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Identification of lncRNA associated with Liquid-Liquid Phase Separation in ALS

Research Project

Project/Area Number 22K21099
Research Category

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section 0908:Society medicine, nursing, and related fields
Research InstitutionKawasaki Medical School

Principal Investigator

yamasaki akira  川崎医科大学, 医学部, 助教 (70963354)

Project Period (FY) 2022-08-31 – 2025-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords筋萎縮性側索硬化症 / 液-液相分離 / lncRNA / iPS細胞由来運動神経細胞 / CRISPR/dCas13 / iPS細胞由来運動神経
Outline of Research at the Start

家族性筋萎縮性側索硬化症(ALS)患者の多くはRNA結合タンパク質をコードする遺伝子に変異をもつ。これらは複数のノンコーディングRNA(ncRNA)等と凝集し、液-液相分離と呼ばれる膜を持たない集合体を形成する。ALS患者由来の運動神経細胞では液-液相分離であるストレス顆粒が異常形成されるものの、関与するncRNAについては不明である。本研究では、ALSで発現量が変化しているncRNAをiPS細胞由来運動神経細胞でノックダウンし、ストレス顆粒の異常形成による細胞死抵抗性を指標にスクリーニングすることで、候補ncRNAを同定し、治療標的となるか検証する。

Outline of Final Research Achievements

Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a fatal motor neuron disease. In the motor neurons of ALS patients, abnormal aggregation formation and liquid-liquid phase separation (LLPS) are known to occur. Since the number of potential RNA sequences involved in LLPS is vast, developing an efficient screening method is crucial. In this study, we conducted a screening of approximately 30,000 candidate sequences using the CRISPR/dCas13 system in iPSC derived motor neurons.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

近年RNAを標的とした創薬技術は飛躍的に発展している。これらの核酸医薬の開発においてまずボトルネックとなるのが標的配列の抽出戦略である。本研究では、RNAの構造予測を基盤とした標的配列抽出技術と、CRISPR/dCas13を応用した大規模スクリーニング技術を組み合わせることで膨大な候補から効率よく配列を抽出できることを実証した。

Report

(4 results)
  • 2024 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2024 2023

All Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Presentation] Disease modeling using iPS cells derived motor neuron from Amyotrophic lateral sclerosis patient.2024

    • Author(s)
      Akira Yamasaki, Yurika Shimizu, Tatsuo Ito
    • Organizer
      第66回日本神経化学大会 第64回日本神経病理学会学術研究会 合同大会
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
  • [Presentation] RNA Targeted Drug Discovery Technology2024

    • Author(s)
      Tatsuo Ito, Akira Yamasaki
    • Organizer
      TIDES Asia: Oligonucleotide & Peptide Therapeutics
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] iPS細胞由来運動神経細胞におけるCRISPR/dCas13システムによるFUS局在の攪乱2024

    • Author(s)
      山崎晃
    • Organizer
      NEURO2024
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Disease modeling using iPS cells derived motor neuron from Amyotrophic lateral sclerosis patient.2023

    • Author(s)
      Akira Yamasaki, Yurika Shimizu, Tatsuo Ito
    • Organizer
      第64回日本神経化学大会 第64回日本神経病理学会学術研究会 合同大会
    • Related Report
      2023 Research-status Report

URL: 

Published: 2022-09-01   Modified: 2026-01-16  

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