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Genome-wide scan in genetically-improved tilapia: applications in water resources management in aquaculture

Research Project

Project/Area Number 22KF0282
Project/Area Number (Other) 22F22786 (2022)
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeMulti-year Fund (2023)
Single-year Grants (2022)
Section外国
Review Section Basic Section 64040:Social-ecological systems-related
Research InstitutionEhime University

Principal Investigator

渡辺 幸三  愛媛大学, 沿岸環境科学研究センター, 教授 (80634435)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) CRUZ KHRISTINA JUDAN  愛媛大学, 沿岸環境科学研究センター, 外国人特別研究員
Project Period (FY) 2023-03-08 – 2025-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
Fiscal Year 2024: ¥600,000 (Direct Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2022: ¥600,000 (Direct Cost: ¥600,000)
Keywordsティラピア / SNP / ゲノム / ゲノムスキャン / ddRAD / 養殖 / フィリピン
Outline of Research at the Start

フィリピン等の発展途上国では、繁殖力が高く現地に生息する淡水魚ティラピアは重要な養殖資源となっている。本研究では、5品種のティラピアからゲノム情報を収集し、体サイズ、成長速度、免疫力、ストレス耐性などの優良形質に寄与している遺伝子をゲノムから特定し、効率的な交雑試験に活用する情報基盤とする。多くの途上国の水産業を支えるティラピアの商品価値や生産性に関係する遺伝子が見つかれば、これまで膨大な時間を要していた交雑育種の効率化に貢献することが期待される。

Outline of Annual Research Achievements

フィリピンの養殖で活用されている遺伝的に改良されたハイブリッドティラピア個体群における一塩基多型(SNP)解析により、これらの個体群の生物学、エコロジー、適応に重要な役割を果たす複数の遺伝子機能と経路が特定された。これらの遺伝子は、形質変異や環境変化への適応性、生物的および非生物的ストレス要因への応答に影響を与えるメカニズムへの洞察を提供する。また、アノテーション解析により、ティラピアの健康、成長、養殖の持続可能性に重要な影響を与える遺伝子群がゲノム上でクラスターを形成していることが発見された。これらの遺伝的変異は、病気抵抗性、ストレス耐性、代謝効率を向上させ、ティラピアの性能と全体的な養殖成功を助長していると考えられる。
この研究の成果として、ティラピア養殖における系統選択を改善するために、成長速度、免疫機能、代謝効率に関連する特定の遺伝子群が特定されたことが挙げられる。これらの遺伝子をマーカーとすることで、成長の速いハイブリッドティラピア個体群をゲノム情報に基づいて選別できるようになるため、飼育期間の短縮や水や飼料といった重要な資源の節約が可能となる。さらに、病気に対する耐性が強化されたハイブリッドティラピア個体群は、メンテナンスコストや抗生物質の使用を削減することができる。このような遺伝的に改良されたティラピアのハイブリッドティラピア個体群から得られたゲノム配列は、養殖実践に対する潜在的な影響を示しており、改善された系統選択、遺伝的多様性を管理するための目標を定めた育種戦略、環境ストレス要因に対する耐性の強化に活用できる基盤情報となる。

Report

(3 results)
  • 2024 Annual Research Report
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2024 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] 中央ルソン州立大学/デラサール大学(フィリピン)

    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] 中央ルソン州立大学(フィリピン)

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Journal Article] Natural compound-induced downregulation of antimicrobial resistance and biofilm-linked genes in wastewater Aeromonas species2024

    • Author(s)
      Judan Cruz Khristina G.、Takumi Okamoto、Bongulto Kenneth A.、Gandalera Emmanuel E.、Kagia Ngure、Watanabe Kozo
    • Journal Title

      Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

      Volume: 14 Pages: 1456700-1456700

    • DOI

      10.3389/fcimb.2024.1456700

    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Genotyping of red tilapia strains in Central Luzon Philippines targeting ESR1 gene2024

    • Author(s)
      de Guia Arren Christian、Judan Cruz Khristina、Almuete Karl Danielle、Uy Mary Rose
    • Journal Title

      The Palawan Scientist

      Volume: 16 Issue: 1 Pages: 8-14

    • DOI

      10.69721/tps.j.2024.16.1.02

    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Genotyping of red tilapia strains in Central Luzon Philippines targeting ESR1 gene2024

    • Author(s)
      Almuete KDD and Uy MR de Guia ACM, Cruz KJ
    • Journal Title

      The Palawan Scientist

      Volume: 16 (1) Pages: 8-14

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Remarks] 愛媛大学沿岸環境科学研究センター分子生態・保健研究室HP

    • URL

      https://www.mecohlab.com/news/ehime-university-initiates-establishment-of-an-eu-satellite-office-at-central-luzon-state-university-philippines

    • Related Report
      2022 Annual Research Report

URL: 

Published: 2022-11-17   Modified: 2025-12-26  

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