| Project/Area Number |
22K20783
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
0901:Oncology and related fields
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| Research Institution | University of Tsukuba |
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Principal Investigator |
橋本 幸枝 筑波大学, 医学医療系, 講師 (70964063)
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| Project Period (FY) |
2022-08-31 – 2025-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
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| Keywords | 妊娠関連乳癌 / 遺伝子発現解析 / 体細胞変異解析 / 網羅的遺伝子解析 / シングルセルRNA-seq |
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| Outline of Research at the Start |
本研究では、妊娠関連乳癌の臨床・分子学的特徴を明らかに することを目的として、網羅的遺伝子解析(遺伝子発現解析・体細胞変異解析・シングルセ ルRNA-seq)を行う。これにより妊娠関連乳癌の病態解明や特異的な治療ターゲットの同定に至れば、妊娠関連乳癌の予後改善に繋がることが期待される。
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| Outline of Annual Research Achievements |
妊娠関連乳癌は予後不良な疾患であるが、妊娠関連乳癌の分子学的特徴に関して、過去にいくつか報告はあるものの総じてデータは少なく、特に日本人における 妊娠関連乳癌の遺伝子解析に関する報告は過去にはない。本研究の目的は網羅的遺伝子解析(遺伝子発現解析・体細胞変異解析・シングルセルRNA-seq等)を通し て妊娠関連乳癌の臨床・分子学的特徴を明らかにすることである。
本年度は筑波大学附属病院、および茨城県内の共同研究施設において診断・治療が行われた妊娠関連乳癌27例と、年齢および臨床的サブタイプをmatchさせた非妊娠関連乳癌27例について、nCounterによる遺伝子発現解析、および全エクソン解析を行った。現在データ解析中である。
新規発生の妊娠関連乳癌についても検体の収集を進めており、妊娠関連乳癌の検体を用いたシングルセルRNA-seq解析または空間的トランスクリプトーム解析を実施する予定である。当初シングルセルRNA-seqを施行 する予定であったが、癌組織のheterogeneityも考慮するとFFPE検体を用いた空間的トランスクリプトーム解析も検討され、現在実験環境の整備を行っている。 それらのデータとbulkの解析結果をまとめ、 妊娠関連乳癌の分子学的特徴を明らかにする。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
1年の休業期間があったため開始が遅れている。
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| Strategy for Future Research Activity |
現在、nCounterおよび全エクソン解析のデータを解析中でbulkのデータは揃いつつある。
シングルセルRNA-seqまたは空間トランスクリプトーム解析は条件検討中であり、年度内の実施・データ解析を目指している。
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