| Project/Area Number |
22K20908
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
0903:Organ-based internal medicine and related fields
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| Research Institution | Hokkaido University |
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Principal Investigator |
Iwasaki Sari 北海道大学, 医学研究院, 助教 (60455631)
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| Project Period (FY) |
2022-08-31 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
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| Keywords | 血栓性微小血管症 / 空間的トランスクリプトーム / 腎生検 / IgA腎症 / 血管内皮 / 腎病理 |
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| Outline of Research at the Start |
血栓性微小血管症（TMA）は、細血管障害性溶血性貧血、消費性血小板減少、細血管内血小板血栓を3主徴とする症候群の総称である。近年、高齢化や悪性腫瘍患者の増加に伴い、薬剤関連等の二次性TMAの頻度が増加している。病理組織像から病因の鑑別は困難であり、現在治療は対症療法が主体である。近年注目されている空間的transcriptome解析では、組織局所におけて位置情報を持った遺伝子発現パターンを網羅的に解析できる。この手法を用いて病理学的TMA症例の内皮細胞を取り巻く微小環境における網羅的遺伝子発現解析を行い、病因ごとの遺伝子発現パターンを明らかにしたい。
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| Outline of Final Research Achievements |
We performed spatial transcriptome analysis on renal biopsy tissue from cases of thrombotic microangiopathy (TMA) of various etiologies by using GeoMx platform.
First, 11 specimens were selected for preliminary experiments. Special slides with renal biopsy tissues were fluorescently stained, and the glomeruli were set as the regions of interest. Gene expression profiles obtained for each region of interest were quality-checked, normalized, and divided into two groups for cluster analysis, etc., to confirm that the data could be analyzed. Next, 2-3 cases each of (1) post-HSCT TMA, (2) drug-induced TMA, (3) collagen disease-related TMA, and (4) negative control among pathological TMA were selected for GeoMx. The obtained gene expression data are currently being analyzed.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
本研究では、様々な病因で発症する血栓性微小血管症（thrombotic microangiopathy: TMA）の症例について、腎生検組織を用いて、空間的transcriptome解析を行った。予備実験では、IgA腎症と非IgA腎症群とで、遺伝子発現profileに差異があることが見出され、異なるパスウェイが関与していることがわかった。現在、TMA症例についても同様の解析を進めている。本研究により、もし背景疾患によって、TMA組織の内皮細胞における遺伝子発現profileに差異が見出されるとすると、特異的な診断法や治療法の開発に大きく役立つことが期待されている。
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