線菌に分布する有機ヒ素二次代謝経路の開拓2023

    • Author(s)
      星野翔太郎, 浅水俊平, 尾仲宏康
    • Organizer
      2023年度(第37回)日本放線菌学会大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 新規C-As結合形成反応を基盤とした 放線菌ヒ素二次代謝経路の開拓2023

    • Author(s)
      星野翔太郎, 浅水俊平, 尾仲宏康
    • Organizer
      第65回天然有機化合物討論会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 放線菌における未利用二次代謝経路を活用した新規天然物の探索2023

    • Author(s)
      星野翔太郎
    • Organizer
      第24回 天然薬物の開発と応用シンポジウム
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 放線菌におけるヒ素二次代謝に関する研究2023

    • Author(s)
      星野翔太郎
    • Organizer
      日本農芸化学会 2023年度 関東支部例会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Actinomycetes expand the diversity of organoarsenic natural products2023

    • Author(s)
      Shotaro Hoshino, Shinta Ijichi, Shumpei Asamizu, Hiroyasu Onaka
    • Organizer
      2023 The 1st Taiwan-Japan Bilateral Symposium on Natural Products Biosynthesis
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 放線菌におけるヒ素二次代謝経路に関する研究2023

    • Author(s)
      星野 翔太郎、浅水 俊平、尾仲 宏康
    • Organizer
      日本農芸化学会 2023年度大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 放線菌が生産する有機ヒ素二次代謝産物に関する研究2022

    • Author(s)
      星野 翔太郎、浅水 俊平、尾仲 宏康
    • Organizer
      2022年度(第36回) 日本放線菌学会大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report

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Published: 2022-09-01   Modified: 2025-01-30  

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